RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532316.1

PKNOX2-AS1-201, Transcript of PKNOX2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene PKNOX2-AS1, Length 586 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 MCM5P33992 734 aa27.55■■■□□ 2
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 HSD17B4P51659 736 aa27.55■■■□□ 2
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 ANTXR2P58335 489 aa27.55■■■□□ 2
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 ARHGEF16Q5VV41 709 aa27.55■■■□□ 2
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP27.55■■■□□ 2
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 MFSD5Q6N075 450 aa27.55■■■□□ 2
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 CHST3Q7LGC8 479 aa27.55■■■□□ 2
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 TBC1D5Q92609 795 aa27.55■■■□□ 2
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 TAAR1Q96RJ0 339 aa27.55■■■□□ 2
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 DDAH1O94760 285 aa27.54■■■□□ 2
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 CD4P01730 458 aa27.54■■■□□ 2
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 KIF5BP33176 963 aa27.54■■■□□ 2
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP27.54■■■□□ 2
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 C9orf50Q5SZB4 431 aa27.54■■■□□ 2
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 TMEM63BQ5T3F8 832 aa27.54■■■□□ 2
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 TMEM199Q8N511 208 aa27.54■■■□□ 2
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 TMEM87BQ96K49 555 aa27.54■■■□□ 2
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 ANO2Q9NQ90 1003 aa27.54■■■□□ 2
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 RNF20Q5VTR2 975 aa27.53■■■□□ 2
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 HOMER1Q86YM7 354 aa27.53■■■□□ 2
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP27.53■■■□□ 2
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 SENP2Q9HC62 589 aa27.53■■■□□ 2
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 COL20A1Q9P218 1284 aa27.53■■■□□ 2
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 MYH6P13533 1939 aa27.52■■■□□ 2
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa27.52■■■□□ 2
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 A6NJR5 290 aa27.52■■■□□ 2
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 SLC27A2O14975 620 aa27.52■■■□□ 2
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 PRC1O43663 620 aa27.52■■■□□ 2
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 PTGS1P23219 599 aa27.52■■■□□ 2
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 PURAQ00577 322 aaKnown RBP27.52■■■□□ 2
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 PIGSQ96S52 555 aa27.52■■■□□ 2
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP27.52■■■□□ 2
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 LY9Q9HBG7 655 aa27.52■■■□□ 2
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP27.51■■□□□ 1.99
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP27.51■■□□□ 1.99
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP27.51■■□□□ 1.99
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 NECTIN1Q15223 517 aa27.51■■□□□ 1.99
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 CREB3L3Q68CJ9 461 aa27.51■■□□□ 1.99
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 ZNF654Q8IZM8 581 aa27.51■■□□□ 1.99
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP27.51■■□□□ 1.99
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 LZTS2Q9BRK4 669 aa27.51■■□□□ 1.99
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 PXMP2Q9NR77 195 aa27.51■■□□□ 1.99
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 GRIN2DO15399 1336 aa27.5■■□□□ 1.99
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 OPLAHO14841 1288 aa27.5■■□□□ 1.99
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 NR3C2P08235 984 aa27.5■■□□□ 1.99
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 MYL3P08590 195 aa27.5■■□□□ 1.99
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa27.5■■□□□ 1.99
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP27.5■■□□□ 1.99
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 SMARCA1P28370 1054 aa27.5■■□□□ 1.99
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PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 CCDC62Q6P9F0 684 aa27.5■■□□□ 1.99
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 CCDC69A6NI79 296 aa27.49■■□□□ 1.99
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP27.49■■□□□ 1.99
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 GH1P01241 217 aa27.49■■□□□ 1.99
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 POLR2MP0CAP2 368 aa27.49■■□□□ 1.99
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 CALM1P0DP23 149 aa27.49■■□□□ 1.99
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 CALM2P0DP24 149 aa27.49■■□□□ 1.99
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 CALM3P0DP25 149 aa27.49■■□□□ 1.99
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 LIFRP42702 1097 aa27.49■■□□□ 1.99
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 PSMC6P62333 389 aa27.49■■□□□ 1.99
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 NFXL1Q6ZNB6 911 aa27.49■■□□□ 1.99
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 SPZ1Q9BXG8 430 aa27.49■■□□□ 1.99
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 HIPK3Q9H422 1215 aa27.49■■□□□ 1.99
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 CYTH3O43739 400 aa27.48■■□□□ 1.99
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 EPHB4P54760 987 aa27.48■■□□□ 1.99
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 SEPT14Q6ZU15 432 aa27.48■■□□□ 1.99
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa27.48■■□□□ 1.99
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP27.48■■□□□ 1.99
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 MTMR10Q9NXD2 777 aa27.48■■□□□ 1.99
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP27.47■■□□□ 1.99
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 CDC45O75419 566 aa27.47■■□□□ 1.99
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 ARIH2O95376 493 aa27.47■■□□□ 1.99
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 SLC35G1Q2M3R5 365 aa27.47■■□□□ 1.99
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 ZNF697Q5TEC3 545 aa27.47■■□□□ 1.99
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP27.47■■□□□ 1.99
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 KCNV1Q6PIU1 500 aa27.47■■□□□ 1.99
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 Q7L0L9 218 aa27.47■■□□□ 1.99
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 COPS5Q92905 334 aa27.47■■□□□ 1.99
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP27.47■■□□□ 1.99
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 PDCD2LQ9BRP1 358 aa27.47■■□□□ 1.99
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 B4GALT4O60513 344 aa27.46■■□□□ 1.99
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP27.46■■□□□ 1.99
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 NFRKBQ6P4R8 1299 aa27.46■■□□□ 1.99
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 CCDC136Q96JN2 1154 aa27.46■■□□□ 1.99
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP27.46■■□□□ 1.99
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 CSF2RAP15509 400 aa27.45■■□□□ 1.98
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP27.45■■□□□ 1.98
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 TRPV6Q9H1D0 765 aa27.45■■□□□ 1.98
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 MRVI1Q9Y6F6 885 aa27.45■■□□□ 1.98
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP27.44■■□□□ 1.98
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 ARHGAP1Q07960 439 aa27.44■■□□□ 1.98
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 LY6KQ17RY6 165 aa27.44■■□□□ 1.98
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP27.44■■□□□ 1.98
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP27.44■■□□□ 1.98
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa27.44■■□□□ 1.98
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 SLC12A7Q9Y666 1083 aa27.44■■□□□ 1.98
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 TMEM265A0A087WTH1 108 aa27.43■■□□□ 1.98
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP27.43■■□□□ 1.98
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP27.43■■□□□ 1.98
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 CASTP20810 708 aaKnown RBP27.43■■□□□ 1.98
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