RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592576.5

EFTUD2-223, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, human

TSL 2 BASIC

Gene EFTUD2, Length 3,364 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFTUD2-223	ENST00000592576	POLR3E	Q9NVU0	708 aa		10.43	□□□□□ -0.74
EFTUD2-223	ENST00000592576	RTEL1	Q9NZ71	1219 aa		10.43	□□□□□ -0.74
EFTUD2-223	ENST00000592576	CCNT1	O60563	726 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
EFTUD2-223	ENST00000592576	MCM7	P33993	719 aa		10.43	□□□□□ -0.74
EFTUD2-223	ENST00000592576	CNTN2	Q02246	1040 aa		10.43	□□□□□ -0.74
EFTUD2-223	ENST00000592576	PFAS	O15067	1338 aa		10.43	□□□□□ -0.74
EFTUD2-223	ENST00000592576	FCER1A	P12319	257 aa		10.43	□□□□□ -0.74
EFTUD2-223	ENST00000592576	NASP	P49321	788 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
EFTUD2-223	ENST00000592576	KCTD2	Q14681	263 aa		10.43	□□□□□ -0.74
EFTUD2-223	ENST00000592576	SPATA32	Q96LK8	384 aa		10.43	□□□□□ -0.74
EFTUD2-223	ENST00000592576	MMP19	Q99542	508 aa		10.43	□□□□□ -0.74
EFTUD2-223	ENST00000592576	SCAND2P	Q9GZW5	306 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
EFTUD2-223	ENST00000592576	MYH7B	A7E2Y1	1941 aa		10.43	□□□□□ -0.74
EFTUD2-223	ENST00000592576	MYH15	Q9Y2K3	1946 aa		10.43	□□□□□ -0.74
EFTUD2-223	ENST00000592576	TRPA1	O75762	1119 aa		10.42	□□□□□ -0.74
EFTUD2-223	ENST00000592576	TDP2	O95551	362 aa		10.42	□□□□□ -0.74
EFTUD2-223	ENST00000592576	PGK2	P07205	417 aa		10.42	□□□□□ -0.74
EFTUD2-223	ENST00000592576	EIF2AK2	P19525	551 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
EFTUD2-223	ENST00000592576	LINC00301	Q8NCQ3	95 aa		10.42	□□□□□ -0.74
EFTUD2-223	ENST00000592576	IL31RA	Q8NI17	732 aa		10.42	□□□□□ -0.74
EFTUD2-223	ENST00000592576	LEO1	Q8WVC0	666 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
EFTUD2-223	ENST00000592576	EIF4ENIF1	Q9NRA8	985 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
EFTUD2-223	ENST00000592576	RBBP6	Q7Z6E9	1792 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
EFTUD2-223	ENST00000592576	POTEB2	H3BUK9	544 aa		10.42	□□□□□ -0.74
EFTUD2-223	ENST00000592576	TBC1D8	O95759	1140 aa		10.42	□□□□□ -0.74
EFTUD2-223	ENST00000592576	USP11	P51784	963 aa		10.42	□□□□□ -0.74
EFTUD2-223	ENST00000592576	STK38	Q15208	465 aa		10.42	□□□□□ -0.74
EFTUD2-223	ENST00000592576	PTPA	Q15257	358 aa		10.42	□□□□□ -0.74
EFTUD2-223	ENST00000592576	DHX30	Q7L2E3	1194 aa	Known RBP eCLIP	10.42	□□□□□ -0.74
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZFP91	Q96JP5	570 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
EFTUD2-223	ENST00000592576	MAF1	Q9H063	256 aa		10.42	□□□□□ -0.74
EFTUD2-223	ENST00000592576	PXMP2	Q9NR77	195 aa		10.42	□□□□□ -0.74
EFTUD2-223	ENST00000592576	MRVI1	Q9Y6F6	885 aa		10.42	□□□□□ -0.74
EFTUD2-223	ENST00000592576	MAPK4	P31152	587 aa		10.42	□□□□□ -0.74
EFTUD2-223	ENST00000592576	ARHGEF16	Q5VV41	709 aa		10.42	□□□□□ -0.74
EFTUD2-223	ENST00000592576	GPR142	Q7Z601	462 aa		10.42	□□□□□ -0.74
EFTUD2-223	ENST00000592576	EHMT1	Q9H9B1	1298 aa		10.42	□□□□□ -0.74
EFTUD2-223	ENST00000592576	RCOR1	Q9UKL0	485 aa		10.42	□□□□□ -0.74
EFTUD2-223	ENST00000592576	DDX49	Q9Y6V7	483 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
EFTUD2-223	ENST00000592576	IVNS1ABP	Q9Y6Y0	642 aa		10.42	□□□□□ -0.74
EFTUD2-223	ENST00000592576	ASTN1	O14525	1302 aa		10.41	□□□□□ -0.74
EFTUD2-223	ENST00000592576	RPTOR	Q8N122	1335 aa		10.41	□□□□□ -0.74
EFTUD2-223	ENST00000592576	FAM86B1	E9PN63	330 aa		10.41	□□□□□ -0.74
EFTUD2-223	ENST00000592576	YEATS4	O95619	227 aa		10.41	□□□□□ -0.74
EFTUD2-223	ENST00000592576	FAM86B2	P0C5J1	330 aa		10.41	□□□□□ -0.74
EFTUD2-223	ENST00000592576	MARCKS	P29966	332 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
EFTUD2-223	ENST00000592576	PTGDR	Q13258	359 aa		10.41	□□□□□ -0.74
EFTUD2-223	ENST00000592576	SLC39A14	Q15043	492 aa		10.41	□□□□□ -0.74
EFTUD2-223	ENST00000592576	FAM133A	Q8N9E0	248 aa		10.41	□□□□□ -0.74
EFTUD2-223	ENST00000592576	CYP2W1	Q8TAV3	490 aa		10.41	□□□□□ -0.74
EFTUD2-223	ENST00000592576	NSUN6	Q8TEA1	469 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
EFTUD2-223	ENST00000592576	PDCD2L	Q9BRP1	358 aa		10.41	□□□□□ -0.74
EFTUD2-223	ENST00000592576	RNF186	Q9NXI6	227 aa		10.41	□□□□□ -0.74
EFTUD2-223	ENST00000592576	DNAJC25-GNG10	A0A024R161	153 aa		10.41	□□□□□ -0.74
EFTUD2-223	ENST00000592576	STRN	O43815	780 aa		10.41	□□□□□ -0.74
EFTUD2-223	ENST00000592576	SLC37A4	O43826	429 aa		10.41	□□□□□ -0.74
EFTUD2-223	ENST00000592576	PRPF40A	O75400	957 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
EFTUD2-223	ENST00000592576	ADORA2A	P29274	412 aa		10.41	□□□□□ -0.74
EFTUD2-223	ENST00000592576	MCM4	P33991	863 aa		10.41	□□□□□ -0.74
EFTUD2-223	ENST00000592576	PGM5	Q15124	567 aa		10.41	□□□□□ -0.74
EFTUD2-223	ENST00000592576	PPP4R3A	Q6IN85	833 aa		10.41	□□□□□ -0.74
EFTUD2-223	ENST00000592576	FRMPD4	Q14CM0	1322 aa		10.41	□□□□□ -0.74
EFTUD2-223	ENST00000592576	DOCK3	Q8IZD9	2030 aa		10.41	□□□□□ -0.74
EFTUD2-223	ENST00000592576	SPTLC2	O15270	562 aa		10.4	□□□□□ -0.74
EFTUD2-223	ENST00000592576	CYP3A4	P08684	503 aa		10.4	□□□□□ -0.74
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZNF76	P36508	570 aa		10.4	□□□□□ -0.74
EFTUD2-223	ENST00000592576	PLEKHH3	Q7Z736	793 aa		10.4	□□□□□ -0.74
EFTUD2-223	ENST00000592576	TMEM60	Q9H2L4	133 aa		10.4	□□□□□ -0.74
EFTUD2-223	ENST00000592576	DDX25	Q9UHL0	483 aa	Known RBP	10.4	□□□□□ -0.74
EFTUD2-223	ENST00000592576	CEP131	Q9UPN4	1083 aa		10.4	□□□□□ -0.74
EFTUD2-223	ENST00000592576	SOWAHB	A6NEL2	793 aa		10.4	□□□□□ -0.74
EFTUD2-223	ENST00000592576	NEMF	O60524	1076 aa		10.4	□□□□□ -0.74
EFTUD2-223	ENST00000592576	TPRN	Q4KMQ1	711 aa		10.4	□□□□□ -0.74
EFTUD2-223	ENST00000592576	POTED	Q86YR6	584 aa		10.4	□□□□□ -0.74
EFTUD2-223	ENST00000592576	ABRA	Q8N0Z2	381 aa		10.4	□□□□□ -0.74
EFTUD2-223	ENST00000592576	DNER	Q8NFT8	737 aa		10.4	□□□□□ -0.74
EFTUD2-223	ENST00000592576	KCNG4	Q8TDN1	519 aa		10.4	□□□□□ -0.74
EFTUD2-223	ENST00000592576	HTT	P42858	3142 aa		10.4	□□□□□ -0.74
EFTUD2-223	ENST00000592576	LCT	P09848	1927 aa		10.4	□□□□□ -0.75
EFTUD2-223	ENST00000592576	CYP3A7-CYP3A51P	A0A087WV96	503 aa		10.4	□□□□□ -0.75
EFTUD2-223	ENST00000592576	GOLGA6L22	H0YM25	854 aa		10.4	□□□□□ -0.75
EFTUD2-223	ENST00000592576	NR3C2	P08235	984 aa		10.4	□□□□□ -0.75
EFTUD2-223	ENST00000592576	MYCL	P12524	364 aa	Predicted RBP	10.4	□□□□□ -0.75
EFTUD2-223	ENST00000592576	GCFC2	P16383	781 aa	Known RBP	10.4	□□□□□ -0.75
EFTUD2-223	ENST00000592576	PTPRE	P23469	700 aa		10.4	□□□□□ -0.75
EFTUD2-223	ENST00000592576	CYP3A7	P24462	503 aa		10.4	□□□□□ -0.75
EFTUD2-223	ENST00000592576	CIITA	P33076	1130 aa		10.4	□□□□□ -0.75
EFTUD2-223	ENST00000592576	ME1	P48163	572 aa		10.4	□□□□□ -0.75
EFTUD2-223	ENST00000592576	MRPS9	P82933	396 aa	Known RBP	10.4	□□□□□ -0.75
EFTUD2-223	ENST00000592576	GRB14	Q14449	540 aa		10.4	□□□□□ -0.75
EFTUD2-223	ENST00000592576	PRR16	Q569H4	304 aa		10.4	□□□□□ -0.75
EFTUD2-223	ENST00000592576	PCNX4	Q63HM2	1172 aa		10.4	□□□□□ -0.75
EFTUD2-223	ENST00000592576	C4orf32	Q8N8J7	132 aa		10.4	□□□□□ -0.75
EFTUD2-223	ENST00000592576	FGD4	Q96M96	766 aa		10.4	□□□□□ -0.75
EFTUD2-223	ENST00000592576	COBL	O75128	1261 aa		10.39	□□□□□ -0.75
EFTUD2-223	ENST00000592576	BMP15	O95972	392 aa		10.39	□□□□□ -0.75
EFTUD2-223	ENST00000592576	ALDH5A1	P51649	535 aa	Predicted RBP	10.39	□□□□□ -0.75
EFTUD2-223	ENST00000592576	ATP2C1	P98194	919 aa	Predicted RBP	10.39	□□□□□ -0.75
EFTUD2-223	ENST00000592576	NFKBIB	Q15653	356 aa		10.39	□□□□□ -0.75
EFTUD2-223	ENST00000592576	CEP55	Q53EZ4	464 aa		10.39	□□□□□ -0.75

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.2 ms