RNA–Protein interactions for RNA: YDL105W

NSE4, Transcript of Component of the SMC5-SMC6 complex, yeastyeast

Gene NSE4, Length 1,209 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NSE4YDL105W YLL066CQ99208 1374 aa3.14□□□□□ -1.91
NSE4YDL105W SUC2P00724 532 aa3.14□□□□□ -1.91
NSE4YDL105W COR1P07256 457 aa3.14□□□□□ -1.91
NSE4YDL105W RPL31BP0C2H9 113 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
NSE4YDL105W ELO2P25358 347 aa3.14□□□□□ -1.91
NSE4YDL105W CMC1P36064 111 aa3.14□□□□□ -1.91
NSE4YDL105W MBB1P39534 108 aa3.14□□□□□ -1.91
NSE4YDL105W ELP2P42935 788 aa3.14□□□□□ -1.91
NSE4YDL105W IRC6P43615 237 aa3.14□□□□□ -1.91
NSE4YDL105W RTT101P47050 842 aa3.14□□□□□ -1.91
NSE4YDL105W YDL186WP48568 277 aa3.14□□□□□ -1.91
NSE4YDL105W DRN1P53255 507 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
NSE4YDL105W IRC15Q02733 499 aa3.14□□□□□ -1.91
NSE4YDL105W PDS5Q04264 1277 aa3.14□□□□□ -1.91
NSE4YDL105W HCR1Q05775 265 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
NSE4YDL105W VPS74Q06385 345 aa3.14□□□□□ -1.91
NSE4YDL105W PHO92Q06390 306 aa3.14□□□□□ -1.91
NSE4YDL105W SYO1Q07395 620 aa3.14□□□□□ -1.91
NSE4YDL105W YDL007C-AQ2V2Q0 85 aa3.14□□□□□ -1.91
NSE4YDL105W AMD1P15274 810 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
NSE4YDL105W CKA1P15790 372 aa3.13□□□□□ -1.91
NSE4YDL105W FRE1P32791 686 aa3.13□□□□□ -1.91
NSE4YDL105W LOS1P33418 1100 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
NSE4YDL105W MSN2P33748 704 aa3.13□□□□□ -1.91
NSE4YDL105W POP1P41812 875 aa3.13□□□□□ -1.91
NSE4YDL105W YJL132WP47014 750 aa3.13□□□□□ -1.91
NSE4YDL105W URB2P47108 1174 aa3.13□□□□□ -1.91
NSE4YDL105W MDM1Q01846 1127 aa3.13□□□□□ -1.91
NSE4YDL105W RLI1Q03195 608 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
NSE4YDL105W ERP1Q05359 219 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
NSE4YDL105W RBS1Q05672 457 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
NSE4YDL105W BNA5Q05979 453 aa3.13□□□□□ -1.91
NSE4YDL105W MRD1Q06106 887 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
NSE4YDL105W YLL056CQ12177 298 aa3.13□□□□□ -1.91
NSE4YDL105W SET6Q12529 373 aa3.13□□□□□ -1.91
NSE4YDL105W RPL15AP05748 204 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
NSE4YDL105W GDH1P07262 454 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
NSE4YDL105W GPI10P30777 616 aa3.12□□□□□ -1.91
NSE4YDL105W SPC110P32380 944 aa3.12□□□□□ -1.91
NSE4YDL105W PMT1P33775 817 aa3.12□□□□□ -1.91
NSE4YDL105W SWH1P35845 1188 aa3.12□□□□□ -1.91
NSE4YDL105W JNM1P36224 373 aa3.12□□□□□ -1.91
NSE4YDL105W CBP4P37267 147 aa3.12□□□□□ -1.91
NSE4YDL105W YBP1P38315 674 aa3.12□□□□□ -1.91
NSE4YDL105W OTU2P38747 307 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
NSE4YDL105W MET18P40469 1032 aa3.12□□□□□ -1.91
NSE4YDL105W HXT14P42833 540 aa3.12□□□□□ -1.91
NSE4YDL105W YPI1P43587 155 aa3.12□□□□□ -1.91
NSE4YDL105W ADD37Q03233 198 aa3.12□□□□□ -1.91
NSE4YDL105W CFT2Q12102 859 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
NSE4YDL105W MES1P00958 751 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
NSE4YDL105W MET17P06106 444 aa3.11□□□□□ -1.91
NSE4YDL105W CDC31P06704 161 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
NSE4YDL105W RPL20AP0CX23 172 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
NSE4YDL105W RPL20BP0CX24 172 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
NSE4YDL105W GLK1P17709 500 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
NSE4YDL105W MRPL4P36517 319 aa3.11□□□□□ -1.91
NSE4YDL105W MTC4P38335 694 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
NSE4YDL105W RPH1P39956 796 aa3.11□□□□□ -1.91
NSE4YDL105W SHO1P40073 367 aa3.11□□□□□ -1.91
NSE4YDL105W YJL213WP40896 331 aa3.11□□□□□ -1.91
NSE4YDL105W SPG5P42933 373 aa3.11□□□□□ -1.91
NSE4YDL105W YFR016CP43597 1233 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
NSE4YDL105W OCA1P50946 238 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
NSE4YDL105W YGL242CP53066 181 aa3.11□□□□□ -1.91
NSE4YDL105W JJJ1P53863 590 aa3.11□□□□□ -1.91
NSE4YDL105W RED1P14291 827 aa3.1□□□□□ -1.91
NSE4YDL105W ROX1P25042 368 aa3.1□□□□□ -1.91
NSE4YDL105W RAD14P28519 371 aa3.1□□□□□ -1.91
NSE4YDL105W MFT1P33441 392 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
NSE4YDL105W SEC66P33754 206 aa3.1□□□□□ -1.91
NSE4YDL105W RSM22P36056 628 aa3.1□□□□□ -1.91
NSE4YDL105W SMF1P38925 575 aa3.1□□□□□ -1.91
NSE4YDL105W ALG8P40351 577 aa3.1□□□□□ -1.91
NSE4YDL105W RPR2P40571 144 aa3.1□□□□□ -1.91
NSE4YDL105W SRB7P47822 140 aa3.1□□□□□ -1.91
NSE4YDL105W RQC1Q05468 723 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
NSE4YDL105W AYT1Q12226 474 aa3.1□□□□□ -1.91
NSE4YDL105W LEU4P06208 619 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
NSE4YDL105W RHO2P06781 192 aa3.09□□□□□ -1.91
NSE4YDL105W ATR1P13090 542 aa3.09□□□□□ -1.91
NSE4YDL105W LDB16P25587 256 aa3.09□□□□□ -1.91
NSE4YDL105W AFG1P32317 509 aa3.09□□□□□ -1.91
NSE4YDL105W TUL1P36096 758 aa3.09□□□□□ -1.91
NSE4YDL105W YGL108CP53139 140 aa3.09□□□□□ -1.91
NSE4YDL105W SLG1P54867 378 aa3.09□□□□□ -1.91
NSE4YDL105W GIR2Q03768 265 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
NSE4YDL105W TAF11Q04226 346 aa3.09□□□□□ -1.91
NSE4YDL105W YLR287CQ05881 355 aa3.09□□□□□ -1.91
NSE4YDL105W GRX6Q12438 231 aa3.09□□□□□ -1.91
NSE4YDL105W MCK1P21965 375 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
NSE4YDL105W SPB1P25582 841 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
NSE4YDL105W FUN19P28003 413 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
NSE4YDL105W ATP11P32453 318 aa3.08□□□□□ -1.92
NSE4YDL105W REC114P32841 428 aa3.08□□□□□ -1.92
NSE4YDL105W PMU1P36069 295 aa3.08□□□□□ -1.92
NSE4YDL105W GWT1P47026 490 aa3.08□□□□□ -1.92
NSE4YDL105W YGR149WP48236 432 aa3.08□□□□□ -1.92
NSE4YDL105W COS10P52924 374 aa3.08□□□□□ -1.92
NSE4YDL105W RMD9P53140 646 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 14.7 ms