RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542777.1

DDX11-222, Transcript of DEAD/H-box helicase 11, human

TSL 2

Gene DDX11, Length 489 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDX11-222	ENST00000542777	NBPF20	Q3BBV1	942 aa		18.78	■□□□□ 0.6
DDX11-222	ENST00000542777	FAM47C	Q5HY64	1035 aa		18.78	■□□□□ 0.6
DDX11-222	ENST00000542777	ADGRF4	Q8IZF3	695 aa		18.78	■□□□□ 0.6
DDX11-222	ENST00000542777	USP38	Q8NB14	1042 aa		18.78	■□□□□ 0.6
DDX11-222	ENST00000542777	TBC1D5	Q92609	795 aa		18.78	■□□□□ 0.6
DDX11-222	ENST00000542777	DSCC1	Q9BVC3	393 aa		18.78	■□□□□ 0.6
DDX11-222	ENST00000542777	NKX2-4	Q9H2Z4	354 aa		18.78	■□□□□ 0.6
DDX11-222	ENST00000542777	PRDM12	Q9H4Q4	367 aa		18.78	■□□□□ 0.6
DDX11-222	ENST00000542777	ZSWIM5	Q9P217	1185 aa		18.78	■□□□□ 0.6
DDX11-222	ENST00000542777	GBF1	Q92538	1859 aa		18.77	■□□□□ 0.6
DDX11-222	ENST00000542777	ABCB11	O95342	1321 aa		18.77	■□□□□ 0.6
DDX11-222	ENST00000542777	EYS	Q5T1H1	3165 aa		18.77	■□□□□ 0.6
DDX11-222	ENST00000542777		A6NJR5	290 aa		18.77	■□□□□ 0.6
DDX11-222	ENST00000542777	TTLL4	Q14679	1199 aa		18.77	■□□□□ 0.6
DDX11-222	ENST00000542777	IMMT	Q16891	758 aa	Known RBP	18.77	■□□□□ 0.6
DDX11-222	ENST00000542777	ASPRV1	Q53RT3	343 aa		18.77	■□□□□ 0.6
DDX11-222	ENST00000542777	TAAR1	Q96RJ0	339 aa		18.77	■□□□□ 0.6
DDX11-222	ENST00000542777	MAF1	Q9H063	256 aa		18.77	■□□□□ 0.6
DDX11-222	ENST00000542777	CTNNA3	Q9UI47	895 aa		18.77	■□□□□ 0.6
DDX11-222	ENST00000542777	SLC4A7	Q9Y6M7	1214 aa		18.77	■□□□□ 0.6
DDX11-222	ENST00000542777	SCN10A	Q9Y5Y9	1956 aa		18.76	■□□□□ 0.59
DDX11-222	ENST00000542777	ARIH2	O95376	493 aa		18.76	■□□□□ 0.59
DDX11-222	ENST00000542777	ENAH	Q8N8S7	591 aa	Predicted RBP	18.76	■□□□□ 0.59
DDX11-222	ENST00000542777	PPP1R13L	Q8WUF5	828 aa		18.76	■□□□□ 0.59
DDX11-222	ENST00000542777	VWCE	Q96DN2	955 aa		18.76	■□□□□ 0.59
DDX11-222	ENST00000542777	SLC28A3	Q9HAS3	691 aa		18.76	■□□□□ 0.59
DDX11-222	ENST00000542777	VAT1L	Q9HCJ6	419 aa		18.76	■□□□□ 0.59
DDX11-222	ENST00000542777	YBX2	Q9Y2T7	364 aa	Known RBP	18.76	■□□□□ 0.59
DDX11-222	ENST00000542777	MYO9B	Q13459	2157 aa		18.76	■□□□□ 0.59
DDX11-222	ENST00000542777	MYH6	P13533	1939 aa		18.75	■□□□□ 0.59
DDX11-222	ENST00000542777	ZBBX	A8MT70	800 aa		18.75	■□□□□ 0.59
DDX11-222	ENST00000542777	DHX16	O60231	1041 aa	Known RBP	18.75	■□□□□ 0.59
DDX11-222	ENST00000542777	PFKM	P08237	780 aa		18.75	■□□□□ 0.59
DDX11-222	ENST00000542777	PARP1	P09874	1014 aa	Known RBP	18.75	■□□□□ 0.59
DDX11-222	ENST00000542777	QRICH1	Q2TAL8	776 aa		18.75	■□□□□ 0.59
DDX11-222	ENST00000542777	NFRKB	Q6P4R8	1299 aa		18.75	■□□□□ 0.59
DDX11-222	ENST00000542777	MCF2L2	Q86YR7	1114 aa		18.75	■□□□□ 0.59
DDX11-222	ENST00000542777	SYTL5	Q8TDW5	730 aa	Predicted RBP	18.75	■□□□□ 0.59
DDX11-222	ENST00000542777	PPM1E	Q8WY54	764 aa		18.75	■□□□□ 0.59
DDX11-222	ENST00000542777	KRT23	Q9C075	422 aa		18.75	■□□□□ 0.59
DDX11-222	ENST00000542777	RABGGTB	P53611	331 aa		18.74	■□□□□ 0.59
DDX11-222	ENST00000542777	PTPN11	Q06124	597 aa	Predicted RBP	18.74	■□□□□ 0.59
DDX11-222	ENST00000542777	CCDC62	Q6P9F0	684 aa		18.74	■□□□□ 0.59
DDX11-222	ENST00000542777	SEPT14	Q6ZU15	432 aa		18.74	■□□□□ 0.59
DDX11-222	ENST00000542777	DEFB128	Q7Z7B8	93 aa		18.74	■□□□□ 0.59
DDX11-222	ENST00000542777	FBXO11	Q86XK2	927 aa		18.74	■□□□□ 0.59
DDX11-222	ENST00000542777	NSUN6	Q8TEA1	469 aa	Known RBP	18.74	■□□□□ 0.59
DDX11-222	ENST00000542777	SYMPK	Q92797	1274 aa	Known RBP	18.74	■□□□□ 0.59
DDX11-222	ENST00000542777	CNNM2	Q9H8M5	875 aa		18.74	■□□□□ 0.59
DDX11-222	ENST00000542777	JMJD4	Q9H9V9	463 aa		18.74	■□□□□ 0.59
DDX11-222	ENST00000542777	COL20A1	Q9P218	1284 aa		18.74	■□□□□ 0.59
DDX11-222	ENST00000542777	MRPL11	Q9Y3B7	192 aa	Known RBP	18.74	■□□□□ 0.59
DDX11-222	ENST00000542777	SCN5A	Q14524	2016 aa		18.74	■□□□□ 0.59
DDX11-222	ENST00000542777	CHMP4BP1	P59074	171 aa		18.73	■□□□□ 0.59
DDX11-222	ENST00000542777	ADGRE1	Q14246	886 aa		18.73	■□□□□ 0.59
DDX11-222	ENST00000542777	STXBP2	Q15833	593 aa		18.73	■□□□□ 0.59
DDX11-222	ENST00000542777	LY6K	Q17RY6	165 aa		18.73	■□□□□ 0.59
DDX11-222	ENST00000542777	RETREG2	Q8NC44	543 aa		18.73	■□□□□ 0.59
DDX11-222	ENST00000542777	IWS1	Q96ST2	819 aa		18.73	■□□□□ 0.59
DDX11-222	ENST00000542777	RMDN3	Q96TC7	470 aa		18.73	■□□□□ 0.59
DDX11-222	ENST00000542777	UBAC1	Q9BSL1	405 aa		18.73	■□□□□ 0.59
DDX11-222	ENST00000542777	PRUNE2	Q8WUY3	3088 aa		18.72	■□□□□ 0.59
DDX11-222	ENST00000542777	GH1	P01241	217 aa		18.72	■□□□□ 0.59
DDX11-222	ENST00000542777	ATP2A2	P16615	1042 aa	Known RBP	18.72	■□□□□ 0.59
DDX11-222	ENST00000542777	IGFBP4	P22692	258 aa		18.72	■□□□□ 0.59
DDX11-222	ENST00000542777	IFIT1B	Q5T764	474 aa	Known RBP	18.72	■□□□□ 0.59
DDX11-222	ENST00000542777	ARHGEF16	Q5VV41	709 aa		18.72	■□□□□ 0.59
DDX11-222	ENST00000542777	AFG1L	Q8WV93	481 aa		18.72	■□□□□ 0.59
DDX11-222	ENST00000542777	PRDM6	Q9NQX0	595 aa		18.72	■□□□□ 0.59
DDX11-222	ENST00000542777	NOD1	Q9Y239	953 aa		18.72	■□□□□ 0.59
DDX11-222	ENST00000542777	PCDHA11	Q9Y5I1	949 aa		18.72	■□□□□ 0.59
DDX11-222	ENST00000542777	KIAA1217	Q5T5P2	1943 aa		18.72	■□□□□ 0.59
DDX11-222	ENST00000542777	PITPNM1	O00562	1244 aa		18.71	■□□□□ 0.59
DDX11-222	ENST00000542777	IQCF3	P0C7M6	154 aa		18.71	■□□□□ 0.59
DDX11-222	ENST00000542777	ACTN1	P12814	892 aa		18.71	■□□□□ 0.59
DDX11-222	ENST00000542777	MYOG	P15173	224 aa		18.71	■□□□□ 0.59
DDX11-222	ENST00000542777	RFC2	P35250	354 aa		18.71	■□□□□ 0.59
DDX11-222	ENST00000542777	TJAP1	Q5JTD0	557 aa		18.71	■□□□□ 0.59
DDX11-222	ENST00000542777	PPP2R2D	Q66LE6	453 aa		18.71	■□□□□ 0.59
DDX11-222	ENST00000542777	CHST3	Q7LGC8	479 aa		18.71	■□□□□ 0.59
DDX11-222	ENST00000542777	STAG2	Q8N3U4	1231 aa		18.71	■□□□□ 0.59
DDX11-222	ENST00000542777	IL25	Q9H293	177 aa		18.71	■□□□□ 0.59
DDX11-222	ENST00000542777	CFB	P00751	764 aa		18.7	■□□□□ 0.58
DDX11-222	ENST00000542777	MMP3	P08254	477 aa		18.7	■□□□□ 0.58
DDX11-222	ENST00000542777	EIF2AK2	P19525	551 aa	Known RBP	18.7	■□□□□ 0.58
DDX11-222	ENST00000542777	ARHGAP1	Q07960	439 aa		18.7	■□□□□ 0.58
DDX11-222	ENST00000542777	BFSP2	Q13515	415 aa		18.7	■□□□□ 0.58
DDX11-222	ENST00000542777	CCDC85B	Q15834	202 aa	Predicted RBP	18.7	■□□□□ 0.58
DDX11-222	ENST00000542777	AMN	Q9BXJ7	453 aa		18.7	■□□□□ 0.58
DDX11-222	ENST00000542777	KLRF2	D3W0D1	207 aa		18.69	■□□□□ 0.58
DDX11-222	ENST00000542777	EIF3J	O75822	258 aa	Known RBP	18.69	■□□□□ 0.58
DDX11-222	ENST00000542777	NR3C2	P08235	984 aa		18.69	■□□□□ 0.58
DDX11-222	ENST00000542777	CAST	P20810	708 aa	Known RBP	18.69	■□□□□ 0.58
DDX11-222	ENST00000542777	SEC23A	Q15436	765 aa		18.69	■□□□□ 0.58
DDX11-222	ENST00000542777	PTGIS	Q16647	500 aa		18.69	■□□□□ 0.58
DDX11-222	ENST00000542777	CYB5R4	Q7L1T6	521 aa		18.69	■□□□□ 0.58
DDX11-222	ENST00000542777	FTO	Q9C0B1	505 aa	Known RBP eCLIP	18.69	■□□□□ 0.58
DDX11-222	ENST00000542777	PXMP2	Q9NR77	195 aa		18.69	■□□□□ 0.58
DDX11-222	ENST00000542777	DDX41	Q9UJV9	622 aa	Known RBP	18.69	■□□□□ 0.58
DDX11-222	ENST00000542777	TRIP12	Q14669	1992 aa	Predicted RBP	18.69	■□□□□ 0.58

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