RNA–Protein interactions for RNA: YKL163W

PIR3, Transcript of O-glycosylated covalently-bound cell wall protein, yeast

Gene PIR3, Length 978 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PIR3	YKL163W	RRT8	Q08219	342 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	UAF30	Q08747	228 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	AEP3	Q12089	606 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	ERP3	Q12403	225 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	RAD61	Q99359	647 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	NUM1	Q00402	2748 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	STE2	D6VTK4	431 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	CBP2	P03874	630 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	TPK2	P06245	380 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	SNA3	P14359	133 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	PDA1	P16387	420 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	VPS33	P20795	691 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	RNR1	P21524	888 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	CRM1	P30822	1084 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	NDI1	P32340	513 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	SPC110	P32380	944 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	DPH5	P32469	300 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	EFB1	P32471	206 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	DBP7	P36120	742 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	TCD1	P38756	429 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	YNG2	P38806	282 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	CRG1	P38892	291 aa	RIP-Chip data	4.1	□□□□□ -1.75	not detected
PIR3	YKL163W	SEC31	P38968	1273 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	CCT6	P39079	546 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	YJL206C	P39529	758 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	ALD5	P40047	520 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	YNL195C	P40168	261 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	ELO3	P40319	345 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	ALG5	P40350	334 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	YJL107C	P42947	387 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	RPA34	P47006	233 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	IRC8	P47046	822 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	URB2	P47108	1174 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	YGR149W	P48236	432 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	YDL183C	P48569	320 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	AZR1	P50080	613 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	MUP1	P50276	574 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	COS12	P53053	380 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	YGL138C	P53122	345 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	RMD9	P53140	646 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	TAM41	P53230	385 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	ASI2	P53895	289 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	SMA1	Q02651	245 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	INA17	Q02888	182 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	RSM28	Q03430	361 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	INP2	Q03824	705 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	FIN1	Q03898	291 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	ATC1	Q04005	294 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	YMR321C	Q04898	105 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	YFH1	Q07540	174 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	MED2	Q12124	431 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	NCB2	Q92317	146 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	YLR415C	O13578	112 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	TDH1	P00360	332 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	ARD1	P07347	238 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	MET3	P08536	511 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	MAS2	P11914	482 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	MSS116	P15424	664 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	VPS34	P22543	875 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	TKL1	P23254	680 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	DMC1	P25453	334 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	LRE1	P25579	583 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	URK1	P27515	501 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	PDB1	P32473	366 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	RML2	P32611	393 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	WBP1	P33767	430 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	MCR1	P36060	302 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	TCD2	P36101	447 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	GLG1	P36143	616 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	MNN9	P39107	395 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	SSO2	P39926	295 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	AIM10	P39965	576 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	YMR147W	P40218	223 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	LRO1	P40345	661 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	MAF1	P41910	395 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	YFR018C	P43599	363 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	CTK2	P46962	323 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	SMC3	P47037	1230 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	EMC2	P47133	292 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	YGR054W	P53235	642 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	MPP6	P53725	186 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	YNL143C	P53908	130 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	TIM44	Q01852	431 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	SKO1	Q02100	647 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	ABZ2	Q03266	374 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	HMO1	Q03973	246 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	ARG7	Q04728	441 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	RRP45	Q05636	305 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	STP3	Q05937	343 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	ADF1	Q2V2Q1	113 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PIR3	YKL163W	MF(ALPHA)1	P01149	165 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PIR3	YKL163W	ARO3	P14843	370 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
PIR3	YKL163W	SPO7	P18410	259 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PIR3	YKL163W	PDE1	P22434	369 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PIR3	YKL163W	BUD14	P27637	709 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PIR3	YKL163W	FAA1	P30624	700 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
PIR3	YKL163W	DSS4	P32601	143 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PIR3	YKL163W	ATP3	P38077	311 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
PIR3	YKL163W	EHT1	P38295	451 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PIR3	YKL163W	YHR112C	P38716	378 aa		4.08	□□□□□ -1.76

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