RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588815.5

CAPNS1-206, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-206ENST00000588815 LONP1P36776 959 aaKnown RBP35.19■■■■□ 3.22
CAPNS1-206ENST00000588815 CCDC183Q5T5S1 534 aa35.19■■■■□ 3.22
CAPNS1-206ENST00000588815 RASAL3Q86YV0 1011 aa35.19■■■■□ 3.22
CAPNS1-206ENST00000588815 ENGASEQ8NFI3 743 aa35.19■■■■□ 3.22
CAPNS1-206ENST00000588815 HHIPL1Q96JK4 782 aa35.19■■■■□ 3.22
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM13BQ9NYF5 915 aa35.19■■■■□ 3.22
CAPNS1-206ENST00000588815 BTBD7Q9P203 1132 aa35.19■■■■□ 3.22
CAPNS1-206ENST00000588815 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP35.19■■■■□ 3.22
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC25A27O95847 323 aa35.18■■■■□ 3.22
CAPNS1-206ENST00000588815 RPS6P62753 249 aaKnown RBP35.18■■■■□ 3.22
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM60Q9H2L4 133 aa35.18■■■■□ 3.22
CAPNS1-206ENST00000588815 MRVI1Q9Y6F6 885 aa35.18■■■■□ 3.22
CAPNS1-206ENST00000588815 FRMPD4Q14CM0 1322 aa35.18■■■■□ 3.22
CAPNS1-206ENST00000588815 RPTORQ8N122 1335 aa35.18■■■■□ 3.22
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP35.18■■■■□ 3.22
CAPNS1-206ENST00000588815 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP35.17■■■■□ 3.22
CAPNS1-206ENST00000588815 BTBD19C9JJ37 291 aa35.17■■■■□ 3.22
CAPNS1-206ENST00000588815 TDP2O95551 362 aa35.17■■■■□ 3.22
CAPNS1-206ENST00000588815 CALCRLQ16602 461 aa35.17■■■■□ 3.22
CAPNS1-206ENST00000588815 POTEEQ6S8J3 1075 aa35.17■■■■□ 3.22
CAPNS1-206ENST00000588815 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP35.17■■■■□ 3.22
CAPNS1-206ENST00000588815 CSRNP2Q9H175 543 aa35.17■■■■□ 3.22
CAPNS1-206ENST00000588815 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa35.17■■■■□ 3.22
CAPNS1-206ENST00000588815 DACT1Q9NYF0 836 aa35.17■■■■□ 3.22
CAPNS1-206ENST00000588815 HPSEQ9Y251 543 aa35.17■■■■□ 3.22
CAPNS1-206ENST00000588815 LCTP09848 1927 aa35.16■■■■□ 3.22
CAPNS1-206ENST00000588815 VWA3AA6NCI4 1184 aa35.16■■■■□ 3.22
CAPNS1-206ENST00000588815 PDHXO00330 501 aa35.16■■■■□ 3.22
CAPNS1-206ENST00000588815 NR1I2O75469 434 aa35.16■■■■□ 3.22
CAPNS1-206ENST00000588815 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP35.16■■■■□ 3.22
CAPNS1-206ENST00000588815 FSTL1Q12841 308 aa35.16■■■■□ 3.22
CAPNS1-206ENST00000588815 Q4G0T1 1027 aa35.16■■■■□ 3.22
CAPNS1-206ENST00000588815 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP35.16■■■■□ 3.22
CAPNS1-206ENST00000588815 MTMR9Q96QG7 549 aa35.16■■■■□ 3.22
CAPNS1-206ENST00000588815 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP35.16■■■■□ 3.22
CAPNS1-206ENST00000588815 A0A1B0GVL5 298 aa35.16■■■■□ 3.22
CAPNS1-206ENST00000588815 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP35.16■■■■□ 3.22
CAPNS1-206ENST00000588815 NSMFQ6X4W1 530 aa35.16■■■■□ 3.22
CAPNS1-206ENST00000588815 POTEDQ86YR6 584 aa35.16■■■■□ 3.22
CAPNS1-206ENST00000588815 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP35.16■■■■□ 3.22
CAPNS1-206ENST00000588815 TBX3O15119 743 aa35.15■■■■□ 3.22
CAPNS1-206ENST00000588815 CNMDO75829 334 aa35.15■■■■□ 3.22
CAPNS1-206ENST00000588815 PFKFB1P16118 471 aa35.15■■■■□ 3.22
CAPNS1-206ENST00000588815 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP35.15■■■■□ 3.22
CAPNS1-206ENST00000588815 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP35.15■■■■□ 3.22
CAPNS1-206ENST00000588815 AK8Q96MA6 479 aa35.15■■■■□ 3.22
CAPNS1-206ENST00000588815 RBPJLQ9UBG7 517 aa35.15■■■■□ 3.22
CAPNS1-206ENST00000588815 PFASO15067 1338 aa35.14■■■■□ 3.22
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM88BA6NKF7 163 aa35.14■■■■□ 3.22
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC37A4O43826 429 aa35.14■■■■□ 3.22
CAPNS1-206ENST00000588815 KINO60870 393 aaKnown RBP35.14■■■■□ 3.22
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC10A3P09131 477 aa35.14■■■■□ 3.22
CAPNS1-206ENST00000588815 NDUFA8P51970 172 aa35.14■■■■□ 3.22
CAPNS1-206ENST00000588815 INHBEP58166 350 aa35.14■■■■□ 3.22
CAPNS1-206ENST00000588815 GRIN1Q05586 938 aa35.14■■■■□ 3.22
CAPNS1-206ENST00000588815 CCDC102AQ96A19 550 aa35.14■■■■□ 3.22
CAPNS1-206ENST00000588815 PAGR1Q9BTK6 254 aa35.14■■■■□ 3.22
CAPNS1-206ENST00000588815 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP35.13■■■■□ 3.21
CAPNS1-206ENST00000588815 NUP62CLQ9H1M0 184 aa35.13■■■■□ 3.21
CAPNS1-206ENST00000588815 COL20A1Q9P218 1284 aa35.13■■■■□ 3.21
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF76P36508 570 aa35.12■■■■□ 3.21
CAPNS1-206ENST00000588815 SYKP43405 635 aa35.12■■■■□ 3.21
CAPNS1-206ENST00000588815 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP35.12■■■■□ 3.21
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM266Q2M3C6 531 aa35.12■■■■□ 3.21
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC30A10Q6XR72 485 aa35.12■■■■□ 3.21
CAPNS1-206ENST00000588815 SLFN12Q8IYM2 578 aa35.12■■■■□ 3.21
CAPNS1-206ENST00000588815 TIGD1Q96MW7 591 aa35.12■■■■□ 3.21
CAPNS1-206ENST00000588815 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP35.12■■■■□ 3.21
CAPNS1-206ENST00000588815 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP35.12■■■■□ 3.21
CAPNS1-206ENST00000588815 RAB34Q9BZG1 259 aa35.12■■■■□ 3.21
CAPNS1-206ENST00000588815 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP35.11■■■■□ 3.215e-6■■□□□ 12.9
CAPNS1-206ENST00000588815 IL17AQ16552 155 aa35.11■■■■□ 3.21
CAPNS1-206ENST00000588815 XRRA1Q6P2D8 792 aa35.11■■■■□ 3.21
CAPNS1-206ENST00000588815 SHCBP1Q8NEM2 672 aa35.11■■■■□ 3.21
CAPNS1-206ENST00000588815 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP35.11■■■■□ 3.21
CAPNS1-206ENST00000588815 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP35.11■■■■□ 3.21
CAPNS1-206ENST00000588815 KCNMB3Q9NPA1 279 aa35.11■■■■□ 3.21
CAPNS1-206ENST00000588815 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP35.11■■■■□ 3.21
CAPNS1-206ENST00000588815 CYP39A1Q9NYL5 469 aa35.11■■■■□ 3.21
CAPNS1-206ENST00000588815 KCNH3Q9ULD8 1083 aa35.11■■■■□ 3.21
CAPNS1-206ENST00000588815 CTAGE5O15320 804 aa35.1■■■■□ 3.21
CAPNS1-206ENST00000588815 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa35.1■■■■□ 3.21
CAPNS1-206ENST00000588815 PCNX4Q63HM2 1172 aa35.1■■■■□ 3.21
CAPNS1-206ENST00000588815 CLSTN2Q9H4D0 955 aa35.1■■■■□ 3.21
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF202O95125 648 aa35.09■■■■□ 3.21
CAPNS1-206ENST00000588815 TXLNAP40222 546 aa35.09■■■■□ 3.21
CAPNS1-206ENST00000588815 MROH8Q9H579 483 aa35.09■■■■□ 3.21
CAPNS1-206ENST00000588815 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa35.09■■■■□ 3.21
CAPNS1-206ENST00000588815 ERVK-9P63128 1117 aa35.09■■■■□ 3.21
CAPNS1-206ENST00000588815 ERVK-24P63145 666 aa35.09■■■■□ 3.21
CAPNS1-206ENST00000588815 CCNA1P78396 465 aa35.09■■■■□ 3.21
CAPNS1-206ENST00000588815 SETQ01105 290 aaPredicted RBP35.09■■■■□ 3.21
CAPNS1-206ENST00000588815 PDIA5Q14554 519 aa35.09■■■■□ 3.21
CAPNS1-206ENST00000588815 NIPA1Q7RTP0 329 aa35.09■■■■□ 3.21
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM43AQ8N2R8 423 aa35.09■■■■□ 3.21
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM20AQ96MK3 541 aa35.09■■■■□ 3.21
CAPNS1-206ENST00000588815 RMDN3Q96TC7 470 aa35.09■■■■□ 3.21
CAPNS1-206ENST00000588815 TXNRD2Q9NNW7 524 aa35.09■■■■□ 3.21
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM86B1E9PN63 330 aa35.08■■■■□ 3.21
CAPNS1-206ENST00000588815 MARCH6O60337 910 aa35.08■■■■□ 3.21
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