RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557444.5

AFG3L1P-217, Transcript of AFG3 like matrix AAA peptidase subunit 1, pseudogene, humanhuman

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Gene AFG3L1P, Length 2,447 nt, Biotype transcribed unitary pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFG3L1P-217ENST00000557444 BBOX1O75936 387 aa22.29■■□□□ 1.16
AFG3L1P-217ENST00000557444 SCNN1DP51172 638 aa22.29■■□□□ 1.16
AFG3L1P-217ENST00000557444 TUBB2AQ13885 445 aa22.29■■□□□ 1.16
AFG3L1P-217ENST00000557444 ECM1Q16610 540 aa22.29■■□□□ 1.16
AFG3L1P-217ENST00000557444 KIAA1328Q86T90 577 aa22.29■■□□□ 1.16
AFG3L1P-217ENST00000557444 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
AFG3L1P-217ENST00000557444 TUBB2BQ9BVA1 445 aa22.29■■□□□ 1.16
AFG3L1P-217ENST00000557444 IDEP14735 1019 aa22.29■■□□□ 1.16
AFG3L1P-217ENST00000557444 ATP2B2Q01814 1243 aa22.29■■□□□ 1.16
AFG3L1P-217ENST00000557444 LRRC41Q15345 812 aa22.29■■□□□ 1.16
AFG3L1P-217ENST00000557444 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa22.29■■□□□ 1.16
AFG3L1P-217ENST00000557444 KRT26Q7Z3Y9 468 aa22.29■■□□□ 1.16
AFG3L1P-217ENST00000557444 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa22.29■■□□□ 1.16
AFG3L1P-217ENST00000557444 JMJD4Q9H9V9 463 aa22.29■■□□□ 1.16
AFG3L1P-217ENST00000557444 ZBED6P86452 979 aa22.28■■□□□ 1.16
AFG3L1P-217ENST00000557444 CENPPQ6IPU0 288 aa22.28■■□□□ 1.16
AFG3L1P-217ENST00000557444 ADGRF4Q8IZF3 695 aa22.28■■□□□ 1.16
AFG3L1P-217ENST00000557444 SNX29Q8TEQ0 813 aa22.28■■□□□ 1.16
AFG3L1P-217ENST00000557444 JAKMIP2Q96AA8 810 aa22.28■■□□□ 1.16
AFG3L1P-217ENST00000557444 PSMD14O00487 310 aa22.28■■□□□ 1.16
AFG3L1P-217ENST00000557444 MAP2K7O14733 419 aa22.28■■□□□ 1.16
AFG3L1P-217ENST00000557444 SEMA3FQ13275 785 aa22.28■■□□□ 1.16
AFG3L1P-217ENST00000557444 FAM114A1Q8IWE2 563 aa22.28■■□□□ 1.16
AFG3L1P-217ENST00000557444 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
AFG3L1P-217ENST00000557444 CAPZA3Q96KX2 299 aa22.28■■□□□ 1.16
AFG3L1P-217ENST00000557444 SNHG28P0DPA3 235 aa22.27■■□□□ 1.16
AFG3L1P-217ENST00000557444 ADRA2BP18089 450 aa22.27■■□□□ 1.16
AFG3L1P-217ENST00000557444 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP22.27■■□□□ 1.16
AFG3L1P-217ENST00000557444 ASPRV1Q53RT3 343 aa22.27■■□□□ 1.16
AFG3L1P-217ENST00000557444 KCTD1Q719H9 257 aa22.27■■□□□ 1.16
AFG3L1P-217ENST00000557444 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
AFG3L1P-217ENST00000557444 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
AFG3L1P-217ENST00000557444 UBR3Q6ZT12 1888 aa22.27■■□□□ 1.16
AFG3L1P-217ENST00000557444 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa22.27■■□□□ 1.16
AFG3L1P-217ENST00000557444 ZNF263O14978 683 aa22.27■■□□□ 1.16
AFG3L1P-217ENST00000557444 CYP2C19P33261 490 aa22.27■■□□□ 1.16
AFG3L1P-217ENST00000557444 UNC13DQ70J99 1090 aa22.27■■□□□ 1.16
AFG3L1P-217ENST00000557444 MMS19Q96T76 1030 aa22.27■■□□□ 1.16
AFG3L1P-217ENST00000557444 NUP58Q9BVL2 599 aa22.27■■□□□ 1.16
AFG3L1P-217ENST00000557444 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
AFG3L1P-217ENST00000557444 FOCADQ5VW36 1801 aa22.26■■□□□ 1.15
AFG3L1P-217ENST00000557444 MACROD2A1Z1Q3 448 aa22.26■■□□□ 1.15
AFG3L1P-217ENST00000557444 DOK7Q18PE1 504 aa22.26■■□□□ 1.15
AFG3L1P-217ENST00000557444 TMEM266Q2M3C6 531 aa22.26■■□□□ 1.15
AFG3L1P-217ENST00000557444 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
AFG3L1P-217ENST00000557444 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
AFG3L1P-217ENST00000557444 KRT83P78385 493 aa22.26■■□□□ 1.15
AFG3L1P-217ENST00000557444 ZNF543Q08ER8 600 aa22.26■■□□□ 1.15
AFG3L1P-217ENST00000557444 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
AFG3L1P-217ENST00000557444 RAD54LQ92698 747 aa22.26■■□□□ 1.15
AFG3L1P-217ENST00000557444 DDX12PQ92771 950 aa22.26■■□□□ 1.15
AFG3L1P-217ENST00000557444 PLIN4Q96Q06 1357 aa22.26■■□□□ 1.15
AFG3L1P-217ENST00000557444 ERGIC2Q96RQ1 377 aa22.26■■□□□ 1.15
AFG3L1P-217ENST00000557444 PDE11AQ9HCR9 933 aa22.26■■□□□ 1.15
AFG3L1P-217ENST00000557444 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
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AFG3L1P-217ENST00000557444 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
AFG3L1P-217ENST00000557444 FKBP15Q5T1M5 1219 aa22.25■■□□□ 1.15
AFG3L1P-217ENST00000557444 CCDC155Q8N6L0 562 aa22.25■■□□□ 1.15
AFG3L1P-217ENST00000557444 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
AFG3L1P-217ENST00000557444 USP40Q9NVE5 1235 aa22.25■■□□□ 1.15
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AFG3L1P-217ENST00000557444 USP17L10C9JJH3 530 aa22.25■■□□□ 1.15
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AFG3L1P-217ENST00000557444 SHMT1P34896 483 aa22.25■■□□□ 1.15
AFG3L1P-217ENST00000557444 VWA3BQ502W6 1294 aa22.25■■□□□ 1.15
AFG3L1P-217ENST00000557444 RETREG2Q8NC44 543 aa22.25■■□□□ 1.15
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AFG3L1P-217ENST00000557444 NDST4Q9H3R1 872 aa22.25■■□□□ 1.15
AFG3L1P-217ENST00000557444 STK17AQ9UEE5 414 aa22.25■■□□□ 1.15
AFG3L1P-217ENST00000557444 L1RE1Q9UN81 338 aa22.25■■□□□ 1.15
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AFG3L1P-217ENST00000557444 POTEB2H3BUK9 544 aa22.24■■□□□ 1.15
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AFG3L1P-217ENST00000557444 KRT86O43790 486 aa22.24■■□□□ 1.15
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AFG3L1P-217ENST00000557444 NEK11Q8NG66 645 aa22.24■■□□□ 1.15
AFG3L1P-217ENST00000557444 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
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AFG3L1P-217ENST00000557444 KRT79Q5XKE5 535 aa22.23■■□□□ 1.15
AFG3L1P-217ENST00000557444 C2CD5Q86YS7 1000 aa22.23■■□□□ 1.15
AFG3L1P-217ENST00000557444 ZFPM1Q8IX07 1006 aa22.23■■□□□ 1.15
AFG3L1P-217ENST00000557444 SEPT12Q8IYM1 358 aa22.23■■□□□ 1.15
AFG3L1P-217ENST00000557444 MMRN2Q9H8L6 949 aa22.23■■□□□ 1.15
AFG3L1P-217ENST00000557444 RIC8AQ9NPQ8 531 aa22.23■■□□□ 1.15
AFG3L1P-217ENST00000557444 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
AFG3L1P-217ENST00000557444 SIK3Q9Y2K2 1263 aa22.23■■□□□ 1.15
AFG3L1P-217ENST00000557444 hCG_1984214I3L0E3 225 aa22.23■■□□□ 1.15
AFG3L1P-217ENST00000557444 COBLL1Q53SF7 1204 aa22.23■■□□□ 1.15
AFG3L1P-217ENST00000557444 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
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