RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000008088.8

Ttc9b-201, Transcript of Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ttc9b, Length 2,052 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Nova2D3YVV7 556 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Tpp1O89023 562 aa22.03■■□□□ 1.12
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Mrps31Q61733 384 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Fbxo10Q7TQF2 950 aa22.03■■□□□ 1.12
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Rexo1Q7TT28 1213 aa22.03■■□□□ 1.12
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Spice1Q8C804 860 aa22.03■■□□□ 1.12
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Acat1Q8QZT1 424 aa22.03■■□□□ 1.12
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Josd2Q9CR30 188 aa22.03■■□□□ 1.12
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Egfl6Q9JJZ5 550 aa22.03■■□□□ 1.12
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ercc4Q9QZD4 917 aa22.03■■□□□ 1.12
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Cyp2c69E9PXC3 491 aa22.02■■□□□ 1.12
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 NefhP19246 1090 aa22.02■■□□□ 1.12
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 EmbP21995 330 aa22.02■■□□□ 1.12
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Cyp2c40P56657 491 aa22.02■■□□□ 1.12
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Meis1Q60954 390 aa22.02■■□□□ 1.12
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Grik5Q61626 979 aa22.02■■□□□ 1.12
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Zfp341Q6PGC9 846 aa22.02■■□□□ 1.12
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ccdc93Q7TQK5 629 aa22.02■■□□□ 1.12
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ercc6lQ8BHK9 1240 aa22.02■■□□□ 1.12
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Sap130Q8BIH0 1057 aa22.02■■□□□ 1.12
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Morc2bQ8C5W4 1022 aa22.02■■□□□ 1.12
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ccdc14Q8K2J4 934 aa22.02■■□□□ 1.12
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ddah1Q9CWS0 285 aa22.02■■□□□ 1.12
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 C87977A2A958 498 aa22.02■■□□□ 1.11
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Gm10378F6XQQ1 160 aa22.02■■□□□ 1.11
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Pstpip1P97814 415 aa22.02■■□□□ 1.11
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Vil1Q62468 827 aa22.02■■□□□ 1.11
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Znf280dQ68FE8 974 aa22.02■■□□□ 1.11
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Cd209bQ8CJ91 325 aa22.02■■□□□ 1.11
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Slc18a1Q8R090 521 aa22.02■■□□□ 1.11
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 RnmtQ9D0L8 465 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.11
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Eif2ak1Q9Z2R9 619 aa22.02■■□□□ 1.11
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Cacna1fQ9JIS7 1985 aa22.01■■□□□ 1.11
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Etnk2A7MCT6 385 aa22.01■■□□□ 1.11
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Pola2P33611 600 aa22.01■■□□□ 1.11
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Bace1P56818 501 aa22.01■■□□□ 1.11
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Nsun7Q14AW5 724 aa22.01■■□□□ 1.11
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Map9Q3TRR0 646 aa22.01■■□□□ 1.11
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Eif3j2Q66JS6 263 aa22.01■■□□□ 1.11
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Kiaa0754Q69ZZ9 979 aa22.01■■□□□ 1.11
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 P2ry10Q8BFU7 328 aa22.01■■□□□ 1.11
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Gprasp2Q8BUY8 826 aa22.01■■□□□ 1.11
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Defb15Q8R2I5 79 aa22.01■■□□□ 1.11
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Gys2Q8VCB3 704 aa22.01■■□□□ 1.11
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Apopt1Q9CQW7 192 aa22.01■■□□□ 1.11
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Pabpc6Q9D4E6 643 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 CsadQ9DBE0 493 aa22.01■■□□□ 1.11
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 BcamQ9R069 622 aa22.01■■□□□ 1.11
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Psmc6P62334 389 aa22■■□□□ 1.11
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 CnstQ8CBC4 711 aa22■■□□□ 1.11
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Phf20l1Q8CCJ9 1013 aa22■■□□□ 1.11
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Trappc12Q8K2L8 797 aa22■■□□□ 1.11
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Coa7Q921H9 231 aa22■■□□□ 1.11
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Haus2Q9CQS9 234 aa22■■□□□ 1.11
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 March8Q9DBD2 286 aa22■■□□□ 1.11
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Pagr1bF6V0H0 108 aa22■■□□□ 1.11
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 En2P09066 324 aa22■■□□□ 1.11
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Abcd1P48410 736 aa22■■□□□ 1.11
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ric8aQ3TIR3 530 aa22■■□□□ 1.11
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Zfp397Q7TNK4 527 aa22■■□□□ 1.11
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Pagr1aQ99L02 253 aa22■■□□□ 1.11
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 CutaQ9CQ89 177 aa22■■□□□ 1.11
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Scn3aA2ASI5 1947 aa22■■□□□ 1.11
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Glt1d1A4FUP9 346 aa21.99■■□□□ 1.11
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Orc4O88708 433 aa21.99■■□□□ 1.11
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Prl2c2P04095 224 aa21.99■■□□□ 1.11
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Tmem35bQ3U0Y2 150 aa21.99■■□□□ 1.11
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Zfp953Q3UPV7 304 aa21.99■■□□□ 1.11
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Pls1Q3V0K9 630 aa21.99■■□□□ 1.11
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Cracr2bQ80ZJ8 394 aa21.99■■□□□ 1.11
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ago4Q8CJF8 861 aa21.99■■□□□ 1.11
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Psmd2Q8VDM4 908 aa21.99■■□□□ 1.11
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Mrps5Q99N87 432 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Chrna9G3X8Z7 479 aa21.99■■□□□ 1.11
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Gng11P61953 73 aa21.99■■□□□ 1.11
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Kifap3P70188 793 aa21.99■■□□□ 1.11
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 GmpsQ3THK7 693 aa21.99■■□□□ 1.11
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Gprc5cQ8K3J9 440 aa21.99■■□□□ 1.11
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ces4aQ8R0W5 563 aa21.99■■□□□ 1.11
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Arhgef25Q9CWR0 618 aa21.99■■□□□ 1.11
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Creld2Q9CYA0 350 aa21.99■■□□□ 1.11
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Tubb4aQ9D6F9 444 aa21.99■■□□□ 1.11
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Tube1Q9D6T1 475 aa21.99■■□□□ 1.11
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Tjp3Q9QXY1 905 aa21.99■■□□□ 1.11
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Gm3095E9Q058 166 aa21.98■■□□□ 1.11
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Pip4k2aO70172 405 aa21.98■■□□□ 1.11
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Parp2O88554 559 aa21.98■■□□□ 1.11
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 SarsP26638 512 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Dnm2P39054 870 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Psmb7P70195 277 aa21.98■■□□□ 1.11
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 PtgdrP70263 357 aa21.98■■□□□ 1.11
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Lman1lQ8VCD3 505 aa21.98■■□□□ 1.11
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Lypla2Q9WTL7 231 aa21.98■■□□□ 1.11
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 NrapQ80XB4 1728 aa21.98■■□□□ 1.11
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Magea10A2AMW4 325 aa21.97■■□□□ 1.11
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Spocd1B1ASB6 936 aa21.97■■□□□ 1.11
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 D830030K20RikE9PYQ5 218 aa21.97■■□□□ 1.11
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Gm3043K7N693 218 aa21.97■■□□□ 1.11
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Gm16440K7N6G6 218 aa21.97■■□□□ 1.11
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Gm2244L7N2A3 218 aa21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 18.6 ms