RNA–Protein interactions for RNA: YKL006C-A

SFT1, Transcript of Intra-Golgi v-SNARE, yeast

Gene SFT1, Length 294 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SFT1	YKL006C-A	KAR3	P17119	729 aa		3.05	□□□□□ -1.92
SFT1	YKL006C-A	YCR007C	P25354	239 aa		3.05	□□□□□ -1.92
SFT1	YKL006C-A	UTR4	P32626	227 aa		3.05	□□□□□ -1.92
SFT1	YKL006C-A	SHP1	P34223	423 aa		3.05	□□□□□ -1.92
SFT1	YKL006C-A	SEF1	P34228	1148 aa		3.05	□□□□□ -1.92
SFT1	YKL006C-A	PEX5	P35056	612 aa		3.05	□□□□□ -1.92
SFT1	YKL006C-A	SWH1	P35845	1188 aa		3.05	□□□□□ -1.92
SFT1	YKL006C-A	LSM5	P40089	93 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
SFT1	YKL006C-A	MKT1	P40850	830 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
SFT1	YKL006C-A	ELP2	P42935	788 aa		3.05	□□□□□ -1.92
SFT1	YKL006C-A	DUO1	P53168	247 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
SFT1	YKL006C-A	PHO92	Q06390	306 aa		3.05	□□□□□ -1.92
SFT1	YKL006C-A	HNT3	Q08702	217 aa		3.05	□□□□□ -1.92
SFT1	YKL006C-A	YOR365C	Q08844	703 aa		3.05	□□□□□ -1.92
SFT1	YKL006C-A	ARG3	P05150	338 aa		3.04	□□□□□ -1.92
SFT1	YKL006C-A	PEP4	P07267	405 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
SFT1	YKL006C-A	CKA1	P15790	372 aa		3.04	□□□□□ -1.92
SFT1	YKL006C-A	FUN19	P28003	413 aa	Predicted RBP	3.04	□□□□□ -1.92
SFT1	YKL006C-A	ERG3	P32353	365 aa		3.04	□□□□□ -1.92
SFT1	YKL006C-A	PXA2	P34230	853 aa		3.04	□□□□□ -1.92
SFT1	YKL006C-A	MUM2	P38236	366 aa		3.04	□□□□□ -1.92
SFT1	YKL006C-A	SRP72	P38688	640 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
SFT1	YKL006C-A	ALK1	P43633	760 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
SFT1	YKL006C-A	VID30	P53076	958 aa		3.04	□□□□□ -1.92
SFT1	YKL006C-A	GPI1	P53306	609 aa		3.04	□□□□□ -1.92
SFT1	YKL006C-A	VPS75	P53853	264 aa		3.04	□□□□□ -1.92
SFT1	YKL006C-A	MEH1	Q02205	184 aa		3.04	□□□□□ -1.92
SFT1	YKL006C-A	ERO1	Q03103	563 aa		3.04	□□□□□ -1.92
SFT1	YKL006C-A	RCF1	Q03713	159 aa		3.04	□□□□□ -1.92
SFT1	YKL006C-A	NOP58	Q12499	511 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
SFT1	YKL006C-A	YCL021W-A	Q96VH3	125 aa		3.04	□□□□□ -1.92
SFT1	YKL006C-A	SUC2	P00724	532 aa		3.03	□□□□□ -1.92
SFT1	YKL006C-A	GCN4	P03069	281 aa		3.03	□□□□□ -1.92
SFT1	YKL006C-A	MET17	P06106	444 aa		3.03	□□□□□ -1.92
SFT1	YKL006C-A	SEC53	P07283	254 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
SFT1	YKL006C-A	CPR1	P14832	162 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
SFT1	YKL006C-A	ROX1	P25042	368 aa		3.03	□□□□□ -1.92
SFT1	YKL006C-A	PAP1	P29468	568 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
SFT1	YKL006C-A	TIF3	P34167	436 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
SFT1	YKL006C-A	BYE1	P36106	594 aa		3.03	□□□□□ -1.92
SFT1	YKL006C-A	DUG2	P38149	878 aa		3.03	□□□□□ -1.92
SFT1	YKL006C-A	BNA4	P38169	460 aa		3.03	□□□□□ -1.92
SFT1	YKL006C-A	TCM62	P38228	572 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
SFT1	YKL006C-A	MSR1	P38714	643 aa		3.03	□□□□□ -1.92
SFT1	YKL006C-A	MRX6	P48564	524 aa		3.03	□□□□□ -1.92
SFT1	YKL006C-A	YML6	P51998	286 aa		3.03	□□□□□ -1.92
SFT1	YKL006C-A	SHE10	P53075	577 aa		3.03	□□□□□ -1.92
SFT1	YKL006C-A	DRN1	P53255	507 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
SFT1	YKL006C-A	ZPR1	P53303	486 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
SFT1	YKL006C-A	CTF3	Q12748	733 aa		3.03	□□□□□ -1.92
SFT1	YKL006C-A	PMR1	P13586	950 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SFT1	YKL006C-A	PDX1	P16451	410 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SFT1	YKL006C-A	TPM1	P17536	199 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
SFT1	YKL006C-A	LRP1	P38801	184 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
SFT1	YKL006C-A	UTP9	P38882	575 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
SFT1	YKL006C-A	HAT2	P39984	401 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SFT1	YKL006C-A	SPO22	P40511	975 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SFT1	YKL006C-A	YGR016W	P53209	190 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SFT1	YKL006C-A	MSO1	P53604	210 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
SFT1	YKL006C-A	NGL3	Q03210	505 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SFT1	YKL006C-A	ADD37	Q03233	198 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SFT1	YKL006C-A	YMR155W	Q03795	547 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SFT1	YKL006C-A	YDR131C	Q03899	556 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SFT1	YKL006C-A	COQ9	Q05779	260 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SFT1	YKL006C-A	YEH1	Q07804	573 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SFT1	YKL006C-A	RTN2	Q12443	393 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SFT1	YKL006C-A	SMC6	Q12749	1114 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SFT1	YKL006C-A	YPT6	Q99260	215 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SFT1	YKL006C-A	SPT7	P35177	1332 aa		3.01	□□□□□ -1.93
SFT1	YKL006C-A	LPD1	P09624	499 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
SFT1	YKL006C-A	NAT1	P12945	854 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
SFT1	YKL006C-A	PUT3	P25502	979 aa	Predicted RBP	3.01	□□□□□ -1.93
SFT1	YKL006C-A	LDB16	P25587	256 aa		3.01	□□□□□ -1.93
SFT1	YKL006C-A	CDC60	P26637	1090 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
SFT1	YKL006C-A	PEP3	P27801	918 aa		3.01	□□□□□ -1.93
SFT1	YKL006C-A	DEG1	P31115	442 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
SFT1	YKL006C-A	MRP4	P32902	394 aa		3.01	□□□□□ -1.93
SFT1	YKL006C-A	RSM22	P36056	628 aa		3.01	□□□□□ -1.93
SFT1	YKL006C-A	TIF4631	P39935	952 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
SFT1	YKL006C-A	ARF3	P40994	183 aa	RIP-Chip data	3.01	□□□□□ -1.93	not detected
SFT1	YKL006C-A	YFL067W	P43537	175 aa		3.01	□□□□□ -1.93
SFT1	YKL006C-A	GWT1	P47026	490 aa		3.01	□□□□□ -1.93
SFT1	YKL006C-A	IMD4	P50094	524 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
SFT1	YKL006C-A	RPT6	Q01939	405 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
SFT1	YKL006C-A	DAL5	P15365	543 aa		3	□□□□□ -1.93
SFT1	YKL006C-A	DBF4	P32325	704 aa		3	□□□□□ -1.93
SFT1	YKL006C-A	VPH1	P32563	840 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
SFT1	YKL006C-A	ANP1	P32629	500 aa		3	□□□□□ -1.93
SFT1	YKL006C-A	YME1	P32795	747 aa		3	□□□□□ -1.93
SFT1	YKL006C-A	MSN2	P33748	704 aa		3	□□□□□ -1.93
SFT1	YKL006C-A	MRPL4	P36517	319 aa		3	□□□□□ -1.93
SFT1	YKL006C-A	SRO77	P38163	1010 aa		3	□□□□□ -1.93
SFT1	YKL006C-A	NDT80	P38830	627 aa		3	□□□□□ -1.93
SFT1	YKL006C-A	FLC2	P39719	783 aa		3	□□□□□ -1.93
SFT1	YKL006C-A	PIR3	Q03180	325 aa		3	□□□□□ -1.93
SFT1	YKL006C-A	HEL2	Q05580	639 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
SFT1	YKL006C-A	YLR345W	Q06137	509 aa		3	□□□□□ -1.93
SFT1	YKL006C-A	CTI6	Q08923	506 aa		3	□□□□□ -1.93
SFT1	YKL006C-A	NMD4	Q12129	218 aa		3	□□□□□ -1.93
SFT1	YKL006C-A	SFI1	Q12369	946 aa		3	□□□□□ -1.93

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