RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554292.1

PCNX1-206, Transcript of pecanex 1, human

TSL 4

Gene PCNX1, Length 402 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PCNX1-206	ENST00000554292	EIF2AK2	P19525	551 aa	Known RBP	32.72	■■■□□ 2.83
PCNX1-206	ENST00000554292	NEK4	P51957	841 aa		32.72	■■■□□ 2.83
PCNX1-206	ENST00000554292	IQSEC1	Q6DN90	963 aa		32.72	■■■□□ 2.83
PCNX1-206	ENST00000554292	RNF180	Q86T96	592 aa		32.72	■■■□□ 2.83
PCNX1-206	ENST00000554292	TEX2	Q8IWB9	1127 aa		32.72	■■■□□ 2.83
PCNX1-206	ENST00000554292	SMARCC2	Q8TAQ2	1214 aa		32.72	■■■□□ 2.83
PCNX1-206	ENST00000554292	RNF26	Q9BY78	433 aa	Predicted RBP	32.72	■■■□□ 2.83
PCNX1-206	ENST00000554292	C11orf49	Q9H6J7	331 aa		32.72	■■■□□ 2.83
PCNX1-206	ENST00000554292	PSTPIP2	Q9H939	334 aa		32.72	■■■□□ 2.83
PCNX1-206	ENST00000554292	SPC25	Q9HBM1	224 aa		32.72	■■■□□ 2.83
PCNX1-206	ENST00000554292	DDX49	Q9Y6V7	483 aa	Known RBP	32.72	■■■□□ 2.83
PCNX1-206	ENST00000554292	PIK3CD	O00329	1044 aa		32.71	■■■□□ 2.83
PCNX1-206	ENST00000554292	AK2	P54819	239 aa		32.71	■■■□□ 2.83
PCNX1-206	ENST00000554292	NAPA	P54920	295 aa		32.71	■■■□□ 2.83
PCNX1-206	ENST00000554292	TNFAIP2	Q03169	654 aa		32.71	■■■□□ 2.83
PCNX1-206	ENST00000554292	STXBP2	Q15833	593 aa		32.71	■■■□□ 2.83
PCNX1-206	ENST00000554292	WWC2	Q6AWC2	1192 aa		32.71	■■■□□ 2.83
PCNX1-206	ENST00000554292	FCHSD1	Q86WN1	690 aa		32.71	■■■□□ 2.83
PCNX1-206	ENST00000554292	DIS3L	Q8TF46	1054 aa	Known RBP	32.71	■■■□□ 2.83
PCNX1-206	ENST00000554292	NCOA5	Q9HCD5	579 aa	Known RBP	32.71	■■■□□ 2.83
PCNX1-206	ENST00000554292	PRPF3	O43395	683 aa	Known RBP	32.7	■■■□□ 2.83
PCNX1-206	ENST00000554292	ADCYAP1R1	P41586	468 aa		32.7	■■■□□ 2.83
PCNX1-206	ENST00000554292	PFKFB3	Q16875	520 aa	Predicted RBP	32.7	■■■□□ 2.83
PCNX1-206	ENST00000554292	TAPT1	Q6NXT6	567 aa		32.7	■■■□□ 2.83
PCNX1-206	ENST00000554292	NOL8	Q76FK4	1167 aa	Known RBP	32.7	■■■□□ 2.83
PCNX1-206	ENST00000554292	TRIM22	Q8IYM9	498 aa		32.7	■■■□□ 2.83
PCNX1-206	ENST00000554292	LARP6	Q9BRS8	491 aa	Known RBP	32.7	■■■□□ 2.83
PCNX1-206	ENST00000554292	SLK	Q9H2G2	1235 aa	Predicted RBP	32.7	■■■□□ 2.83
PCNX1-206	ENST00000554292	MYCN	P04198	464 aa	Predicted RBP	32.69	■■■□□ 2.82
PCNX1-206	ENST00000554292	SCG2	P13521	617 aa		32.69	■■■□□ 2.82
PCNX1-206	ENST00000554292	RBM25	P49756	843 aa	Known RBP	32.69	■■■□□ 2.82
PCNX1-206	ENST00000554292	MNX1	P50219	401 aa	Predicted RBP	32.69	■■■□□ 2.82
PCNX1-206	ENST00000554292	STK3	Q13188	491 aa		32.69	■■■□□ 2.82
PCNX1-206	ENST00000554292	LRRC41	Q15345	812 aa		32.69	■■■□□ 2.82
PCNX1-206	ENST00000554292	NTRK3	Q16288	839 aa		32.69	■■■□□ 2.82
PCNX1-206	ENST00000554292	SCFD2	Q8WU76	684 aa		32.69	■■■□□ 2.82
PCNX1-206	ENST00000554292	LENG1	Q96BZ8	264 aa	Predicted RBP	32.69	■■■□□ 2.82
PCNX1-206	ENST00000554292	PDCD2L	Q9BRP1	358 aa		32.69	■■■□□ 2.82
PCNX1-206	ENST00000554292	GLT8D2	Q9H1C3	349 aa		32.69	■■■□□ 2.82
PCNX1-206	ENST00000554292	BARHL2	Q9NY43	387 aa		32.69	■■■□□ 2.82
PCNX1-206	ENST00000554292	NR3C2	P08235	984 aa		32.68	■■■□□ 2.82
PCNX1-206	ENST00000554292	GJC2	Q5T442	439 aa	Predicted RBP	32.68	■■■□□ 2.82
PCNX1-206	ENST00000554292	CCDC12	Q8WUD4	166 aa	Predicted RBP	32.68	■■■□□ 2.82
PCNX1-206	ENST00000554292	SYNRG	Q9UMZ2	1314 aa		32.68	■■■□□ 2.82
PCNX1-206	ENST00000554292	RBM47	A0AV96	593 aa	Known RBP	32.67	■■■□□ 2.82
PCNX1-206	ENST00000554292	PGK1	P00558	417 aa		32.67	■■■□□ 2.82
PCNX1-206	ENST00000554292	PHKB	Q93100	1093 aa		32.67	■■■□□ 2.82
PCNX1-206	ENST00000554292	SLC26A6	Q9BXS9	759 aa		32.67	■■■□□ 2.82
PCNX1-206	ENST00000554292	PDGFC	Q9NRA1	345 aa		32.67	■■■□□ 2.82
PCNX1-206	ENST00000554292	STXBP3	O00186	592 aa		32.66	■■■□□ 2.82
PCNX1-206	ENST00000554292	MEIS2	O14770	477 aa		32.66	■■■□□ 2.82
PCNX1-206	ENST00000554292	ADAMTS4	O75173	837 aa		32.66	■■■□□ 2.82
PCNX1-206	ENST00000554292	EIF3J	O75822	258 aa	Known RBP	32.66	■■■□□ 2.82
PCNX1-206	ENST00000554292	CDKL5	O76039	1030 aa		32.66	■■■□□ 2.82
PCNX1-206	ENST00000554292	PGM5	Q15124	567 aa		32.66	■■■□□ 2.82
PCNX1-206	ENST00000554292	USP17L6P	Q6QN14	398 aa		32.66	■■■□□ 2.82
PCNX1-206	ENST00000554292	WDR11	Q9BZH6	1224 aa		32.66	■■■□□ 2.82
PCNX1-206	ENST00000554292	AP5M1	Q9H0R1	490 aa		32.66	■■■□□ 2.82
PCNX1-206	ENST00000554292	UPF3A	Q9H1J1	476 aa	Known RBP	32.66	■■■□□ 2.82
PCNX1-206	ENST00000554292	TPCN1	Q9ULQ1	816 aa		32.66	■■■□□ 2.82
PCNX1-206	ENST00000554292		Q9Y3F1	56 aa		32.66	■■■□□ 2.82
PCNX1-206	ENST00000554292	C11orf97	A0A1B0GVM6	126 aa	Predicted RBP	32.65	■■■□□ 2.82
PCNX1-206	ENST00000554292	ADCY6	O43306	1168 aa		32.65	■■■□□ 2.82
PCNX1-206	ENST00000554292	PFKFB2	O60825	505 aa		32.65	■■■□□ 2.82
PCNX1-206	ENST00000554292	COL6A1	P12109	1028 aa		32.65	■■■□□ 2.82
PCNX1-206	ENST00000554292	CCND2	P30279	289 aa		32.65	■■■□□ 2.82
PCNX1-206	ENST00000554292	ADCY7	P51828	1080 aa		32.65	■■■□□ 2.82
PCNX1-206	ENST00000554292	GJA9	P57773	515 aa		32.65	■■■□□ 2.82
PCNX1-206	ENST00000554292	SSRP1	Q08945	709 aa	Known RBP	32.65	■■■□□ 2.82
PCNX1-206	ENST00000554292	DUSP28	Q4G0W2	176 aa		32.65	■■■□□ 2.82
PCNX1-206	ENST00000554292	TLK2	Q86UE8	772 aa		32.65	■■■□□ 2.82
PCNX1-206	ENST00000554292	GNE	Q9Y223	722 aa	Known RBP	32.65	■■■□□ 2.82
PCNX1-206	ENST00000554292	FRMPD4	Q14CM0	1322 aa		32.65	■■■□□ 2.82
PCNX1-206	ENST00000554292	NKRF	O15226	690 aa	Known RBP eCLIP	32.64	■■■□□ 2.82	3e-6	■■■■□ 21
PCNX1-206	ENST00000554292	C6orf222	P0C671	652 aa	Predicted RBP	32.64	■■■□□ 2.82
PCNX1-206	ENST00000554292	MYCL	P12524	364 aa	Predicted RBP	32.64	■■■□□ 2.82
PCNX1-206	ENST00000554292	SMPD1	P17405	629 aa		32.64	■■■□□ 2.82
PCNX1-206	ENST00000554292	TTLL4	Q14679	1199 aa		32.64	■■■□□ 2.82
PCNX1-206	ENST00000554292	TSEN34	Q9BSV6	310 aa	Known RBP	32.64	■■■□□ 2.82
PCNX1-206	ENST00000554292	EHMT1	Q9H9B1	1298 aa		32.64	■■■□□ 2.82
PCNX1-206	ENST00000554292	RIC8A	Q9NPQ8	531 aa		32.64	■■■□□ 2.82
PCNX1-206	ENST00000554292	SPDYE3	A6NKU9	549 aa		32.63	■■■□□ 2.81
PCNX1-206	ENST00000554292	CST5	P28325	142 aa	Predicted RBP	32.63	■■■□□ 2.81
PCNX1-206	ENST00000554292	PCSK9	Q8NBP7	692 aa	Known RBP	32.63	■■■□□ 2.81
PCNX1-206	ENST00000554292	SCRN1	Q12765	414 aa		32.62	■■■□□ 2.81
PCNX1-206	ENST00000554292	PKN1	Q16512	942 aa		32.62	■■■□□ 2.81
PCNX1-206	ENST00000554292	TYW1B	Q6NUM6	668 aa		32.62	■■■□□ 2.81
PCNX1-206	ENST00000554292	VSIG10L	Q86VR7	867 aa		32.62	■■■□□ 2.81
PCNX1-206	ENST00000554292	CCDC148	Q8NFR7	591 aa		32.62	■■■□□ 2.81
PCNX1-206	ENST00000554292	ALPK3	Q96L96	1907 aa		32.61	■■■□□ 2.81
PCNX1-206	ENST00000554292	ESYT2	A0FGR8	921 aa		32.61	■■■□□ 2.81
PCNX1-206	ENST00000554292	SMCO2	A6NFE2	343 aa		32.61	■■■□□ 2.81
PCNX1-206	ENST00000554292	STAM2	O75886	525 aa		32.61	■■■□□ 2.81
PCNX1-206	ENST00000554292	NKX3-2	P78367	333 aa		32.61	■■■□□ 2.81
PCNX1-206	ENST00000554292	XRRA1	Q6P2D8	792 aa		32.61	■■■□□ 2.81
PCNX1-206	ENST00000554292	SEPT14	Q6ZU15	432 aa		32.61	■■■□□ 2.81
PCNX1-206	ENST00000554292	KLHDC9	Q8NEP7	349 aa		32.61	■■■□□ 2.81
PCNX1-206	ENST00000554292	IL27	Q8NEV9	243 aa		32.61	■■■□□ 2.81
PCNX1-206	ENST00000554292	SENP6	Q9GZR1	1112 aa	Predicted RBP	32.61	■■■□□ 2.81
PCNX1-206	ENST00000554292	PHF24	Q9UPV7	400 aa		32.61	■■■□□ 2.81

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