RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544584.1

CLSTN3-215, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 546 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-215ENST00000544584 UBA5Q9GZZ9 404 aa6.48□□□□□ -1.37
CLSTN3-215ENST00000544584 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
CLSTN3-215ENST00000544584 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
CLSTN3-215ENST00000544584 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
CLSTN3-215ENST00000544584 PHF24Q9UPV7 400 aa6.48□□□□□ -1.37
CLSTN3-215ENST00000544584 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa6.48□□□□□ -1.37
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF536O15090 1300 aa6.48□□□□□ -1.37
CLSTN3-215ENST00000544584 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
CLSTN3-215ENST00000544584 SLC27A2O14975 620 aa6.47□□□□□ -1.37
CLSTN3-215ENST00000544584 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
CLSTN3-215ENST00000544584 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
CLSTN3-215ENST00000544584 PGK1P00558 417 aa6.47□□□□□ -1.37
CLSTN3-215ENST00000544584 CFBP00751 764 aa6.47□□□□□ -1.37
CLSTN3-215ENST00000544584 TGFB3P10600 412 aa6.47□□□□□ -1.37
CLSTN3-215ENST00000544584 ADCYAP1R1P41586 468 aa6.47□□□□□ -1.37
CLSTN3-215ENST00000544584 ACLYP53396 1101 aa6.47□□□□□ -1.37
CLSTN3-215ENST00000544584 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
CLSTN3-215ENST00000544584 RTP1P59025 263 aa6.47□□□□□ -1.37
CLSTN3-215ENST00000544584 RPS6P62753 249 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
CLSTN3-215ENST00000544584 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
CLSTN3-215ENST00000544584 NECTIN1Q15223 517 aa6.47□□□□□ -1.37
CLSTN3-215ENST00000544584 SEC23AQ15436 765 aa6.47□□□□□ -1.37
CLSTN3-215ENST00000544584 KCNA10Q16322 511 aa6.47□□□□□ -1.37
CLSTN3-215ENST00000544584 DUSP28Q4G0W2 176 aa6.47□□□□□ -1.37
CLSTN3-215ENST00000544584 MUM1L1Q5H9M0 696 aa6.47□□□□□ -1.37
CLSTN3-215ENST00000544584 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
CLSTN3-215ENST00000544584 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa6.47□□□□□ -1.37
CLSTN3-215ENST00000544584 HOMER1Q86YM7 354 aa6.47□□□□□ -1.37
CLSTN3-215ENST00000544584 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
CLSTN3-215ENST00000544584 TRPV1Q8NER1 839 aa6.47□□□□□ -1.37
CLSTN3-215ENST00000544584 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa6.47□□□□□ -1.37
CLSTN3-215ENST00000544584 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa6.47□□□□□ -1.37
CLSTN3-215ENST00000544584 MORC4Q8TE76 937 aa6.47□□□□□ -1.37
CLSTN3-215ENST00000544584 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
CLSTN3-215ENST00000544584 LRFN3Q9BTN0 628 aa6.47□□□□□ -1.37
CLSTN3-215ENST00000544584 KATNAL1Q9BW62 490 aa6.47□□□□□ -1.37
CLSTN3-215ENST00000544584 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
CLSTN3-215ENST00000544584 RIOX1Q9H6W3 641 aa6.47□□□□□ -1.37
CLSTN3-215ENST00000544584 JMJD4Q9H9V9 463 aa6.47□□□□□ -1.37
CLSTN3-215ENST00000544584 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
CLSTN3-215ENST00000544584 MAD2L2Q9UI95 211 aa6.47□□□□□ -1.37
CLSTN3-215ENST00000544584 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
CLSTN3-215ENST00000544584 PLXNB2O15031 1838 aa6.47□□□□□ -1.37
CLSTN3-215ENST00000544584 A0A0G2JMZ2 1700 aa6.47□□□□□ -1.37
CLSTN3-215ENST00000544584 FRMPD3Q5JV73 1810 aa6.46□□□□□ -1.37
CLSTN3-215ENST00000544584 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 A0A1W2PQY0 241 aa6.46□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 SPDYE3A6NKU9 549 aa6.46□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 NFIBO00712 420 aa6.46□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 MAFGO15525 162 aa6.46□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 ZBTB43O43298 467 aa6.46□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 ASGR1P07306 291 aa6.46□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 CLTBP09497 229 aa6.46□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 TXNP10599 105 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 RAG1P15918 1043 aa6.46□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 CASTP20810 708 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 CCND2P30279 289 aa6.46□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 SNAP25P60880 206 aa6.46□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 TROAPQ12815 778 aa6.46□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 LAMC2Q13753 1193 aa6.46□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 DGKDQ16760 1214 aa6.46□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 ANO1Q5XXA6 986 aa6.46□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 CYB5R4Q7L1T6 521 aa6.46□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa6.46□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 NLRX1Q86UT6 975 aa6.46□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 SGMS1Q86VZ5 419 aa6.46□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 TMEM199Q8N511 208 aa6.46□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 CCDC155Q8N6L0 562 aa6.46□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 FANCBQ8NB91 859 aa6.46□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 IL27Q8NEV9 243 aa6.46□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 BICD2Q8TD16 824 aa6.46□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 ASB2Q96Q27 587 aa6.46□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 LY9Q9HBG7 655 aa6.46□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 TMEM39AQ9NV64 488 aa6.46□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa6.46□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 MRVI1Q9Y6F6 885 aa6.46□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 RLFQ13129 1914 aa6.46□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa6.46□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 SOWAHBA6NEL2 793 aa6.45□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 ARVCFO00192 962 aa6.45□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 CPLX1O14810 134 aa6.45□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 ADAMTS4O75173 837 aa6.45□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 CDKL5O76039 1030 aa6.45□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 PARNO95453 639 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 FOSP01100 380 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 GH1P01241 217 aa6.45□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 NR3C2P08235 984 aa6.45□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 XBP1P17861 261 aa6.45□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 MRE11P49959 708 aa6.45□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP6.45□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 HSD17B4P51659 736 aa6.45□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 NKX3-2P78367 333 aa6.45□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.8 ms