RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556718.1

PRPF39-210, Transcript of pre-mRNA processing factor 39, humanhuman

TSL 3

Gene PRPF39, Length 499 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF39-210ENST00000556718 MTA3Q9BTC8 594 aa6.53□□□□□ -1.36
PRPF39-210ENST00000556718 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
PRPF39-210ENST00000556718 PPT2Q9UMR5 302 aa6.53□□□□□ -1.36
PRPF39-210ENST00000556718 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa6.53□□□□□ -1.36
PRPF39-210ENST00000556718 LTBP3Q9NS15 1303 aa6.52□□□□□ -1.37
PRPF39-210ENST00000556718 AURKAO14965 403 aa6.52□□□□□ -1.37
PRPF39-210ENST00000556718 VAMP4O75379 141 aa6.52□□□□□ -1.37
PRPF39-210ENST00000556718 IMPDH2P12268 514 aa6.52□□□□□ -1.37
PRPF39-210ENST00000556718 GUCY2CP25092 1073 aa6.52□□□□□ -1.37
PRPF39-210ENST00000556718 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
PRPF39-210ENST00000556718 DPY19L1Q2PZI1 675 aa6.52□□□□□ -1.37
PRPF39-210ENST00000556718 FBXW10Q5XX13 1052 aa6.52□□□□□ -1.37
PRPF39-210ENST00000556718 CABP7Q86V35 215 aa6.52□□□□□ -1.37
PRPF39-210ENST00000556718 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa6.52□□□□□ -1.37
PRPF39-210ENST00000556718 CPA5Q8WXQ8 436 aa6.52□□□□□ -1.37
PRPF39-210ENST00000556718 ARMC5Q96C12 935 aa6.52□□□□□ -1.37
PRPF39-210ENST00000556718 NTMQ9P121 344 aa6.52□□□□□ -1.37
PRPF39-210ENST00000556718 GULP1Q9UBP9 304 aa6.52□□□□□ -1.37
PRPF39-210ENST00000556718 SIT1Q9Y3P8 196 aa6.52□□□□□ -1.37
PRPF39-210ENST00000556718 A0A087WZG4 1122 aa6.51□□□□□ -1.37
PRPF39-210ENST00000556718 C8BP07358 591 aa6.51□□□□□ -1.37
PRPF39-210ENST00000556718 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP6.51□□□□□ -1.37
PRPF39-210ENST00000556718 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
PRPF39-210ENST00000556718 NETO2Q8NC67 525 aa6.51□□□□□ -1.37
PRPF39-210ENST00000556718 PEX11GQ96HA9 241 aa6.51□□□□□ -1.37
PRPF39-210ENST00000556718 C8orf49Q96NF6 230 aa6.51□□□□□ -1.37
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PRPF39-210ENST00000556718 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PRPF39-210ENST00000556718 ZNF20P17024 532 aa6.5□□□□□ -1.37
PRPF39-210ENST00000556718 CANXP27824 592 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PRPF39-210ENST00000556718 EEF1DP3Q658K8 133 aa6.5□□□□□ -1.37
PRPF39-210ENST00000556718 CPZQ66K79 652 aa6.5□□□□□ -1.37
PRPF39-210ENST00000556718 TTLL7Q6ZT98 887 aa6.5□□□□□ -1.37
PRPF39-210ENST00000556718 LINC00482Q8N8I6 264 aa6.5□□□□□ -1.37
PRPF39-210ENST00000556718 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PRPF39-210ENST00000556718 LOXL4Q96JB6 756 aa6.5□□□□□ -1.37
PRPF39-210ENST00000556718 GMLQ99445 158 aa6.5□□□□□ -1.37
PRPF39-210ENST00000556718 HAUS7Q99871 368 aa6.5□□□□□ -1.37
PRPF39-210ENST00000556718 GORASP1Q9BQQ3 440 aa6.5□□□□□ -1.37
PRPF39-210ENST00000556718 RACK1P63244 317 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PRPF39-210ENST00000556718 SLC9A5Q14940 896 aa6.49□□□□□ -1.37
PRPF39-210ENST00000556718 TCEAL1Q15170 157 aa6.49□□□□□ -1.37
PRPF39-210ENST00000556718 SOGA3Q5TF21 947 aa6.49□□□□□ -1.37
PRPF39-210ENST00000556718 SLC16A11Q8NCK7 471 aa6.49□□□□□ -1.37
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PRPF39-210ENST00000556718 WHRNQ9P202 907 aa6.49□□□□□ -1.37
PRPF39-210ENST00000556718 NUDT5Q9UKK9 219 aa6.49□□□□□ -1.37
PRPF39-210ENST00000556718 C2orf71A6NGG8 1288 aa6.48□□□□□ -1.37
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PRPF39-210ENST00000556718 WWC2Q6AWC2 1192 aa6.48□□□□□ -1.37
PRPF39-210ENST00000556718 STK32CQ86UX6 486 aa6.48□□□□□ -1.37
PRPF39-210ENST00000556718 GPRASP2Q96D09 838 aa6.48□□□□□ -1.37
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PRPF39-210ENST00000556718 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
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PRPF39-210ENST00000556718 NTRK1P04629 796 aa6.47□□□□□ -1.37
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PRPF39-210ENST00000556718 SEPHS1P49903 392 aa6.47□□□□□ -1.37
PRPF39-210ENST00000556718 PAK2Q13177 524 aa6.47□□□□□ -1.37
PRPF39-210ENST00000556718 CCDC81Q6ZN84 652 aa6.47□□□□□ -1.37
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PRPF39-210ENST00000556718 SAMD11Q96NU1 681 aa6.47□□□□□ -1.37
PRPF39-210ENST00000556718 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP6.47□□□□□ -1.37
PRPF39-210ENST00000556718 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
PRPF39-210ENST00000556718 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
PRPF39-210ENST00000556718 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa6.47□□□□□ -1.37
PRPF39-210ENST00000556718 INVSQ9Y283 1065 aa6.47□□□□□ -1.37
PRPF39-210ENST00000556718 BACE2Q9Y5Z0 518 aa6.47□□□□□ -1.37
PRPF39-210ENST00000556718 C7orf72A4D263 438 aa6.46□□□□□ -1.38
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PRPF39-210ENST00000556718 CYP2C8P10632 490 aa6.46□□□□□ -1.38
PRPF39-210ENST00000556718 THBS2P35442 1172 aa6.46□□□□□ -1.38
PRPF39-210ENST00000556718 GNPTABQ3T906 1256 aa6.46□□□□□ -1.38
PRPF39-210ENST00000556718 DPH6Q7L8W6 267 aa6.46□□□□□ -1.38
PRPF39-210ENST00000556718 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
PRPF39-210ENST00000556718 TTC9BQ8N6N2 239 aa6.46□□□□□ -1.38
PRPF39-210ENST00000556718 USP33Q8TEY7 942 aa6.46□□□□□ -1.38
PRPF39-210ENST00000556718 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
PRPF39-210ENST00000556718 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
PRPF39-210ENST00000556718 SUV39H1O43463 412 aa6.45□□□□□ -1.38
PRPF39-210ENST00000556718 EPHX1P07099 455 aa6.45□□□□□ -1.38
PRPF39-210ENST00000556718 RPL13P26373 211 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PRPF39-210ENST00000556718 MBLAC2Q68D91 279 aa6.45□□□□□ -1.38
PRPF39-210ENST00000556718 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PRPF39-210ENST00000556718 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PRPF39-210ENST00000556718 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa6.45□□□□□ -1.38
PRPF39-210ENST00000556718 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa6.44□□□□□ -1.38
PRPF39-210ENST00000556718 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
PRPF39-210ENST00000556718 PAMP19021 973 aa6.44□□□□□ -1.38
PRPF39-210ENST00000556718 AMPD2Q01433 879 aa6.44□□□□□ -1.38
PRPF39-210ENST00000556718 MCTP2Q6DN12 878 aa6.44□□□□□ -1.38
PRPF39-210ENST00000556718 LIMS2Q7Z4I7 341 aa6.44□□□□□ -1.38
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