RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558086.1

TMC3-AS1-201, TMC3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene TMC3-AS1, Length 658 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC3-AS1-201ENST00000558086 ZNF543Q08ER8 600 aa15.84■□□□□ 0.13
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TMC3-AS1-201ENST00000558086 TTC14Q96N46 770 aa15.84■□□□□ 0.13
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TMC3-AS1-201ENST00000558086 GPCPD1Q9NPB8 672 aa15.81■□□□□ 0.12
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TMC3-AS1-201ENST00000558086 HLA-CQ95604 372 aa15.77■□□□□ 0.12
TMC3-AS1-201ENST00000558086 IWS1Q96ST2 819 aa15.77■□□□□ 0.12
TMC3-AS1-201ENST00000558086 CERS4Q9HA82 394 aa15.77■□□□□ 0.12
TMC3-AS1-201ENST00000558086 TOMM22Q9NS69 142 aa15.77■□□□□ 0.12
TMC3-AS1-201ENST00000558086 COL20A1Q9P218 1284 aa15.77■□□□□ 0.12
TMC3-AS1-201ENST00000558086 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa15.77■□□□□ 0.12
TMC3-AS1-201ENST00000558086 ABCB11O95342 1321 aa15.76■□□□□ 0.11
TMC3-AS1-201ENST00000558086 CCDC171Q6TFL3 1326 aa15.76■□□□□ 0.11
TMC3-AS1-201ENST00000558086 SIP14410 1827 aa15.76■□□□□ 0.11
TMC3-AS1-201ENST00000558086 HAS3O00219 553 aa15.76■□□□□ 0.11
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