RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512855.5

FAM200B-218, Transcript of family with sequence similarity 200 member B, humanhuman

TSL 5

Gene FAM200B, Length 654 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM200B-218ENST00000512855 WDR11Q9BZH6 1224 aa26.29■■□□□ 1.8
FAM200B-218ENST00000512855 PRO3102Q9H379 93 aa26.29■■□□□ 1.8
FAM200B-218ENST00000512855 ASGR1P07306 291 aa26.28■■□□□ 1.8
FAM200B-218ENST00000512855 PTGS1P23219 599 aa26.28■■□□□ 1.8
FAM200B-218ENST00000512855 RCAN1P53805 252 aa26.28■■□□□ 1.8
FAM200B-218ENST00000512855 FBXL16Q8N461 479 aa26.28■■□□□ 1.8
FAM200B-218ENST00000512855 AP5M1Q9H0R1 490 aa26.28■■□□□ 1.8
FAM200B-218ENST00000512855 PXMP2Q9NR77 195 aa26.28■■□□□ 1.8
FAM200B-218ENST00000512855 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP26.28■■□□□ 1.8
FAM200B-218ENST00000512855 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP26.27■■□□□ 1.8
FAM200B-218ENST00000512855 ZBTB43O43298 467 aa26.27■■□□□ 1.8
FAM200B-218ENST00000512855 SYN1P17600 705 aa26.27■■□□□ 1.8
FAM200B-218ENST00000512855 RPS6KB1P23443 525 aa26.27■■□□□ 1.8
FAM200B-218ENST00000512855 PSMA5P28066 241 aa26.27■■□□□ 1.8
FAM200B-218ENST00000512855 ARHGEF16Q5VV41 709 aa26.27■■□□□ 1.8
FAM200B-218ENST00000512855 CHRDL2Q6WN34 429 aa26.27■■□□□ 1.8
FAM200B-218ENST00000512855 SCFD2Q8WU76 684 aa26.27■■□□□ 1.8
FAM200B-218ENST00000512855 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP26.27■■□□□ 1.8
FAM200B-218ENST00000512855 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa26.26■■□□□ 1.79
FAM200B-218ENST00000512855 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
FAM200B-218ENST00000512855 POLR2MP0CAP2 368 aa26.26■■□□□ 1.79
FAM200B-218ENST00000512855 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP26.26■■□□□ 1.79
FAM200B-218ENST00000512855 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
FAM200B-218ENST00000512855 BEX3Q00994 111 aa26.26■■□□□ 1.79
FAM200B-218ENST00000512855 STXBP2Q15833 593 aa26.26■■□□□ 1.79
FAM200B-218ENST00000512855 TRIM60Q495X7 471 aa26.26■■□□□ 1.79
FAM200B-218ENST00000512855 Q6ZUG5 572 aa26.26■■□□□ 1.79
FAM200B-218ENST00000512855 AGXT2Q9BYV1 514 aa26.26■■□□□ 1.79
FAM200B-218ENST00000512855 STARD7Q9NQZ5 370 aa26.26■■□□□ 1.79
FAM200B-218ENST00000512855 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa26.26■■□□□ 1.79
FAM200B-218ENST00000512855 ELP1O95163 1332 aa26.25■■□□□ 1.79
FAM200B-218ENST00000512855 NR3C2P08235 984 aa26.25■■□□□ 1.79
FAM200B-218ENST00000512855 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
FAM200B-218ENST00000512855 RTN1Q16799 776 aa26.25■■□□□ 1.79
FAM200B-218ENST00000512855 GLT1D1Q96MS3 346 aa26.25■■□□□ 1.79
FAM200B-218ENST00000512855 PDCD2LQ9BRP1 358 aa26.25■■□□□ 1.79
FAM200B-218ENST00000512855 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP26.25■■□□□ 1.79
FAM200B-218ENST00000512855 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa26.24■■□□□ 1.79
FAM200B-218ENST00000512855 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa26.24■■□□□ 1.79
FAM200B-218ENST00000512855 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP26.24■■□□□ 1.79
FAM200B-218ENST00000512855 CASTP20810 708 aaKnown RBP26.24■■□□□ 1.79
FAM200B-218ENST00000512855 FGD1P98174 961 aa26.24■■□□□ 1.79
FAM200B-218ENST00000512855 FUT2Q10981 343 aa26.24■■□□□ 1.79
FAM200B-218ENST00000512855 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP26.24■■□□□ 1.79
FAM200B-218ENST00000512855 CCDC82Q8N4S0 544 aa26.24■■□□□ 1.79
FAM200B-218ENST00000512855 GDF15Q99988 308 aa26.24■■□□□ 1.79
FAM200B-218ENST00000512855 DNAH12Q6ZR08 3092 aa26.24■■□□□ 1.79
FAM200B-218ENST00000512855 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
FAM200B-218ENST00000512855 APOBRQ0VD83 1088 aa26.23■■□□□ 1.79
FAM200B-218ENST00000512855 PPP2R5BQ15173 497 aa26.23■■□□□ 1.79
FAM200B-218ENST00000512855 CCDC62Q6P9F0 684 aa26.23■■□□□ 1.79
FAM200B-218ENST00000512855 BRF1Q92994 677 aa26.23■■□□□ 1.79
FAM200B-218ENST00000512855 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa26.23■■□□□ 1.79
FAM200B-218ENST00000512855 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
FAM200B-218ENST00000512855 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa26.22■■□□□ 1.79
FAM200B-218ENST00000512855 GOLGA8AA7E2F4 631 aa26.22■■□□□ 1.79
FAM200B-218ENST00000512855 GOLGA8BA8MQT2 603 aa26.22■■□□□ 1.79
FAM200B-218ENST00000512855 ARIH2O95376 493 aa26.22■■□□□ 1.79
FAM200B-218ENST00000512855 TXNP10599 105 aaKnown RBP26.22■■□□□ 1.79
FAM200B-218ENST00000512855 CDC27P30260 824 aa26.22■■□□□ 1.79
FAM200B-218ENST00000512855 TLE2Q04725 743 aa26.22■■□□□ 1.79
FAM200B-218ENST00000512855 TTLL4Q14679 1199 aa26.22■■□□□ 1.79
FAM200B-218ENST00000512855 PGM5Q15124 567 aa26.22■■□□□ 1.79
FAM200B-218ENST00000512855 TM6SF1Q9BZW5 370 aa26.22■■□□□ 1.79
FAM200B-218ENST00000512855 NID2Q14112 1375 aa26.21■■□□□ 1.79
FAM200B-218ENST00000512855 FRMPD4Q14CM0 1322 aa26.21■■□□□ 1.79
FAM200B-218ENST00000512855 PIK3CDO00329 1044 aa26.21■■□□□ 1.79
FAM200B-218ENST00000512855 ZEB2O60315 1214 aa26.21■■□□□ 1.79
FAM200B-218ENST00000512855 RUFY3Q7L099 469 aa26.21■■□□□ 1.79
FAM200B-218ENST00000512855 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa26.21■■□□□ 1.79
FAM200B-218ENST00000512855 VSIG10LQ86VR7 867 aa26.21■■□□□ 1.79
FAM200B-218ENST00000512855 FCHSD1Q86WN1 690 aa26.21■■□□□ 1.79
FAM200B-218ENST00000512855 MEIS2O14770 477 aa26.2■■□□□ 1.78
FAM200B-218ENST00000512855 CABYRO75952 493 aa26.2■■□□□ 1.78
FAM200B-218ENST00000512855 BMP8BP34820 402 aa26.2■■□□□ 1.78
FAM200B-218ENST00000512855 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP26.2■■□□□ 1.78
FAM200B-218ENST00000512855 CDK7P50613 346 aa26.2■■□□□ 1.78
FAM200B-218ENST00000512855 CXCL17Q6UXB2 119 aa26.2■■□□□ 1.78
FAM200B-218ENST00000512855 SEPT14Q6ZU15 432 aa26.2■■□□□ 1.78
FAM200B-218ENST00000512855 OR6J1Q8NGC5 347 aa26.2■■□□□ 1.78
FAM200B-218ENST00000512855 IL31RAQ8NI17 732 aa26.2■■□□□ 1.78
FAM200B-218ENST00000512855 COPS5Q92905 334 aa26.2■■□□□ 1.78
FAM200B-218ENST00000512855 TOX2Q96NM4 488 aa26.2■■□□□ 1.78
FAM200B-218ENST00000512855 PDLIM7Q9NR12 457 aa26.2■■□□□ 1.78
FAM200B-218ENST00000512855 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP26.19■■□□□ 1.78
FAM200B-218ENST00000512855 RGS20O76081 388 aa26.19■■□□□ 1.78
FAM200B-218ENST00000512855 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP26.19■■□□□ 1.78
FAM200B-218ENST00000512855 EVCP57679 992 aa26.19■■□□□ 1.78
FAM200B-218ENST00000512855 PCDH10Q9P2E7 1040 aa26.19■■□□□ 1.78
FAM200B-218ENST00000512855 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP26.18■■□□□ 1.78
FAM200B-218ENST00000512855 ADD1P35611 737 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
FAM200B-218ENST00000512855 CPT1AP50416 773 aa26.18■■□□□ 1.78
FAM200B-218ENST00000512855 USP17L6PQ6QN14 398 aa26.18■■□□□ 1.78
FAM200B-218ENST00000512855 CUL5Q93034 780 aa26.18■■□□□ 1.78
FAM200B-218ENST00000512855 VTI1AQ96AJ9 217 aa26.18■■□□□ 1.78
FAM200B-218ENST00000512855 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa26.18■■□□□ 1.78
FAM200B-218ENST00000512855 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP26.18■■□□□ 1.78
FAM200B-218ENST00000512855 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa26.18■■□□□ 1.78
FAM200B-218ENST00000512855 V9GY48 417 aaPredicted RBP26.18■■□□□ 1.78
FAM200B-218ENST00000512855 LTBP2Q14767 1821 aa26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.8 ms