RNA–Protein interactions for RNA: YLL017W

YLL017W, Transcript of Non-essential Ras guanine nucleotide exchange factor (GEF), yeast

Gene YLL017W, Length 312 nt, Biotype pseudogene.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YLL017W	YLL017W	SOV1	Q04748	898 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YLL017W	YLL017W	ROY1	Q04847	553 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YLL017W	YLL017W	GLO2	Q05584	274 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YLL017W	YLL017W	PPH22	P23595	377 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YLL017W	YLL017W	CLB1	P24868	471 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YLL017W	YLL017W	ACH1	P32316	526 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YLL017W	YLL017W	AFG1	P32317	509 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YLL017W	YLL017W	UTR4	P32626	227 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YLL017W	YLL017W	YME2	P32843	850 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YLL017W	YLL017W	ECM15	P35195	104 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YLL017W	YLL017W	PIM1	P36775	1133 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YLL017W	YLL017W	YER130C	P39959	443 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YLL017W	YLL017W	YMR147W	P40218	223 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YLL017W	YLL017W	MPP10	P47083	593 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YLL017W	YLL017W	URB2	P47108	1174 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YLL017W	YLL017W	FMS1	P50264	508 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YLL017W	YLL017W	YMR034C	Q05131	434 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YLL017W	YLL017W	DON1	Q05610	365 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YLL017W	YLL017W	PDH1	Q12428	516 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YLL017W	YLL017W	GPH1	P06738	902 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YLL017W	YLL017W	YIM1	P28625	365 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YLL017W	YLL017W	RPN2	P32565	945 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YLL017W	YLL017W	RAD24	P32641	659 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YLL017W	YLL017W	GYP6	P32806	458 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YLL017W	YLL017W	VPS17	P32913	551 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YLL017W	YLL017W	ARC40	P38328	384 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YLL017W	YLL017W	YIR014W	P40570	242 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YLL017W	YLL017W	YGL082W	P53155	381 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YLL017W	YLL017W	SMA1	Q02651	245 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YLL017W	YLL017W	RRP45	Q05636	305 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YLL017W	YLL017W	RGT2	Q12300	763 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YLL017W	YLL017W	AFI1	Q99222	893 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YLL017W	YLL017W	ATP11	P32453	318 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YLL017W	YLL017W	ERG1	P32476	496 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YLL017W	YLL017W	SWI3	P32591	825 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YLL017W	YLL017W	RRP3	P38712	501 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YLL017W	YLL017W	KEL1	P38853	1164 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YLL017W	YLL017W	RMD9	P53140	646 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YLL017W	YLL017W	TDA7	P53882	636 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YLL017W	YLL017W	SLD5	Q03406	294 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YLL017W	YLL017W	IVY1	Q04934	453 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YLL017W	YLL017W	BNA5	Q05979	453 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YLL017W	YLL017W	FMP45	Q07651	309 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YLL017W	YLL017W	YEH2	Q07950	538 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YLL017W	YLL017W	REV3	P14284	1504 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YLL017W	YLL017W	APE1	P14904	514 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YLL017W	YLL017W	HNM1	P19807	563 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YLL017W	YLL017W	NTC20	P38302	140 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YLL017W	YLL017W	OSH3	P38713	996 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YLL017W	YLL017W	SCD6	P45978	349 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.9	□□□□□ -1.63	not detected
YLL017W	YLL017W	COS5	P47187	383 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YLL017W	YLL017W	CUL3	P53202	744 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YLL017W	YLL017W	OGG1	P53397	376 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YLL017W	YLL017W	VPS9	P54787	451 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YLL017W	YLL017W	CIK1	Q01649	594 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YLL017W	YLL017W	SKO1	Q02100	647 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YLL017W	YLL017W	YPL068C	Q02749	293 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YLL017W	YLL017W	YDR415C	Q04033	374 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YLL017W	YLL017W	PHO92	Q06390	306 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YLL017W	YLL017W	COS7	Q07788	383 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YLL017W	YLL017W	SIL1	Q08199	421 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YLL017W	YLL017W	AFT2	Q08957	416 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YLL017W	YLL017W	KEL3	Q08979	651 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YLL017W	YLL017W	GLK1	P17709	500 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YLL017W	YLL017W	SEC62	P21825	274 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YLL017W	YLL017W	CPR2	P23285	205 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YLL017W	YLL017W	YCR043C	P25361	127 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YLL017W	YLL017W	YNK1	P36010	153 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YLL017W	YLL017W	LRP1	P38801	184 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YLL017W	YLL017W	SYG1	P40528	902 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YLL017W	YLL017W	AZF1	P41696	914 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YLL017W	YLL017W	TFG2	P41896	400 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YLL017W	YLL017W	CAK1	P43568	368 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YLL017W	YLL017W	YGL138C	P53122	345 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YLL017W	YLL017W	GPI1	P53306	609 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YLL017W	YLL017W	AIM32	Q04689	311 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YLL017W	YLL017W	SNA4	Q07549	140 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YLL017W	YLL017W	SRL1	Q08673	210 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YLL017W	YLL017W	CFT2	Q12102	859 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YLL017W	YLL017W	LSP1	Q12230	341 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YLL017W	YLL017W	RRD2	Q12461	358 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YLL017W	YLL017W	RIP1	P08067	215 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YLL017W	YLL017W	MDH1	P17505	334 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.88	□□□□□ -1.63	not detected
YLL017W	YLL017W	GLN3	P18494	730 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YLL017W	YLL017W	ATP10	P18496	279 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YLL017W	YLL017W	TFB1	P32776	642 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YLL017W	YLL017W	REC114	P32841	428 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YLL017W	YLL017W	ARA1	P38115	344 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YLL017W	YLL017W	YIL169C	P40442	995 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YLL017W	YLL017W	POP1	P41812	875 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YLL017W	YLL017W	TES1	P41903	349 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YLL017W	YLL017W	ZIM17	P42844	174 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YLL017W	YLL017W	TCB2	P48231	1178 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YLL017W	YLL017W	ART5	P53244	586 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YLL017W	YLL017W	YMR087W	Q04299	284 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YLL017W	YLL017W	RBA50	Q04418	439 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YLL017W	YLL017W	FMP42	Q04991	504 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YLL017W	YLL017W	MES1	P00958	751 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YLL017W	YLL017W	AMD1	P15274	810 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YLL017W	YLL017W	EXO70	P19658	623 aa		4.87	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 15.2 ms