RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539589.5

PACSIN3-211, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene PACSIN3, Length 2,009 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-211ENST00000539589 MYL1P05976 194 aa22.8■■□□□ 1.24
PACSIN3-211ENST00000539589 PTPRAP18433 802 aa22.8■■□□□ 1.24
PACSIN3-211ENST00000539589 SCN4AP35499 1836 aa22.8■■□□□ 1.24
PACSIN3-211ENST00000539589 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa22.8■■□□□ 1.24
PACSIN3-211ENST00000539589 PARP14Q460N5 1801 aa22.8■■□□□ 1.24
PACSIN3-211ENST00000539589 MYRIPQ8NFW9 859 aa22.8■■□□□ 1.24
PACSIN3-211ENST00000539589 CUL5Q93034 780 aa22.8■■□□□ 1.24
PACSIN3-211ENST00000539589 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
PACSIN3-211ENST00000539589 PSTPIP2Q9H939 334 aa22.8■■□□□ 1.24
PACSIN3-211ENST00000539589 KCND1Q9NSA2 647 aa22.8■■□□□ 1.24
PACSIN3-211ENST00000539589 GRIN3BO60391 1043 aa22.79■■□□□ 1.24
PACSIN3-211ENST00000539589 RPN1P04843 607 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
PACSIN3-211ENST00000539589 EPHX2P34913 555 aa22.79■■□□□ 1.24
PACSIN3-211ENST00000539589 USH1GQ495M9 461 aa22.79■■□□□ 1.24
PACSIN3-211ENST00000539589 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
PACSIN3-211ENST00000539589 CHURC1Q8WUH1 139 aa22.79■■□□□ 1.24
PACSIN3-211ENST00000539589 KIFC2Q96AC6 838 aa22.79■■□□□ 1.24
PACSIN3-211ENST00000539589 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
PACSIN3-211ENST00000539589 EMILIN3Q9NT22 766 aa22.79■■□□□ 1.24
PACSIN3-211ENST00000539589 POTECB2RU33 542 aa22.79■■□□□ 1.24
PACSIN3-211ENST00000539589 USP17L15C9J2P7 530 aa22.79■■□□□ 1.24
PACSIN3-211ENST00000539589 USP17L13C9JLJ4 530 aa22.79■■□□□ 1.24
PACSIN3-211ENST00000539589 USP17L11C9JVI0 530 aa22.79■■□□□ 1.24
PACSIN3-211ENST00000539589 USP17L18D6R9N7 530 aa22.79■■□□□ 1.24
PACSIN3-211ENST00000539589 USP17L22D6RA61 530 aa22.79■■□□□ 1.24
PACSIN3-211ENST00000539589 USP17L17D6RBQ6 530 aa22.79■■□□□ 1.24
PACSIN3-211ENST00000539589 USP17L19D6RCP7 530 aa22.79■■□□□ 1.24
PACSIN3-211ENST00000539589 USP17L20D6RJB6 530 aa22.79■■□□□ 1.24
PACSIN3-211ENST00000539589 USP17L24Q0WX57 530 aa22.79■■□□□ 1.24
PACSIN3-211ENST00000539589 SPP2Q13103 211 aa22.79■■□□□ 1.24
PACSIN3-211ENST00000539589 MTMR2Q13614 643 aa22.79■■□□□ 1.24
PACSIN3-211ENST00000539589 NAALADL2Q58DX5 795 aa22.79■■□□□ 1.24
PACSIN3-211ENST00000539589 USP17L6PQ6QN14 398 aa22.79■■□□□ 1.24
PACSIN3-211ENST00000539589 WDR18Q9BV38 432 aa22.79■■□□□ 1.24
PACSIN3-211ENST00000539589 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
PACSIN3-211ENST00000539589 CUEDC2Q9H467 287 aa22.79■■□□□ 1.24
PACSIN3-211ENST00000539589 INTS13Q9NVM9 706 aa22.79■■□□□ 1.24
PACSIN3-211ENST00000539589 OPLAHO14841 1288 aa22.78■■□□□ 1.24
PACSIN3-211ENST00000539589 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
PACSIN3-211ENST00000539589 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
PACSIN3-211ENST00000539589 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP22.78■■□□□ 1.246e-7■■□□□ 13.1
PACSIN3-211ENST00000539589 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
PACSIN3-211ENST00000539589 MAGEF1Q9HAY2 307 aa22.78■■□□□ 1.24
PACSIN3-211ENST00000539589 FEM1BQ9UK73 627 aa22.78■■□□□ 1.24
PACSIN3-211ENST00000539589 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
PACSIN3-211ENST00000539589 TNNT1P13805 278 aa22.77■■□□□ 1.24
PACSIN3-211ENST00000539589 KCNJ6P48051 423 aa22.77■■□□□ 1.24
PACSIN3-211ENST00000539589 STX17P56962 302 aa22.77■■□□□ 1.24
PACSIN3-211ENST00000539589 CABP7Q86V35 215 aa22.77■■□□□ 1.24
PACSIN3-211ENST00000539589 SULF1Q8IWU6 871 aa22.77■■□□□ 1.24
PACSIN3-211ENST00000539589 CCDC112Q8NEF3 446 aa22.77■■□□□ 1.24
PACSIN3-211ENST00000539589 MEIS2O14770 477 aa22.77■■□□□ 1.24
PACSIN3-211ENST00000539589 WDR46O15213 610 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
PACSIN3-211ENST00000539589 SEMA3FQ13275 785 aa22.77■■□□□ 1.24
PACSIN3-211ENST00000539589 FAM160B2Q86V87 743 aa22.77■■□□□ 1.24
PACSIN3-211ENST00000539589 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
PACSIN3-211ENST00000539589 LPAR1Q92633 364 aa22.77■■□□□ 1.24
PACSIN3-211ENST00000539589 PICK1Q9NRD5 415 aa22.77■■□□□ 1.24
PACSIN3-211ENST00000539589 RLFQ13129 1914 aa22.77■■□□□ 1.23
PACSIN3-211ENST00000539589 DYNC1I1O14576 645 aa22.76■■□□□ 1.23
PACSIN3-211ENST00000539589 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
PACSIN3-211ENST00000539589 CCDC174Q6PII3 467 aa22.76■■□□□ 1.23
PACSIN3-211ENST00000539589 KRT26Q7Z3Y9 468 aa22.76■■□□□ 1.23
PACSIN3-211ENST00000539589 KBTBD4Q9NVX7 518 aa22.76■■□□□ 1.23
PACSIN3-211ENST00000539589 ZHX2Q9Y6X8 837 aa22.76■■□□□ 1.23
PACSIN3-211ENST00000539589 BACE1P56817 501 aa22.75■■□□□ 1.23
PACSIN3-211ENST00000539589 CDKAL1Q5VV42 579 aa22.75■■□□□ 1.23
PACSIN3-211ENST00000539589 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa22.75■■□□□ 1.23
PACSIN3-211ENST00000539589 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
PACSIN3-211ENST00000539589 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF280CQ8ND82 737 aa22.75■■□□□ 1.23
PACSIN3-211ENST00000539589 CTAGE1Q96RT6 745 aa22.75■■□□□ 1.23
PACSIN3-211ENST00000539589 RWDD2AQ9UIY3 292 aa22.75■■□□□ 1.23
PACSIN3-211ENST00000539589 CTNND2Q9UQB3 1225 aa22.75■■□□□ 1.23
PACSIN3-211ENST00000539589 WDR90Q96KV7 1748 aa22.75■■□□□ 1.23
PACSIN3-211ENST00000539589 PTPRFP10586 1907 aa22.75■■□□□ 1.23
PACSIN3-211ENST00000539589 VCAM1P19320 739 aa22.75■■□□□ 1.23
PACSIN3-211ENST00000539589 TECP42680 631 aa22.75■■□□□ 1.23
PACSIN3-211ENST00000539589 NR1I3Q14994 352 aa22.75■■□□□ 1.23
PACSIN3-211ENST00000539589 CALCRLQ16602 461 aa22.75■■□□□ 1.23
PACSIN3-211ENST00000539589 POTEDQ86YR6 584 aa22.75■■□□□ 1.23
PACSIN3-211ENST00000539589 GLT8D2Q9H1C3 349 aa22.75■■□□□ 1.23
PACSIN3-211ENST00000539589 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
PACSIN3-211ENST00000539589 A0A1B0GTH6 734 aa22.74■■□□□ 1.23
PACSIN3-211ENST00000539589 USP27XA6NNY8 438 aa22.74■■□□□ 1.23
PACSIN3-211ENST00000539589 PAK1Q13153 545 aa22.74■■□□□ 1.23
PACSIN3-211ENST00000539589 KCNB1Q14721 858 aa22.74■■□□□ 1.23
PACSIN3-211ENST00000539589 IGSF22Q8N9C0 903 aa22.74■■□□□ 1.23
PACSIN3-211ENST00000539589 MTMR9Q96QG7 549 aa22.74■■□□□ 1.23
PACSIN3-211ENST00000539589 PLIN2Q99541 437 aa22.74■■□□□ 1.23
PACSIN3-211ENST00000539589 PLCG1P19174 1290 aa22.74■■□□□ 1.23
PACSIN3-211ENST00000539589 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
PACSIN3-211ENST00000539589 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
PACSIN3-211ENST00000539589 AS3MTQ9HBK9 375 aa22.74■■□□□ 1.23
PACSIN3-211ENST00000539589 TXKP42681 527 aa22.73■■□□□ 1.23
PACSIN3-211ENST00000539589 PTPN14Q15678 1187 aa22.73■■□□□ 1.23
PACSIN3-211ENST00000539589 TMEM266Q2M3C6 531 aa22.73■■□□□ 1.23
PACSIN3-211ENST00000539589 CALML4Q96GE6 196 aa22.73■■□□□ 1.23
PACSIN3-211ENST00000539589 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
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