RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589631.5

GIPC1-211, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

TSL 3

Gene GIPC1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-211ENST00000589631 FAAP100Q0VG06 881 aa23.43■■□□□ 1.34
GIPC1-211ENST00000589631 PIGSQ96S52 555 aa23.43■■□□□ 1.34
GIPC1-211ENST00000589631 RMDN3Q96TC7 470 aa23.43■■□□□ 1.34
GIPC1-211ENST00000589631 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa23.43■■□□□ 1.34
GIPC1-211ENST00000589631 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
GIPC1-211ENST00000589631 CFBP00751 764 aa23.42■■□□□ 1.34
GIPC1-211ENST00000589631 PTGS1P23219 599 aa23.42■■□□□ 1.34
GIPC1-211ENST00000589631 KIF5BP33176 963 aa23.42■■□□□ 1.34
GIPC1-211ENST00000589631 TSGA10IPQ3SY00 556 aa23.42■■□□□ 1.34
GIPC1-211ENST00000589631 CXCL17Q6UXB2 119 aa23.42■■□□□ 1.34
GIPC1-211ENST00000589631 HOMER1Q86YM7 354 aa23.42■■□□□ 1.34
GIPC1-211ENST00000589631 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
GIPC1-211ENST00000589631 BADQ92934 168 aa23.42■■□□□ 1.34
GIPC1-211ENST00000589631 TMEM39AQ9NV64 488 aa23.42■■□□□ 1.34
GIPC1-211ENST00000589631 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
GIPC1-211ENST00000589631 NEFLP07196 543 aa23.41■■□□□ 1.34
GIPC1-211ENST00000589631 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
GIPC1-211ENST00000589631 PPP2R5BQ15173 497 aa23.41■■□□□ 1.34
GIPC1-211ENST00000589631 STXBP2Q15833 593 aa23.41■■□□□ 1.34
GIPC1-211ENST00000589631 SLC43A3Q8NBI5 491 aa23.41■■□□□ 1.34
GIPC1-211ENST00000589631 LZTS2Q9BRK4 669 aa23.41■■□□□ 1.34
GIPC1-211ENST00000589631 CCDC69A6NI79 296 aa23.4■■□□□ 1.34
GIPC1-211ENST00000589631 CALM1P0DP23 149 aa23.4■■□□□ 1.34
GIPC1-211ENST00000589631 CALM2P0DP24 149 aa23.4■■□□□ 1.34
GIPC1-211ENST00000589631 CALM3P0DP25 149 aa23.4■■□□□ 1.34
GIPC1-211ENST00000589631 RAG1P15918 1043 aa23.4■■□□□ 1.34
GIPC1-211ENST00000589631 GNAQP50148 359 aa23.4■■□□□ 1.34
GIPC1-211ENST00000589631 CPT1AP50416 773 aa23.4■■□□□ 1.34
GIPC1-211ENST00000589631 TTLL4Q14679 1199 aa23.4■■□□□ 1.34
GIPC1-211ENST00000589631 ARHGEF16Q5VV41 709 aa23.4■■□□□ 1.34
GIPC1-211ENST00000589631 NFXL1Q6ZNB6 911 aa23.4■■□□□ 1.34
GIPC1-211ENST00000589631 SPZ1Q9BXG8 430 aa23.4■■□□□ 1.34
GIPC1-211ENST00000589631 TXNP10599 105 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
GIPC1-211ENST00000589631 ITGB8P26012 769 aa23.39■■□□□ 1.33
GIPC1-211ENST00000589631 GPR153Q6NV75 609 aa23.39■■□□□ 1.33
GIPC1-211ENST00000589631 FAM126BQ8IXS8 530 aa23.39■■□□□ 1.33
GIPC1-211ENST00000589631 OR6J1Q8NGC5 347 aa23.39■■□□□ 1.33
GIPC1-211ENST00000589631 NEK1Q96PY6 1258 aa23.39■■□□□ 1.33
GIPC1-211ENST00000589631 MYL10Q9BUA6 226 aa23.39■■□□□ 1.33
GIPC1-211ENST00000589631 PXMP2Q9NR77 195 aa23.39■■□□□ 1.33
GIPC1-211ENST00000589631 POLR3EQ9NVU0 708 aa23.39■■□□□ 1.33
GIPC1-211ENST00000589631 TLR3O15455 904 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
GIPC1-211ENST00000589631 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
GIPC1-211ENST00000589631 NR3C2P08235 984 aa23.38■■□□□ 1.33
GIPC1-211ENST00000589631 ITGA7Q13683 1181 aa23.38■■□□□ 1.33
GIPC1-211ENST00000589631 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
GIPC1-211ENST00000589631 CCDC62Q6P9F0 684 aa23.38■■□□□ 1.33
GIPC1-211ENST00000589631 SGMS1Q86VZ5 419 aa23.38■■□□□ 1.33
GIPC1-211ENST00000589631 LRCH3Q96II8 777 aa23.38■■□□□ 1.33
GIPC1-211ENST00000589631 TBX21Q9UL17 535 aa23.38■■□□□ 1.33
GIPC1-211ENST00000589631 GRIN2DO15399 1336 aa23.37■■□□□ 1.33
GIPC1-211ENST00000589631 A6NJR5 290 aa23.37■■□□□ 1.33
GIPC1-211ENST00000589631 CD4P01730 458 aa23.37■■□□□ 1.33
GIPC1-211ENST00000589631 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
GIPC1-211ENST00000589631 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
GIPC1-211ENST00000589631 SLC12A7Q9Y666 1083 aa23.37■■□□□ 1.33
GIPC1-211ENST00000589631 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
GIPC1-211ENST00000589631 KPNA6O60684 536 aa23.36■■□□□ 1.33
GIPC1-211ENST00000589631 ARIH2O95376 493 aa23.36■■□□□ 1.33
GIPC1-211ENST00000589631 TIMP1P01033 207 aa23.36■■□□□ 1.33
GIPC1-211ENST00000589631 POLR2MP0CAP2 368 aa23.36■■□□□ 1.33
GIPC1-211ENST00000589631 PURAQ00577 322 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
GIPC1-211ENST00000589631 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
GIPC1-211ENST00000589631 KRT32Q14532 448 aa23.36■■□□□ 1.33
GIPC1-211ENST00000589631 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
GIPC1-211ENST00000589631 RASEFQ8IZ41 740 aa23.36■■□□□ 1.33
GIPC1-211ENST00000589631 PDCD2LQ9BRP1 358 aa23.36■■□□□ 1.33
GIPC1-211ENST00000589631 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
GIPC1-211ENST00000589631 SHHQ15465 462 aa23.35■■□□□ 1.33
GIPC1-211ENST00000589631 SEPT14Q6ZU15 432 aa23.35■■□□□ 1.33
GIPC1-211ENST00000589631 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
GIPC1-211ENST00000589631 COPS5Q92905 334 aa23.35■■□□□ 1.33
GIPC1-211ENST00000589631 LRRC2Q9BYS8 371 aa23.35■■□□□ 1.33
GIPC1-211ENST00000589631 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa23.34■■□□□ 1.33
GIPC1-211ENST00000589631 MYH7BA7E2Y1 1941 aa23.34■■□□□ 1.33
GIPC1-211ENST00000589631 FPGSQ05932 587 aa23.34■■□□□ 1.33
GIPC1-211ENST00000589631 VSIG10LQ86VR7 867 aa23.34■■□□□ 1.33
GIPC1-211ENST00000589631 FANCBQ8NB91 859 aa23.34■■□□□ 1.33
GIPC1-211ENST00000589631 KCNB2Q92953 911 aa23.34■■□□□ 1.33
GIPC1-211ENST00000589631 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
GIPC1-211ENST00000589631 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
GIPC1-211ENST00000589631 PLEKHA8P1O95397 391 aa23.33■■□□□ 1.33
GIPC1-211ENST00000589631 GH1P01241 217 aa23.33■■□□□ 1.33
GIPC1-211ENST00000589631 MYL3P08590 195 aa23.33■■□□□ 1.33
GIPC1-211ENST00000589631 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
GIPC1-211ENST00000589631 PSMC6P62333 389 aa23.33■■□□□ 1.33
GIPC1-211ENST00000589631 PGM5Q15124 567 aa23.33■■□□□ 1.33
GIPC1-211ENST00000589631 LY6KQ17RY6 165 aa23.33■■□□□ 1.33
GIPC1-211ENST00000589631 ADCK5Q3MIX3 580 aa23.33■■□□□ 1.33
GIPC1-211ENST00000589631 MFSD5Q6N075 450 aa23.33■■□□□ 1.33
GIPC1-211ENST00000589631 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa23.33■■□□□ 1.33
GIPC1-211ENST00000589631 PIBF1Q8WXW3 757 aa23.33■■□□□ 1.33
GIPC1-211ENST00000589631 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
GIPC1-211ENST00000589631 LAMA3Q16787 3333 aa23.32■■□□□ 1.32
GIPC1-211ENST00000589631 RXRAP19793 462 aa23.32■■□□□ 1.32
GIPC1-211ENST00000589631 C9orf50Q5SZB4 431 aa23.32■■□□□ 1.32
GIPC1-211ENST00000589631 ERICH6BQ5W0A0 696 aa23.32■■□□□ 1.32
GIPC1-211ENST00000589631 KCNV1Q6PIU1 500 aa23.32■■□□□ 1.32
GIPC1-211ENST00000589631 SZT2Q5T011 3432 aa23.31■■□□□ 1.32
GIPC1-211ENST00000589631 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34 ms