RNA–Protein interactions for RNA: YOR156C

NFI1, Transcript of SUMO E3 ligase, yeast

Gene NFI1, Length 2,181 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NFI1	YOR156C	SRL1	Q08673	210 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NFI1	YOR156C	ISA2	Q12425	185 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NFI1	YOR156C	AFI1	Q99222	893 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NFI1	YOR156C	MES1	P00958	751 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
NFI1	YOR156C	REC107	P21651	314 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NFI1	YOR156C	YME2	P32843	850 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NFI1	YOR156C	PXA2	P34230	853 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NFI1	YOR156C	MIC60	P36112	540 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NFI1	YOR156C	KAP120	Q02932	1032 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NFI1	YOR156C	YLR352W	Q06479	807 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NFI1	YOR156C	SNA4	Q07549	140 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NFI1	YOR156C	YCR043C	P25361	127 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NFI1	YOR156C	PPZ1	P26570	692 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NFI1	YOR156C	ERG1	P32476	496 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
NFI1	YOR156C	YIR014W	P40570	242 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NFI1	YOR156C	SCD6	P45978	349 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.85	□□□□□ -1.63	not detected
NFI1	YOR156C	OCA1	P50946	238 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
NFI1	YOR156C	TDA7	P53882	636 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
NFI1	YOR156C	RBA50	Q04418	439 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NFI1	YOR156C	YLL032C	Q07834	825 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.85	□□□□□ -1.63	not detected
NFI1	YOR156C	RHO2	P06781	192 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NFI1	YOR156C	AMD1	P15274	810 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
NFI1	YOR156C	YCR007C	P25354	239 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NFI1	YOR156C	VPS17	P32913	551 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NFI1	YOR156C	ECM15	P35195	104 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NFI1	YOR156C	THI2	P38141	450 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NFI1	YOR156C	TES1	P41903	349 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
NFI1	YOR156C	SIL1	Q08199	421 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NFI1	YOR156C	CFT2	Q12102	859 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
NFI1	YOR156C	SPS4	P09937	338 aa		4.84	□□□□□ -1.64
NFI1	YOR156C	ATP10	P18496	279 aa		4.84	□□□□□ -1.64
NFI1	YOR156C	LRP1	P38801	184 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.64
NFI1	YOR156C	AFT2	Q08957	416 aa		4.84	□□□□□ -1.64
NFI1	YOR156C	KEL3	Q08979	651 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.64
NFI1	YOR156C	RKM5	Q12367	367 aa		4.84	□□□□□ -1.64
NFI1	YOR156C	GLK1	P17709	500 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
NFI1	YOR156C	ERV1	P27882	189 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NFI1	YOR156C	RPN2	P32565	945 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
NFI1	YOR156C	MET30	P39014	640 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NFI1	YOR156C	YND1	P40009	630 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NFI1	YOR156C	AZF1	P41696	914 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NFI1	YOR156C	TCB2	P48231	1178 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NFI1	YOR156C	YDR415C	Q04033	374 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
NFI1	YOR156C	IVY1	Q04934	453 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NFI1	YOR156C	DON1	Q05610	365 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NFI1	YOR156C	YEH2	Q07950	538 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NFI1	YOR156C	SNU66	Q12420	587 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
NFI1	YOR156C	GLN3	P18494	730 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NFI1	YOR156C	YTA12	P40341	825 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NFI1	YOR156C	YIL169C	P40442	995 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NFI1	YOR156C	GEX1	P25596	615 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NFI1	YOR156C	FUN19	P28003	413 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
NFI1	YOR156C	PIM1	P36775	1133 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NFI1	YOR156C	ZIM17	P42844	174 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NFI1	YOR156C	COS5	P47187	383 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NFI1	YOR156C	AIM32	Q04689	311 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NFI1	YOR156C	YLR281C	Q05863	155 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NFI1	YOR156C	SYO1	Q07395	620 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NFI1	YOR156C	COS7	Q07788	383 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NFI1	YOR156C	CSR2	Q12734	1121 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NFI1	YOR156C	RIP1	P08067	215 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NFI1	YOR156C	SEC62	P21825	274 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NFI1	YOR156C	VPS52	P39904	641 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NFI1	YOR156C	CAK1	P43568	368 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
NFI1	YOR156C	GPI1	P53306	609 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NFI1	YOR156C	SEC5	P89102	971 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NFI1	YOR156C	RRP45	Q05636	305 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
NFI1	YOR156C	GPH1	P06738	902 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
NFI1	YOR156C	CPR2	P23285	205 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NFI1	YOR156C	PRP21	P32524	280 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
NFI1	YOR156C	NIP100	P33420	868 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NFI1	YOR156C	FAU1	P40099	211 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NFI1	YOR156C	POP1	P41812	875 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NFI1	YOR156C	FMS1	P50264	508 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NFI1	YOR156C	FMP42	Q04991	504 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NFI1	YOR156C	SEC63	P14906	663 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NFI1	YOR156C	CDC23	P16522	626 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NFI1	YOR156C	FRE1	P32791	686 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NFI1	YOR156C	GYP6	P32806	458 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NFI1	YOR156C	PEX5	P35056	612 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NFI1	YOR156C	CCT2	P39076	527 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
NFI1	YOR156C	TFG2	P41896	400 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
NFI1	YOR156C	URB2	P47108	1174 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NFI1	YOR156C	MPS1	P54199	764 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NFI1	YOR156C	RLI1	Q03195	608 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
NFI1	YOR156C	SIP2	P34164	415 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
NFI1	YOR156C	RMD9	P53140	646 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
NFI1	YOR156C	YGL082W	P53155	381 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NFI1	YOR156C	NRT1	Q08485	598 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NFI1	YOR156C	BUB3	P26449	341 aa		4.79	□□□□□ -1.64
NFI1	YOR156C	SEC1	P30619	724 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
NFI1	YOR156C	TFB1	P32776	642 aa		4.79	□□□□□ -1.64
NFI1	YOR156C	ARA1	P38115	344 aa		4.79	□□□□□ -1.64
NFI1	YOR156C	NTC20	P38302	140 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
NFI1	YOR156C	RFC3	P38629	340 aa		4.79	□□□□□ -1.64
NFI1	YOR156C	YGL138C	P53122	345 aa		4.79	□□□□□ -1.64
NFI1	YOR156C	ART5	P53244	586 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
NFI1	YOR156C	SKO1	Q02100	647 aa		4.79	□□□□□ -1.64
NFI1	YOR156C	RPM2	Q02773	1202 aa		4.79	□□□□□ -1.64
NFI1	YOR156C	YDL009C	Q12210	107 aa		4.79	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 12.8 ms