RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551137.5

CS-223, Transcript of citrate synthase, human

TSL 3

Gene CS, Length 903 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-223	ENST00000551137	BAD	Q92934	168 aa		13.34	□□□□□ -0.27
CS-223	ENST00000551137	CCDC136	Q96JN2	1154 aa		13.34	□□□□□ -0.27
CS-223	ENST00000551137	TAAR1	Q96RJ0	339 aa		13.34	□□□□□ -0.27
CS-223	ENST00000551137	SPZ1	Q9BXG8	430 aa		13.34	□□□□□ -0.27
CS-223	ENST00000551137	ANO2	Q9NQ90	1003 aa		13.34	□□□□□ -0.27
CS-223	ENST00000551137		A6NJR5	290 aa		13.33	□□□□□ -0.28
CS-223	ENST00000551137	SH2B2	O14492	632 aa	Predicted RBP	13.33	□□□□□ -0.28
CS-223	ENST00000551137	PQBP1	O60828	265 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.28
CS-223	ENST00000551137	CD4	P01730	458 aa		13.33	□□□□□ -0.28
CS-223	ENST00000551137	ITGB8	P26012	769 aa		13.33	□□□□□ -0.28
CS-223	ENST00000551137	KIF5B	P33176	963 aa		13.33	□□□□□ -0.28
CS-223	ENST00000551137	CPT1A	P50416	773 aa		13.33	□□□□□ -0.28
CS-223	ENST00000551137	PPP2R5B	Q15173	497 aa		13.33	□□□□□ -0.28
CS-223	ENST00000551137	STXBP2	Q15833	593 aa		13.33	□□□□□ -0.28
CS-223	ENST00000551137	CASC1	Q6TDU7	716 aa		13.33	□□□□□ -0.28
CS-223	ENST00000551137	CXCL17	Q6UXB2	119 aa		13.33	□□□□□ -0.28
CS-223	ENST00000551137	SGMS1	Q86VZ5	419 aa		13.33	□□□□□ -0.28
CS-223	ENST00000551137	SKAP1	Q86WV1	359 aa		13.33	□□□□□ -0.28
CS-223	ENST00000551137	FAM126B	Q8IXS8	530 aa		13.33	□□□□□ -0.28
CS-223	ENST00000551137	ZNF654	Q8IZM8	581 aa		13.33	□□□□□ -0.28
CS-223	ENST00000551137	PIGS	Q96S52	555 aa		13.33	□□□□□ -0.28
CS-223	ENST00000551137	RMDN3	Q96TC7	470 aa		13.33	□□□□□ -0.28
CS-223	ENST00000551137	LZTS2	Q9BRK4	669 aa		13.33	□□□□□ -0.28
CS-223	ENST00000551137	PRDM5	Q9NQX1	630 aa	Predicted RBP	13.33	□□□□□ -0.28
CS-223	ENST00000551137	TMEM39A	Q9NV64	488 aa		13.33	□□□□□ -0.28
CS-223	ENST00000551137	POLR3E	Q9NVU0	708 aa		13.33	□□□□□ -0.28
CS-223	ENST00000551137	GRIN2D	O15399	1336 aa		13.33	□□□□□ -0.28
CS-223	ENST00000551137	KPNA6	O60684	536 aa		13.32	□□□□□ -0.28
CS-223	ENST00000551137	EIF3J	O75822	258 aa	Known RBP	13.32	□□□□□ -0.28
CS-223	ENST00000551137	TIMP1	P01033	207 aa		13.32	□□□□□ -0.28
CS-223	ENST00000551137	CALM1	P0DP23	149 aa		13.32	□□□□□ -0.28
CS-223	ENST00000551137	CALM2	P0DP24	149 aa		13.32	□□□□□ -0.28
CS-223	ENST00000551137	CALM3	P0DP25	149 aa		13.32	□□□□□ -0.28
CS-223	ENST00000551137	RAG1	P15918	1043 aa		13.32	□□□□□ -0.28
CS-223	ENST00000551137	GNAQ	P50148	359 aa		13.32	□□□□□ -0.28
CS-223	ENST00000551137	ITGA7	Q13683	1181 aa		13.32	□□□□□ -0.28
CS-223	ENST00000551137	TTLL4	Q14679	1199 aa		13.32	□□□□□ -0.28
CS-223	ENST00000551137	VTI1A	Q96AJ9	217 aa		13.32	□□□□□ -0.28
CS-223	ENST00000551137	GPHN	Q9NQX3	736 aa	Predicted RBP	13.32	□□□□□ -0.28
CS-223	ENST00000551137	PXMP2	Q9NR77	195 aa		13.32	□□□□□ -0.28
CS-223	ENST00000551137	SCN10A	Q9Y5Y9	1956 aa		13.31	□□□□□ -0.28
CS-223	ENST00000551137	CFB	P00751	764 aa		13.31	□□□□□ -0.28
CS-223	ENST00000551137	NR3C2	P08235	984 aa		13.31	□□□□□ -0.28
CS-223	ENST00000551137	TXN	P10599	105 aa	Known RBP	13.31	□□□□□ -0.28
CS-223	ENST00000551137	PTGS1	P23219	599 aa		13.31	□□□□□ -0.28
CS-223	ENST00000551137	PURA	Q00577	322 aa	Known RBP	13.31	□□□□□ -0.28
CS-223	ENST00000551137	EXOSC10	Q01780	885 aa	Known RBP	13.31	□□□□□ -0.28
CS-223	ENST00000551137	COL9A3	Q14050	684 aa	Predicted RBP	13.31	□□□□□ -0.28
CS-223	ENST00000551137	BRDT	Q58F21	947 aa	Predicted RBP	13.31	□□□□□ -0.28
CS-223	ENST00000551137	MFSD5	Q6N075	450 aa		13.31	□□□□□ -0.28
CS-223	ENST00000551137	CTCFL	Q8NI51	663 aa	Predicted RBP	13.31	□□□□□ -0.28
CS-223	ENST00000551137	KCNB2	Q92953	911 aa		13.31	□□□□□ -0.28
CS-223	ENST00000551137	LRCH3	Q96II8	777 aa		13.31	□□□□□ -0.28
CS-223	ENST00000551137	NEK1	Q96PY6	1258 aa		13.31	□□□□□ -0.28
CS-223	ENST00000551137	GCOM1	H8Y6P7	765 aa	Predicted RBP	13.3	□□□□□ -0.28
CS-223	ENST00000551137	TLR3	O15455	904 aa	Known RBP	13.3	□□□□□ -0.28
CS-223	ENST00000551137	ARIH2	O95376	493 aa		13.3	□□□□□ -0.28
CS-223	ENST00000551137	POLR2M	P0CAP2	368 aa		13.3	□□□□□ -0.28
CS-223	ENST00000551137	KRT32	Q14532	448 aa		13.3	□□□□□ -0.28
CS-223	ENST00000551137	SHH	Q15465	462 aa		13.3	□□□□□ -0.28
CS-223	ENST00000551137	ARHGEF16	Q5VV41	709 aa		13.3	□□□□□ -0.28
CS-223	ENST00000551137	FAM109B	Q6ICB4	259 aa	Predicted RBP	13.3	□□□□□ -0.28
CS-223	ENST00000551137	VSIG10L	Q86VR7	867 aa		13.3	□□□□□ -0.28
CS-223	ENST00000551137	HOMER1	Q86YM7	354 aa		13.3	□□□□□ -0.28
CS-223	ENST00000551137	OR6J1	Q8NGC5	347 aa		13.3	□□□□□ -0.28
CS-223	ENST00000551137	EMID1	Q96A84	441 aa	Predicted RBP	13.3	□□□□□ -0.28
CS-223	ENST00000551137	PDCD2L	Q9BRP1	358 aa		13.3	□□□□□ -0.28
CS-223	ENST00000551137	KIAA1217	Q5T5P2	1943 aa		13.3	□□□□□ -0.28
CS-223	ENST00000551137	CCDC69	A6NI79	296 aa		13.29	□□□□□ -0.28
CS-223	ENST00000551137	PIK3CD	O00329	1044 aa		13.29	□□□□□ -0.28
CS-223	ENST00000551137	EPB41L2	O43491	1005 aa	Known RBP	13.29	□□□□□ -0.28
CS-223	ENST00000551137	GH1	P01241	217 aa		13.29	□□□□□ -0.28
CS-223	ENST00000551137	HMGB1	P09429	215 aa	Known RBP	13.29	□□□□□ -0.28
CS-223	ENST00000551137	TGFB3	P10600	412 aa		13.29	□□□□□ -0.28
CS-223	ENST00000551137	FPGS	Q05932	587 aa		13.29	□□□□□ -0.28
CS-223	ENST00000551137	ERICH6B	Q5W0A0	696 aa		13.29	□□□□□ -0.28
CS-223	ENST00000551137	KCNV1	Q6PIU1	500 aa		13.29	□□□□□ -0.28
CS-223	ENST00000551137	DHX32	Q7L7V1	743 aa	Known RBP	13.29	□□□□□ -0.28
CS-223	ENST00000551137	RASEF	Q8IZ41	740 aa		13.29	□□□□□ -0.28
CS-223	ENST00000551137	SRBD1	Q8N5C6	995 aa	Known RBP	13.29	□□□□□ -0.28
CS-223	ENST00000551137	FANCB	Q8NB91	859 aa		13.29	□□□□□ -0.28
CS-223	ENST00000551137	RRP36	Q96EU6	259 aa	Known RBP	13.29	□□□□□ -0.28
CS-223	ENST00000551137	MTG1	Q9BT17	334 aa	Predicted RBP	13.29	□□□□□ -0.28
CS-223	ENST00000551137	DDX41	Q9UJV9	622 aa	Known RBP	13.29	□□□□□ -0.28
CS-223	ENST00000551137	SLC12A7	Q9Y666	1083 aa		13.29	□□□□□ -0.28
CS-223	ENST00000551137	FRMPD4	Q14CM0	1322 aa		13.29	□□□□□ -0.28
CS-223	ENST00000551137	RGS20	O76081	388 aa		13.28	□□□□□ -0.28
CS-223	ENST00000551137	HOXD8	P13378	290 aa	Predicted RBP	13.28	□□□□□ -0.28
CS-223	ENST00000551137	EIF2AK2	P19525	551 aa	Known RBP	13.28	□□□□□ -0.28
CS-223	ENST00000551137	HOXA13	P31271	388 aa	Predicted RBP	13.28	□□□□□ -0.28
CS-223	ENST00000551137	RCAN1	P53805	252 aa		13.28	□□□□□ -0.28
CS-223	ENST00000551137	EPHB4	P54760	987 aa		13.28	□□□□□ -0.28
CS-223	ENST00000551137	PTPN11	Q06124	597 aa	Predicted RBP	13.28	□□□□□ -0.28
CS-223	ENST00000551137	ARHGAP1	Q07960	439 aa		13.28	□□□□□ -0.28
CS-223	ENST00000551137	PGM5	Q15124	567 aa		13.28	□□□□□ -0.28
CS-223	ENST00000551137	C9orf50	Q5SZB4	431 aa		13.28	□□□□□ -0.28
CS-223	ENST00000551137	NFRKB	Q6P4R8	1299 aa		13.28	□□□□□ -0.28
CS-223	ENST00000551137	NFXL1	Q6ZNB6	911 aa		13.28	□□□□□ -0.28
CS-223	ENST00000551137	SEPT14	Q6ZU15	432 aa		13.28	□□□□□ -0.28
CS-223	ENST00000551137	TEX2	Q8IWB9	1127 aa		13.28	□□□□□ -0.28

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