RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590105.1

EFTUD2-216, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2

Gene EFTUD2, Length 427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-216ENST00000590105 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
EFTUD2-216ENST00000590105 CNNM1Q9NRU3 951 aa9.35□□□□□ -0.91
EFTUD2-216ENST00000590105 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
EFTUD2-216ENST00000590105 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa9.35□□□□□ -0.91
EFTUD2-216ENST00000590105 KIF16BQ96L93 1317 aa9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-216ENST00000590105 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-216ENST00000590105 PSMD14O00487 310 aa9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-216ENST00000590105 PLIN1O60240 522 aa9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-216ENST00000590105 TAF5LO75529 589 aa9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-216ENST00000590105 ASMTLO95671 621 aa9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-216ENST00000590105 GNAI3P08754 354 aa9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-216ENST00000590105 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-216ENST00000590105 GRNP28799 593 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-216ENST00000590105 KCNJ4P48050 445 aa9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-216ENST00000590105 RHBDL3P58872 404 aa9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-216ENST00000590105 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-216ENST00000590105 TYRO3Q06418 890 aa9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-216ENST00000590105 BIRC2Q13490 618 aa9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-216ENST00000590105 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-216ENST00000590105 LDHDQ86WU2 507 aa9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-216ENST00000590105 TICAM2Q86XR7 235 aa9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-216ENST00000590105 ANKRD44Q8N8A2 993 aa9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-216ENST00000590105 NEDD1Q8NHV4 660 aa9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-216ENST00000590105 TRERF1Q96PN7 1200 aa9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-216ENST00000590105 ZIC5Q96T25 663 aa9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-216ENST00000590105 SPOCK3Q9BQ16 436 aa9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-216ENST00000590105 COA1Q9GZY4 146 aa9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-216ENST00000590105 RBSNQ9H1K0 784 aa9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-216ENST00000590105 RUBCNLQ9H714 662 aa9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-216ENST00000590105 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-216ENST00000590105 DZANK1Q9NVP4 752 aa9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-216ENST00000590105 GPRC5DQ9NZD1 345 aa9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-216ENST00000590105 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-216ENST00000590105 SHISA8B8ZZ34 492 aa9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-216ENST00000590105 FBXO24O75426 580 aa9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-216ENST00000590105 CELA3AP09093 270 aa9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-216ENST00000590105 ITPKAP23677 461 aa9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-216ENST00000590105 RPS12P25398 132 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-216ENST00000590105 MCM4P33991 863 aa9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-216ENST00000590105 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-216ENST00000590105 EPHB1P54762 984 aa9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-216ENST00000590105 UBE4AQ14139 1066 aa9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-216ENST00000590105 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-216ENST00000590105 TM4SF20Q53R12 229 aa9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-216ENST00000590105 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-216ENST00000590105 AGBL3Q8NEM8 1001 aa9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-216ENST00000590105 CHAC2Q8WUX2 184 aa9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-216ENST00000590105 KLRG1Q96E93 195 aa9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-216ENST00000590105 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-216ENST00000590105 ENAMQ9NRM1 1142 aa9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-216ENST00000590105 LATS2Q9NRM7 1088 aa9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-216ENST00000590105 WDR90Q96KV7 1748 aa9.32□□□□□ -0.92
EFTUD2-216ENST00000590105 FAM221AA4D161 298 aa9.32□□□□□ -0.92
EFTUD2-216ENST00000590105 PHF20L1A8MW92 1017 aa9.32□□□□□ -0.92
EFTUD2-216ENST00000590105 ENC1O14682 589 aa9.32□□□□□ -0.92
EFTUD2-216ENST00000590105 TRIM27P14373 513 aa9.32□□□□□ -0.92
EFTUD2-216ENST00000590105 ATP4AP20648 1035 aa9.32□□□□□ -0.92
EFTUD2-216ENST00000590105 CNGA1P29973 690 aa9.32□□□□□ -0.92
EFTUD2-216ENST00000590105 MMP14P50281 582 aa9.32□□□□□ -0.92
EFTUD2-216ENST00000590105 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
EFTUD2-216ENST00000590105 TTLL5Q6EMB2 1281 aa9.32□□□□□ -0.92
EFTUD2-216ENST00000590105 TXNRD3Q86VQ6 643 aa9.32□□□□□ -0.92
EFTUD2-216ENST00000590105 CNTROBQ8N137 903 aa9.32□□□□□ -0.92
EFTUD2-216ENST00000590105 OR13H1Q8NG92 308 aa9.32□□□□□ -0.92
EFTUD2-216ENST00000590105 NINJ1Q92982 152 aa9.32□□□□□ -0.92
EFTUD2-216ENST00000590105 MFSD3Q96ES6 412 aa9.32□□□□□ -0.92
EFTUD2-216ENST00000590105 UBA5Q9GZZ9 404 aa9.32□□□□□ -0.92
EFTUD2-216ENST00000590105 TNKS2Q9H2K2 1166 aa9.32□□□□□ -0.92
EFTUD2-216ENST00000590105 CAAP1Q9H8G2 361 aa9.32□□□□□ -0.92
EFTUD2-216ENST00000590105 PGAP2Q9UHJ9 254 aa9.32□□□□□ -0.92
EFTUD2-216ENST00000590105 ZMYM5Q9UJ78 669 aa9.32□□□□□ -0.92
EFTUD2-216ENST00000590105 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
EFTUD2-216ENST00000590105 MYH3P11055 1940 aa9.31□□□□□ -0.92
EFTUD2-216ENST00000590105 C2CD2LO14523 706 aa9.31□□□□□ -0.92
EFTUD2-216ENST00000590105 OIP5O43482 229 aa9.31□□□□□ -0.92
EFTUD2-216ENST00000590105 GJB6O95452 261 aa9.31□□□□□ -0.92
EFTUD2-216ENST00000590105 F13A1P00488 732 aa9.31□□□□□ -0.92
EFTUD2-216ENST00000590105 STAT3P40763 770 aa9.31□□□□□ -0.92
EFTUD2-216ENST00000590105 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP9.31□□□□□ -0.92
EFTUD2-216ENST00000590105 TMEM67Q5HYA8 995 aa9.31□□□□□ -0.92
EFTUD2-216ENST00000590105 STRIP1Q5VSL9 837 aa9.31□□□□□ -0.92
EFTUD2-216ENST00000590105 FBXW10Q5XX13 1052 aa9.31□□□□□ -0.92
EFTUD2-216ENST00000590105 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
EFTUD2-216ENST00000590105 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa9.31□□□□□ -0.92
EFTUD2-216ENST00000590105 RPS6KC1Q96S38 1066 aa9.31□□□□□ -0.92
EFTUD2-216ENST00000590105 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa9.31□□□□□ -0.92
EFTUD2-216ENST00000590105 CD209Q9NNX6 404 aa9.31□□□□□ -0.92
EFTUD2-216ENST00000590105 SCN4AP35499 1836 aa9.31□□□□□ -0.92
EFTUD2-216ENST00000590105 MROH5Q6ZUA9 1318 aa9.31□□□□□ -0.92
EFTUD2-216ENST00000590105 MED23Q9ULK4 1368 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-216ENST00000590105 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-216ENST00000590105 SNAP23O00161 211 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-216ENST00000590105 EYA2O00167 538 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-216ENST00000590105 RFPL3O75679 317 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-216ENST00000590105 SASH1O94885 1247 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-216ENST00000590105 PDE8BO95263 885 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-216ENST00000590105 GNAI2P04899 355 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-216ENST00000590105 MSX1P28360 303 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-216ENST00000590105 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-216ENST00000590105 SOX5P35711 763 aa9.3□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18 ms