RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554070.1

AREL1-208, Transcript of apoptosis resistant E3 ubiquitin protein ligase 1, human

TSL 3

Gene AREL1, Length 742 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AREL1-208	ENST00000554070	SYTL5	Q8TDW5	730 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
AREL1-208	ENST00000554070	SCFD2	Q8WU76	684 aa		13.59	□□□□□ -0.23
AREL1-208	ENST00000554070	RUFY2	Q8WXA3	655 aa		13.59	□□□□□ -0.23
AREL1-208	ENST00000554070	MYLIP	Q8WY64	445 aa		13.59	□□□□□ -0.23
AREL1-208	ENST00000554070	NOC4L	Q9BVI4	516 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
AREL1-208	ENST00000554070	ALDH8A1	Q9H2A2	487 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
AREL1-208	ENST00000554070	IL23A	Q9NPF7	189 aa		13.59	□□□□□ -0.23
AREL1-208	ENST00000554070	POLR3E	Q9NVU0	708 aa		13.59	□□□□□ -0.23
AREL1-208	ENST00000554070	COL20A1	Q9P218	1284 aa		13.59	□□□□□ -0.23
AREL1-208	ENST00000554070	TMEM265	A0A087WTH1	108 aa		13.58	□□□□□ -0.24
AREL1-208	ENST00000554070	ARIH2	O95376	493 aa		13.58	□□□□□ -0.24
AREL1-208	ENST00000554070	CYP21A2	P08686	494 aa		13.58	□□□□□ -0.24
AREL1-208	ENST00000554070	DNAJB2	P25686	324 aa		13.58	□□□□□ -0.24
AREL1-208	ENST00000554070	CCL23	P55773	120 aa		13.58	□□□□□ -0.24
AREL1-208	ENST00000554070	PSRC1	Q6PGN9	363 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
AREL1-208	ENST00000554070	MCF2L2	Q86YR7	1114 aa		13.58	□□□□□ -0.24
AREL1-208	ENST00000554070	MTG1	Q9BT17	334 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
AREL1-208	ENST00000554070	MAF1	Q9H063	256 aa		13.58	□□□□□ -0.24
AREL1-208	ENST00000554070	GPHN	Q9NQX3	736 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
AREL1-208	ENST00000554070	MRPL11	Q9Y3B7	192 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
AREL1-208	ENST00000554070		A6NJR5	290 aa		13.57	□□□□□ -0.24
AREL1-208	ENST00000554070	GRXCR1	A8MXD5	290 aa		13.57	□□□□□ -0.24
AREL1-208	ENST00000554070	KLRF2	D3W0D1	207 aa		13.57	□□□□□ -0.24
AREL1-208	ENST00000554070	TRDN	Q13061	729 aa		13.57	□□□□□ -0.24
AREL1-208	ENST00000554070	TTLL4	Q14679	1199 aa		13.57	□□□□□ -0.24
AREL1-208	ENST00000554070	BRDT	Q58F21	947 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
AREL1-208	ENST00000554070	CCDC62	Q6P9F0	684 aa		13.57	□□□□□ -0.24
AREL1-208	ENST00000554070	SEPT14	Q6ZU15	432 aa		13.57	□□□□□ -0.24
AREL1-208	ENST00000554070	NSUN6	Q8TEA1	469 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
AREL1-208	ENST00000554070	PPP1R13L	Q8WUF5	828 aa		13.57	□□□□□ -0.24
AREL1-208	ENST00000554070	HERVK_113	Q902F9	699 aa		13.57	□□□□□ -0.24
AREL1-208	ENST00000554070	RMDN3	Q96TC7	470 aa		13.57	□□□□□ -0.24
AREL1-208	ENST00000554070	WNT8A	Q9H1J5	351 aa		13.57	□□□□□ -0.24
AREL1-208	ENST00000554070	TRMT13	Q9NUP7	481 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
AREL1-208	ENST00000554070	MAD2L2	Q9UI95	211 aa		13.57	□□□□□ -0.24
AREL1-208	ENST00000554070	TAF6L	Q9Y6J9	622 aa		13.57	□□□□□ -0.24
AREL1-208	ENST00000554070	PALM3	A6NDB9	673 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
AREL1-208	ENST00000554070	KPNA6	O60684	536 aa		13.56	□□□□□ -0.24
AREL1-208	ENST00000554070	PPP1R11	O60927	126 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
AREL1-208	ENST00000554070	CFB	P00751	764 aa		13.56	□□□□□ -0.24
AREL1-208	ENST00000554070	FGB	P02675	491 aa		13.56	□□□□□ -0.24
AREL1-208	ENST00000554070	CYP2C9	P11712	490 aa		13.56	□□□□□ -0.24
AREL1-208	ENST00000554070	PBX2	P40425	430 aa		13.56	□□□□□ -0.24
AREL1-208	ENST00000554070	GRIN2C	Q14957	1233 aa		13.56	□□□□□ -0.24
AREL1-208	ENST00000554070	NBPF20	Q3BBV1	942 aa		13.56	□□□□□ -0.24
AREL1-208	ENST00000554070	FAM47C	Q5HY64	1035 aa		13.56	□□□□□ -0.24
AREL1-208	ENST00000554070	MAFA	Q8NHW3	353 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
AREL1-208	ENST00000554070	TIFA	Q96CG3	184 aa		13.56	□□□□□ -0.24
AREL1-208	ENST00000554070	MTMR8	Q96EF0	704 aa		13.56	□□□□□ -0.24
AREL1-208	ENST00000554070	SCLY	Q96I15	445 aa		13.56	□□□□□ -0.24
AREL1-208	ENST00000554070	IWS1	Q96ST2	819 aa		13.56	□□□□□ -0.24
AREL1-208	ENST00000554070	AMN	Q9BXJ7	453 aa		13.56	□□□□□ -0.24
AREL1-208	ENST00000554070	PBX4	Q9BYU1	374 aa		13.56	□□□□□ -0.24
AREL1-208	ENST00000554070	ZNF576	Q9H609	170 aa		13.56	□□□□□ -0.24
AREL1-208	ENST00000554070	SENP2	Q9HC62	589 aa		13.56	□□□□□ -0.24
AREL1-208	ENST00000554070	CXXC1	Q9P0U4	656 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
AREL1-208	ENST00000554070	COL6A3	P12111	3177 aa		13.56	□□□□□ -0.24
AREL1-208	ENST00000554070	MYH6	P13533	1939 aa		13.55	□□□□□ -0.24
AREL1-208	ENST00000554070		E7EWF7	191 aa		13.55	□□□□□ -0.24
AREL1-208	ENST00000554070	OPLAH	O14841	1288 aa		13.55	□□□□□ -0.24
AREL1-208	ENST00000554070	IFIT3	O14879	490 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
AREL1-208	ENST00000554070	SGSM2	O43147	1006 aa		13.55	□□□□□ -0.24
AREL1-208	ENST00000554070	SUPT20HL2	P0C7V6	817 aa		13.55	□□□□□ -0.24
AREL1-208	ENST00000554070	FOSL2	P15408	326 aa		13.55	□□□□□ -0.24
AREL1-208	ENST00000554070	EIF2AK2	P19525	551 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
AREL1-208	ENST00000554070	GRM4	Q14833	912 aa		13.55	□□□□□ -0.24
AREL1-208	ENST00000554070	STXBP2	Q15833	593 aa		13.55	□□□□□ -0.24
AREL1-208	ENST00000554070	LY6K	Q17RY6	165 aa		13.55	□□□□□ -0.24
AREL1-208	ENST00000554070	SLC35G1	Q2M3R5	365 aa		13.55	□□□□□ -0.24
AREL1-208	ENST00000554070	ARHGEF16	Q5VV41	709 aa		13.55	□□□□□ -0.24
AREL1-208	ENST00000554070	STOX1	Q6ZVD7	989 aa		13.55	□□□□□ -0.24
AREL1-208	ENST00000554070	CHST3	Q7LGC8	479 aa		13.55	□□□□□ -0.24
AREL1-208	ENST00000554070	OTOP2	Q7RTS6	562 aa		13.55	□□□□□ -0.24
AREL1-208	ENST00000554070	PHF6	Q8IWS0	365 aa	Known RBP eCLIP	13.55	□□□□□ -0.24
AREL1-208	ENST00000554070	AFG1L	Q8WV93	481 aa		13.55	□□□□□ -0.24
AREL1-208	ENST00000554070	VWCE	Q96DN2	955 aa		13.55	□□□□□ -0.24
AREL1-208	ENST00000554070	PXMP2	Q9NR77	195 aa		13.55	□□□□□ -0.24
AREL1-208	ENST00000554070	SCN10A	Q9Y5Y9	1956 aa		13.54	□□□□□ -0.24
AREL1-208	ENST00000554070	ERICH2	A1L162	156 aa		13.54	□□□□□ -0.24
AREL1-208	ENST00000554070	ZBTB5	O15062	677 aa		13.54	□□□□□ -0.24
AREL1-208	ENST00000554070	GH1	P01241	217 aa		13.54	□□□□□ -0.24
AREL1-208	ENST00000554070	NR3C2	P08235	984 aa		13.54	□□□□□ -0.24
AREL1-208	ENST00000554070	HSD17B4	P51659	736 aa		13.54	□□□□□ -0.24
AREL1-208	ENST00000554070	ARHGAP1	Q07960	439 aa		13.54	□□□□□ -0.24
AREL1-208	ENST00000554070	NFRKB	Q6P4R8	1299 aa		13.54	□□□□□ -0.24
AREL1-208	ENST00000554070	RALYL	Q86SE5	291 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
AREL1-208	ENST00000554070	HOMER1	Q86YM7	354 aa		13.54	□□□□□ -0.24
AREL1-208	ENST00000554070	RPUSD2	Q8IZ73	545 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
AREL1-208	ENST00000554070	NCOA7	Q8NI08	942 aa		13.54	□□□□□ -0.24
AREL1-208	ENST00000554070	MTIF3	Q9H2K0	278 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
AREL1-208	ENST00000554070	PCDHA1	Q9Y5I3	950 aa		13.54	□□□□□ -0.24
AREL1-208	ENST00000554070	EIF3J	O75822	258 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
AREL1-208	ENST00000554070	MMP3	P08254	477 aa		13.53	□□□□□ -0.24
AREL1-208	ENST00000554070	HOXA13	P31271	388 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
AREL1-208	ENST00000554070	CHMP4BP1	P59074	171 aa		13.53	□□□□□ -0.24
AREL1-208	ENST00000554070	GHRHR	Q02643	423 aa		13.53	□□□□□ -0.24
AREL1-208	ENST00000554070	PTPN11	Q06124	597 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
AREL1-208	ENST00000554070	WTAP	Q15007	396 aa		13.53	□□□□□ -0.24
AREL1-208	ENST00000554070	MAP4K1	Q92918	833 aa		13.53	□□□□□ -0.24
AREL1-208	ENST00000554070	PIGS	Q96S52	555 aa		13.53	□□□□□ -0.24

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