RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531226.5

PACSIN3-208, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 5

Gene PACSIN3, Length 654 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-208ENST00000531226 DNM1LO00429 736 aa21.91■■□□□ 1.1
PACSIN3-208ENST00000531226 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
PACSIN3-208ENST00000531226 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
PACSIN3-208ENST00000531226 ADCYAP1R1P41586 468 aa21.91■■□□□ 1.1
PACSIN3-208ENST00000531226 AK2P54819 239 aa21.91■■□□□ 1.1
PACSIN3-208ENST00000531226 ANKRD1Q15327 319 aa21.91■■□□□ 1.1
PACSIN3-208ENST00000531226 C22orf23Q9BZE7 217 aa21.91■■□□□ 1.1
PACSIN3-208ENST00000531226 PDGFCQ9NRA1 345 aa21.91■■□□□ 1.1
PACSIN3-208ENST00000531226 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
PACSIN3-208ENST00000531226 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
PACSIN3-208ENST00000531226 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa21.9■■□□□ 1.1
PACSIN3-208ENST00000531226 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
PACSIN3-208ENST00000531226 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
PACSIN3-208ENST00000531226 ADAMTS4O75173 837 aa21.9■■□□□ 1.1
PACSIN3-208ENST00000531226 IFNAR1P17181 557 aa21.9■■□□□ 1.1
PACSIN3-208ENST00000531226 TNFAIP2Q03169 654 aa21.9■■□□□ 1.1
PACSIN3-208ENST00000531226 LRRC41Q15345 812 aa21.9■■□□□ 1.1
PACSIN3-208ENST00000531226 IQSEC1Q6DN90 963 aa21.9■■□□□ 1.1
PACSIN3-208ENST00000531226 PPP1R18Q6NYC8 613 aa21.9■■□□□ 1.1
PACSIN3-208ENST00000531226 FCHSD1Q86WN1 690 aa21.9■■□□□ 1.1
PACSIN3-208ENST00000531226 CUL5Q93034 780 aa21.9■■□□□ 1.1
PACSIN3-208ENST00000531226 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
PACSIN3-208ENST00000531226 C11orf49Q9H6J7 331 aa21.9■■□□□ 1.1
PACSIN3-208ENST00000531226 FRMPD4Q14CM0 1322 aa21.89■■□□□ 1.1
PACSIN3-208ENST00000531226 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
PACSIN3-208ENST00000531226 MEIS2O14770 477 aa21.89■■□□□ 1.09
PACSIN3-208ENST00000531226 PGK1P00558 417 aa21.89■■□□□ 1.09
PACSIN3-208ENST00000531226 COL6A1P12109 1028 aa21.89■■□□□ 1.09
PACSIN3-208ENST00000531226 RBM25P49756 843 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
PACSIN3-208ENST00000531226 NEK4P51957 841 aa21.89■■□□□ 1.09
PACSIN3-208ENST00000531226 NAPAP54920 295 aa21.89■■□□□ 1.09
PACSIN3-208ENST00000531226 STK3Q13188 491 aa21.89■■□□□ 1.09
PACSIN3-208ENST00000531226 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
PACSIN3-208ENST00000531226 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
PACSIN3-208ENST00000531226 TYW1BQ6NUM6 668 aa21.89■■□□□ 1.09
PACSIN3-208ENST00000531226 USP17L6PQ6QN14 398 aa21.89■■□□□ 1.09
PACSIN3-208ENST00000531226 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa21.89■■□□□ 1.09
PACSIN3-208ENST00000531226 PHKBQ93100 1093 aa21.89■■□□□ 1.09
PACSIN3-208ENST00000531226 PDCD2LQ9BRP1 358 aa21.89■■□□□ 1.09
PACSIN3-208ENST00000531226 HTATIP2Q9BUP3 242 aa21.89■■□□□ 1.09
PACSIN3-208ENST00000531226 PSTPIP2Q9H939 334 aa21.89■■□□□ 1.09
PACSIN3-208ENST00000531226 BARHL2Q9NY43 387 aa21.89■■□□□ 1.09
PACSIN3-208ENST00000531226 TPCN1Q9ULQ1 816 aa21.89■■□□□ 1.09
PACSIN3-208ENST00000531226 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
PACSIN3-208ENST00000531226 DOCK5Q9H7D0 1870 aa21.88■■□□□ 1.09
PACSIN3-208ENST00000531226 KBTBD13C9JR72 458 aa21.88■■□□□ 1.09
PACSIN3-208ENST00000531226 STXBP3O00186 592 aa21.88■■□□□ 1.09
PACSIN3-208ENST00000531226 NR3C2P08235 984 aa21.88■■□□□ 1.09
PACSIN3-208ENST00000531226 SCG2P13521 617 aa21.88■■□□□ 1.09
PACSIN3-208ENST00000531226 SMPD1P17405 629 aa21.88■■□□□ 1.09
PACSIN3-208ENST00000531226 PGM5Q15124 567 aa21.88■■□□□ 1.09
PACSIN3-208ENST00000531226 STXBP2Q15833 593 aa21.88■■□□□ 1.09
PACSIN3-208ENST00000531226 RNF180Q86T96 592 aa21.88■■□□□ 1.09
PACSIN3-208ENST00000531226 KIF2CQ99661 725 aa21.88■■□□□ 1.09
PACSIN3-208ENST00000531226 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
PACSIN3-208ENST00000531226 CPLX1O14810 134 aa21.87■■□□□ 1.09
PACSIN3-208ENST00000531226 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
PACSIN3-208ENST00000531226 GJA9P57773 515 aa21.87■■□□□ 1.09
PACSIN3-208ENST00000531226 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
PACSIN3-208ENST00000531226 PKN1Q16512 942 aa21.87■■□□□ 1.09
PACSIN3-208ENST00000531226 SCFD2Q8WU76 684 aa21.87■■□□□ 1.09
PACSIN3-208ENST00000531226 SLC26A6Q9BXS9 759 aa21.87■■□□□ 1.09
PACSIN3-208ENST00000531226 WDR11Q9BZH6 1224 aa21.87■■□□□ 1.09
PACSIN3-208ENST00000531226 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
PACSIN3-208ENST00000531226 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
PACSIN3-208ENST00000531226 PFKFB2O60825 505 aa21.86■■□□□ 1.09
PACSIN3-208ENST00000531226 CST5P28325 142 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
PACSIN3-208ENST00000531226 NKX3-2P78367 333 aa21.86■■□□□ 1.09
PACSIN3-208ENST00000531226 SCRN1Q12765 414 aa21.86■■□□□ 1.09
PACSIN3-208ENST00000531226 DUSP28Q4G0W2 176 aa21.86■■□□□ 1.09
PACSIN3-208ENST00000531226 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
PACSIN3-208ENST00000531226 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
PACSIN3-208ENST00000531226 TLK2Q86UE8 772 aa21.86■■□□□ 1.09
PACSIN3-208ENST00000531226 TEX2Q8IWB9 1127 aa21.86■■□□□ 1.09
PACSIN3-208ENST00000531226 KLHDC9Q8NEP7 349 aa21.86■■□□□ 1.09
PACSIN3-208ENST00000531226 IL31RAQ8NI17 732 aa21.86■■□□□ 1.09
PACSIN3-208ENST00000531226 SPC25Q9HBM1 224 aa21.86■■□□□ 1.09
PACSIN3-208ENST00000531226 Q9Y3F1 56 aa21.86■■□□□ 1.09
PACSIN3-208ENST00000531226 MYADML2A6NDP7 307 aa21.85■■□□□ 1.09
PACSIN3-208ENST00000531226 PPFIA3O75145 1194 aa21.85■■□□□ 1.09
PACSIN3-208ENST00000531226 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
PACSIN3-208ENST00000531226 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
PACSIN3-208ENST00000531226 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
PACSIN3-208ENST00000531226 TMEM63BQ5T3F8 832 aa21.85■■□□□ 1.09
PACSIN3-208ENST00000531226 VSIG10LQ86VR7 867 aa21.85■■□□□ 1.09
PACSIN3-208ENST00000531226 TRIM22Q8IYM9 498 aa21.85■■□□□ 1.09
PACSIN3-208ENST00000531226 RIC8AQ9NPQ8 531 aa21.85■■□□□ 1.09
PACSIN3-208ENST00000531226 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP21.84■■□□□ 1.09
PACSIN3-208ENST00000531226 CTAGE5O15320 804 aa21.84■■□□□ 1.09
PACSIN3-208ENST00000531226 CCND2P30279 289 aa21.84■■□□□ 1.09
PACSIN3-208ENST00000531226 ADCY7P51828 1080 aa21.84■■□□□ 1.09
PACSIN3-208ENST00000531226 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
PACSIN3-208ENST00000531226 TTLL4Q14679 1199 aa21.84■■□□□ 1.09
PACSIN3-208ENST00000531226 UBE2SQ16763 222 aa21.84■■□□□ 1.09
PACSIN3-208ENST00000531226 SEPT14Q6ZU15 432 aa21.84■■□□□ 1.09
PACSIN3-208ENST00000531226 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
PACSIN3-208ENST00000531226 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
PACSIN3-208ENST00000531226 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
PACSIN3-208ENST00000531226 PHF24Q9UPV7 400 aa21.84■■□□□ 1.09
PACSIN3-208ENST00000531226 ESYT2A0FGR8 921 aa21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.3 ms