RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 ORC4O43929 436 aa28.17■■■□□ 2.1
CAPNS1-216ENST00000628306 PURAQ00577 322 aaKnown RBP28.17■■■□□ 2.1
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CAPNS1-216ENST00000628306 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa28.17■■■□□ 2.1
CAPNS1-216ENST00000628306 DCAF4Q8WV16 495 aa28.17■■■□□ 2.1
CAPNS1-216ENST00000628306 CLEC4DQ8WXI8 215 aa28.17■■■□□ 2.1
CAPNS1-216ENST00000628306 CYP2C9P11712 490 aa28.16■■■□□ 2.1
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CAPNS1-216ENST00000628306 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa28.16■■■□□ 2.1
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa28.16■■■□□ 2.1
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CAPNS1-216ENST00000628306 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP28.11■■■□□ 2.09
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CAPNS1-216ENST00000628306 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa28.1■■■□□ 2.09
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CAPNS1-216ENST00000628306 KRT32Q14532 448 aa28.03■■■□□ 2.08
CAPNS1-216ENST00000628306 DNERQ8NFT8 737 aa28.03■■■□□ 2.08
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