RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000036229.12

Ctdp1-201, Transcript of RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ctdp1, Length 3,713 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Ints9Q8K114 658 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Cacnb1Q8R3Z5 597 aa16■□□□□ 0.15
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Parp2O88554 559 aa15.99■□□□□ 0.15
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Men1O88559 611 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Nol4P60954 483 aa15.99■□□□□ 0.15
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Dcaf17Q3TUL7 519 aa15.99■□□□□ 0.15
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Ccdc174Q3U155 467 aa15.99■□□□□ 0.15
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Ehmt1Q5DW34 1296 aa15.99■□□□□ 0.15
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Igf2bp2Q5SF07 592 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Man2a2Q8BRK9 1152 aa15.99■□□□□ 0.15
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Fermt2Q8CIB5 680 aa15.99■□□□□ 0.15
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Xpo6Q924Z6 1125 aa15.99■□□□□ 0.15
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Cfap57Q9D180 1249 aa15.99■□□□□ 0.15
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Chd4Q6PDQ2 1915 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Col1a2Q01149 1372 aa15.99■□□□□ 0.15
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Scgb2b11A0A087WR49 112 aa15.99■□□□□ 0.15
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Iqcj-Schip1A0A088MLT8 559 aa15.99■□□□□ 0.15
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Oip5A2AQ14 241 aa15.99■□□□□ 0.15
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Dennd3A2RT67 1274 aa15.99■□□□□ 0.15
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Wdr72D3YYM4 1114 aa15.99■□□□□ 0.15
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Gm6583E9Q8Z1 469 aa15.99■□□□□ 0.15
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Schip1P0DPB4 484 aa15.99■□□□□ 0.15
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Palb2Q3U0P1 1104 aa15.99■□□□□ 0.15
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Ppfia2Q8BSS9 1257 aa15.99■□□□□ 0.15
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Olfr805Q8VFI4 319 aa15.99■□□□□ 0.15
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Calr3Q9D9Q6 380 aa15.99■□□□□ 0.15
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Parp14Q2EMV9 1817 aa15.99■□□□□ 0.15
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Acsbg2Q2XU92 667 aa15.99■□□□□ 0.15
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Pacsin1Q61644 441 aa15.99■□□□□ 0.15
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Nlrp9bQ66X22 1003 aa15.99■□□□□ 0.15
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Asap2Q7SIG6 958 aa15.99■□□□□ 0.15
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Daam2Q80U19 1115 aa15.99■□□□□ 0.15
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Dzip1Q8BMD2 852 aa15.99■□□□□ 0.15
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Usp20Q8C6M1 916 aa15.99■□□□□ 0.15
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Pcdhb3Q91XZ7 784 aa15.99■□□□□ 0.15
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Cd274Q9EP73 290 aa15.99■□□□□ 0.15
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Jph2Q9ET78 696 aa15.99■□□□□ 0.15
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Card9A2AIV8 536 aa15.98■□□□□ 0.15
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Gm1604bQ3TRG0 118 aa15.98■□□□□ 0.15
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Kcnq5Q9JK45 933 aa15.98■□□□□ 0.15
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Ror2Q9Z138 944 aa15.98■□□□□ 0.15
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Slc39a2G3X943 309 aa15.98■□□□□ 0.15
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Guca2bO09051 106 aa15.98■□□□□ 0.15
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Hmgb1P63158 215 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 RalgdsQ03385 852 aa15.98■□□□□ 0.15
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 RelaQ04207 549 aa15.98■□□□□ 0.15
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Nlrp1aQ2LKU9 1182 aa15.98■□□□□ 0.15
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Ddx17Q501J6 650 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Ankle2Q6P1H6 964 aa15.98■□□□□ 0.15
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Fam160b2Q80YR2 744 aa15.98■□□□□ 0.15
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Cnpy3Q9DAU1 276 aa15.98■□□□□ 0.15
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 CcnjlQ5SRT8 387 aa15.98■□□□□ 0.15
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Shc3Q61120 474 aa15.98■□□□□ 0.15
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Ddx10Q80Y44 875 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Setdb2Q8C267 713 aa15.98■□□□□ 0.15
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Stn1Q8K2X3 378 aa15.98■□□□□ 0.15
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Tmem134Q8R0J4 195 aa15.98■□□□□ 0.15
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Cep19Q9CQA8 163 aa15.98■□□□□ 0.15
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Galntl5Q9D4M9 431 aa15.98■□□□□ 0.15
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 MeiocA2AG06 965 aa15.97■□□□□ 0.15
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Arhgap42B2RQE8 841 aa15.97■□□□□ 0.15
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Nfil3O08750 462 aa15.97■□□□□ 0.15
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Cdh15P33146 784 aa15.97■□□□□ 0.15
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 AarsQ8BGQ7 968 aa15.97■□□□□ 0.15
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Ttc22Q8C159 568 aa15.97■□□□□ 0.15
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 TkfcQ8VC30 578 aa15.97■□□□□ 0.15
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Dtnbp1Q91WZ8 352 aa15.97■□□□□ 0.15
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Wbp11Q923D5 641 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Tmed5Q9CXE7 229 aa15.97■□□□□ 0.15
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Syde2E9PUP1 1314 aa15.97■□□□□ 0.15
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Klc1O88447 541 aa15.97■□□□□ 0.15
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Zbtb7aO88939 569 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Ephb2P54763 986 aa15.97■□□□□ 0.15
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 SugctQ7TNE1 436 aa15.97■□□□□ 0.15
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Cyp26b1Q811W2 512 aa15.97■□□□□ 0.15
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Zfp449Q8CB76 518 aa15.97■□□□□ 0.15
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Galnt15Q9D2N8 638 aa15.97■□□□□ 0.15
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Rabl3Q9D4V7 236 aa15.97■□□□□ 0.15
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Rwdd2aQ9D9S3 292 aa15.97■□□□□ 0.15
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Trappc3O55013 180 aa15.97■□□□□ 0.15
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Swap70Q6A028 585 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Zbtb44Q8R0A2 453 aa15.97■□□□□ 0.15
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Ctage5Q8R311 779 aa15.97■□□□□ 0.15
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Tmem191cQ9JJB1 302 aa15.97■□□□□ 0.15
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Atp6v1g2Q9WTT4 118 aa15.97■□□□□ 0.15
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Serpinb6cW4VSP4 379 aa15.97■□□□□ 0.15
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Ift172Q6VH22 1749 aa15.97■□□□□ 0.15
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Xrcc5P27641 732 aa15.96■□□□□ 0.15
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Mtss1lQ6P9S0 715 aa15.96■□□□□ 0.15
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Ndst4Q9EQW8 872 aa15.96■□□□□ 0.15
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Rpf2Q9JJ80 306 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Cabp5Q9JLK3 173 aa15.96■□□□□ 0.15
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Npc1l1Q6T3U4 1333 aa15.96■□□□□ 0.15
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Cd44P15379 778 aa15.96■□□□□ 0.15
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Ccpg1Q640L3 753 aa15.96■□□□□ 0.15
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Efcab2Q9CQ46 164 aa15.96■□□□□ 0.15
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Cib2Q9Z309 187 aa15.96■□□□□ 0.15
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Krt78E9Q0F0 1068 aa15.96■□□□□ 0.15
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Nedd9O35177 833 aa15.96■□□□□ 0.15
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Nr5a1P33242 462 aa15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 25.8 ms