RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523628.5

HDAC2-216, Transcript of histone deacetylase 2, humanhuman

TSL 4

Gene HDAC2, Length 549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC2-216ENST00000523628 USP6P35125 1406 aa5.81□□□□□ -1.48
HDAC2-216ENST00000523628 CRB1P82279 1406 aa5.81□□□□□ -1.48
HDAC2-216ENST00000523628 CCDC7Q96M83 1385 aa5.8□□□□□ -1.48
HDAC2-216ENST00000523628 ACEP12821 1306 aa5.8□□□□□ -1.48
HDAC2-216ENST00000523628 LMO7Q8WWI1 1683 aa5.8□□□□□ -1.48
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HDAC2-216ENST00000523628 UPK3BL2E5RIL1 263 aa5.8□□□□□ -1.48
HDAC2-216ENST00000523628 ATE1O95260 518 aa5.8□□□□□ -1.48
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HDAC2-216ENST00000523628 TMEM253P0C7T8 217 aa5.8□□□□□ -1.48
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HDAC2-216ENST00000523628 RALGPS1Q5JS13 557 aa5.8□□□□□ -1.48
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HDAC2-216ENST00000523628 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
HDAC2-216ENST00000523628 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
HDAC2-216ENST00000523628 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
HDAC2-216ENST00000523628 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP5.8□□□□□ -1.482e-14■□□□□ 10.3
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HDAC2-216ENST00000523628 ZNF408Q9H9D4 720 aa5.8□□□□□ -1.48
HDAC2-216ENST00000523628 BTG4Q9NY30 223 aa5.8□□□□□ -1.48
HDAC2-216ENST00000523628 TERF2IPQ9NYB0 399 aa5.8□□□□□ -1.48
HDAC2-216ENST00000523628 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
HDAC2-216ENST00000523628 ZNRF3Q9ULT6 936 aa5.8□□□□□ -1.48
HDAC2-216ENST00000523628 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa5.8□□□□□ -1.48
HDAC2-216ENST00000523628 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa5.8□□□□□ -1.48
HDAC2-216ENST00000523628 OVOS2Q6IE36 1432 aa5.8□□□□□ -1.48
HDAC2-216ENST00000523628 AKAP12Q02952 1782 aa5.8□□□□□ -1.48
HDAC2-216ENST00000523628 KIF24Q5T7B8 1368 aa5.8□□□□□ -1.48
HDAC2-216ENST00000523628 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa5.79□□□□□ -1.48
HDAC2-216ENST00000523628 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa5.79□□□□□ -1.48
HDAC2-216ENST00000523628 ETV3P41162 512 aa5.79□□□□□ -1.48
HDAC2-216ENST00000523628 GIPRP48546 466 aa5.79□□□□□ -1.48
HDAC2-216ENST00000523628 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP5.79□□□□□ -1.48
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HDAC2-216ENST00000523628 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
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HDAC2-216ENST00000523628 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP5.78□□□□□ -1.48
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HDAC2-216ENST00000523628 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
HDAC2-216ENST00000523628 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
HDAC2-216ENST00000523628 LILRA6Q6PI73 481 aa5.78□□□□□ -1.48
HDAC2-216ENST00000523628 MON2Q7Z3U7 1717 aa5.78□□□□□ -1.48
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HDAC2-216ENST00000523628 MYLIPQ8WY64 445 aa5.78□□□□□ -1.48
HDAC2-216ENST00000523628 Q96M66 194 aa5.78□□□□□ -1.48
HDAC2-216ENST00000523628 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa5.78□□□□□ -1.48
HDAC2-216ENST00000523628 KCNK12Q9HB15 430 aa5.78□□□□□ -1.48
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HDAC2-216ENST00000523628 BRWD3Q6RI45 1802 aa5.78□□□□□ -1.48
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HDAC2-216ENST00000523628 CGNL1Q0VF96 1302 aa5.77□□□□□ -1.49
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HDAC2-216ENST00000523628 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
HDAC2-216ENST00000523628 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
HDAC2-216ENST00000523628 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
HDAC2-216ENST00000523628 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
HDAC2-216ENST00000523628 ADAMTS10Q9H324 1103 aa5.77□□□□□ -1.49
HDAC2-216ENST00000523628 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa5.77□□□□□ -1.49
HDAC2-216ENST00000523628 RTL1A6NKG5 1358 aa5.77□□□□□ -1.49
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