RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554497.1

TMEM30B-201, Transcript of transmembrane protein 30B, humanhuman

TSL 4

Gene TMEM30B, Length 590 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM30B-201ENST00000554497 PITPNM1O00562 1244 aa14.78□□□□□ -0.04
TMEM30B-201ENST00000554497 FOXP2O15409 715 aa14.78□□□□□ -0.04
TMEM30B-201ENST00000554497 SGSM2O43147 1006 aa14.78□□□□□ -0.04
TMEM30B-201ENST00000554497 GFRA3O60609 400 aa14.78□□□□□ -0.04
TMEM30B-201ENST00000554497 IRS1P35568 1242 aa14.78□□□□□ -0.04
TMEM30B-201ENST00000554497 DEFB103AP81534 67 aa14.78□□□□□ -0.04
TMEM30B-201ENST00000554497 GIMAP6Q6P9H5 292 aa14.78□□□□□ -0.04
TMEM30B-201ENST00000554497 AMOTL1Q8IY63 956 aa14.78□□□□□ -0.04
TMEM30B-201ENST00000554497 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
TMEM30B-201ENST00000554497 CHST13Q8NET6 341 aa14.78□□□□□ -0.04
TMEM30B-201ENST00000554497 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa14.78□□□□□ -0.04
TMEM30B-201ENST00000554497 ZBED2Q9BTP6 218 aa14.78□□□□□ -0.04
TMEM30B-201ENST00000554497 NAPBQ9H115 298 aa14.78□□□□□ -0.04
TMEM30B-201ENST00000554497 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
TMEM30B-201ENST00000554497 FAM186AA6NE01 2351 aa14.77□□□□□ -0.04
TMEM30B-201ENST00000554497 USP17L12C9JPN9 530 aa14.77□□□□□ -0.05
TMEM30B-201ENST00000554497 USP17L21D6R901 530 aa14.77□□□□□ -0.05
TMEM30B-201ENST00000554497 ZBED4O75132 1171 aa14.77□□□□□ -0.05
TMEM30B-201ENST00000554497 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
TMEM30B-201ENST00000554497 PURAQ00577 322 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
TMEM30B-201ENST00000554497 TCF15Q12870 199 aa14.77□□□□□ -0.05
TMEM30B-201ENST00000554497 TAPT1Q6NXT6 567 aa14.77□□□□□ -0.05
TMEM30B-201ENST00000554497 EEPD1Q7L9B9 569 aa14.77□□□□□ -0.05
TMEM30B-201ENST00000554497 ADHFE1Q8IWW8 467 aa14.77□□□□□ -0.05
TMEM30B-201ENST00000554497 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
TMEM30B-201ENST00000554497 IFNL3Q8IZI9 196 aa14.77□□□□□ -0.05
TMEM30B-201ENST00000554497 RETREG2Q8NC44 543 aa14.77□□□□□ -0.05
TMEM30B-201ENST00000554497 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa14.77□□□□□ -0.05
TMEM30B-201ENST00000554497 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP14.77□□□□□ -0.05
TMEM30B-201ENST00000554497 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa14.77□□□□□ -0.05
TMEM30B-201ENST00000554497 HOMER2Q9NSB8 354 aa14.77□□□□□ -0.05
TMEM30B-201ENST00000554497 PRKAG3Q9UGI9 489 aa14.77□□□□□ -0.05
TMEM30B-201ENST00000554497 MUTYHQ9UIF7 546 aa14.77□□□□□ -0.05
TMEM30B-201ENST00000554497 Q9Y3F1 56 aa14.77□□□□□ -0.05
TMEM30B-201ENST00000554497 ASB14A6NK59 587 aa14.76□□□□□ -0.05
TMEM30B-201ENST00000554497 NDUFB10O96000 172 aa14.76□□□□□ -0.05
TMEM30B-201ENST00000554497 FAM47CQ5HY64 1035 aa14.76□□□□□ -0.05
TMEM30B-201ENST00000554497 IQSEC1Q6DN90 963 aa14.76□□□□□ -0.05
TMEM30B-201ENST00000554497 CTR9Q6PD62 1173 aa14.76□□□□□ -0.05
TMEM30B-201ENST00000554497 C16orf86Q6ZW13 317 aa14.76□□□□□ -0.05
TMEM30B-201ENST00000554497 KIFC2Q96AC6 838 aa14.76□□□□□ -0.05
TMEM30B-201ENST00000554497 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
TMEM30B-201ENST00000554497 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
TMEM30B-201ENST00000554497 KMT2EQ8IZD2 1858 aa14.76□□□□□ -0.05
TMEM30B-201ENST00000554497 CACNA1BQ00975 2339 aa14.75□□□□□ -0.05
TMEM30B-201ENST00000554497 LCTP09848 1927 aa14.75□□□□□ -0.05
TMEM30B-201ENST00000554497 MYH4Q9Y623 1939 aa14.75□□□□□ -0.05
TMEM30B-201ENST00000554497 MINDY4BA8MYZ0 360 aa14.75□□□□□ -0.05
TMEM30B-201ENST00000554497 F5H6K3 240 aa14.75□□□□□ -0.05
TMEM30B-201ENST00000554497 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa14.75□□□□□ -0.05
TMEM30B-201ENST00000554497 GJB5O95377 273 aa14.75□□□□□ -0.05
TMEM30B-201ENST00000554497 KLRC3Q07444 240 aa14.75□□□□□ -0.05
TMEM30B-201ENST00000554497 GPNMBQ14956 572 aa14.75□□□□□ -0.05
TMEM30B-201ENST00000554497 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
TMEM30B-201ENST00000554497 C12orf60Q5U649 245 aa14.75□□□□□ -0.05
TMEM30B-201ENST00000554497 RAD9AQ99638 391 aa14.75□□□□□ -0.05
TMEM30B-201ENST00000554497 DSCC1Q9BVC3 393 aa14.75□□□□□ -0.05
TMEM30B-201ENST00000554497 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
TMEM30B-201ENST00000554497 FAM86C1Q9NVL1 165 aa14.75□□□□□ -0.05
TMEM30B-201ENST00000554497 POLR3EQ9NVU0 708 aa14.75□□□□□ -0.05
TMEM30B-201ENST00000554497 ZMYM6O95789 1325 aa14.74□□□□□ -0.05
TMEM30B-201ENST00000554497 C5orf42Q9H799 3197 aa14.74□□□□□ -0.05
TMEM30B-201ENST00000554497 MYL3P08590 195 aa14.74□□□□□ -0.05
TMEM30B-201ENST00000554497 NBPF20Q3BBV1 942 aa14.74□□□□□ -0.05
TMEM30B-201ENST00000554497 SBK1Q52WX2 424 aa14.74□□□□□ -0.05
TMEM30B-201ENST00000554497 EP400NLQ6ZTU2 488 aa14.74□□□□□ -0.05
TMEM30B-201ENST00000554497 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa14.74□□□□□ -0.05
TMEM30B-201ENST00000554497 C17orf80Q9BSJ5 609 aa14.74□□□□□ -0.05
TMEM30B-201ENST00000554497 ACAD9Q9H845 621 aa14.74□□□□□ -0.05
TMEM30B-201ENST00000554497 FAM50BQ9Y247 325 aa14.74□□□□□ -0.05
TMEM30B-201ENST00000554497 FGAP02671 866 aa14.73□□□□□ -0.05
TMEM30B-201ENST00000554497 OAZ1P54368 228 aa14.73□□□□□ -0.05
TMEM30B-201ENST00000554497 PTH1RQ03431 593 aa14.73□□□□□ -0.05
TMEM30B-201ENST00000554497 PPARAQ07869 468 aa14.73□□□□□ -0.05
TMEM30B-201ENST00000554497 BFSP2Q13515 415 aa14.73□□□□□ -0.05
TMEM30B-201ENST00000554497 ALX1Q15699 326 aa14.73□□□□□ -0.05
TMEM30B-201ENST00000554497 TCTN1Q2MV58 587 aa14.73□□□□□ -0.05
TMEM30B-201ENST00000554497 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa14.73□□□□□ -0.05
TMEM30B-201ENST00000554497 STK11IPQ8N1F8 1099 aa14.73□□□□□ -0.05
TMEM30B-201ENST00000554497 FBXO22Q8NEZ5 403 aa14.73□□□□□ -0.05
TMEM30B-201ENST00000554497 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
TMEM30B-201ENST00000554497 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
TMEM30B-201ENST00000554497 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
TMEM30B-201ENST00000554497 ANO2Q9NQ90 1003 aa14.73□□□□□ -0.05
TMEM30B-201ENST00000554497 PLXNA3P51805 1871 aa14.73□□□□□ -0.05
TMEM30B-201ENST00000554497 COL19A1Q14993 1142 aa14.72□□□□□ -0.05
TMEM30B-201ENST00000554497 DUSP28Q4G0W2 176 aa14.72□□□□□ -0.05
TMEM30B-201ENST00000554497 TIGD5Q53EQ6 642 aa14.72□□□□□ -0.05
TMEM30B-201ENST00000554497 TCEAL5Q5H9L2 206 aa14.72□□□□□ -0.05
TMEM30B-201ENST00000554497 FAM117BQ6P1L5 589 aa14.72□□□□□ -0.05
TMEM30B-201ENST00000554497 PRRX2Q99811 253 aa14.72□□□□□ -0.05
TMEM30B-201ENST00000554497 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
TMEM30B-201ENST00000554497 RNF146Q9NTX7 359 aa14.72□□□□□ -0.05
TMEM30B-201ENST00000554497 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa14.71□□□□□ -0.05
TMEM30B-201ENST00000554497 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
TMEM30B-201ENST00000554497 HAND2P61296 217 aa14.71□□□□□ -0.05
TMEM30B-201ENST00000554497 NFRKBQ6P4R8 1299 aa14.71□□□□□ -0.05
TMEM30B-201ENST00000554497 CNKSR3Q6P9H4 555 aa14.71□□□□□ -0.05
TMEM30B-201ENST00000554497 RNF135Q8IUD6 432 aa14.71□□□□□ -0.05
TMEM30B-201ENST00000554497 BANK1Q8NDB2 785 aa14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.7 ms