RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498678.5

HOXB3-212, Transcript of homeobox B3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene HOXB3, Length 2,196 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-212ENST00000498678 TMEM266Q2M3C6 531 aa29.39■■■□□ 2.3
HOXB3-212ENST00000498678 STAMQ92783 540 aa29.39■■■□□ 2.3
HOXB3-212ENST00000498678 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP29.39■■■□□ 2.3
HOXB3-212ENST00000498678 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa29.39■■■□□ 2.3
HOXB3-212ENST00000498678 BECN2A8MW95 431 aa29.39■■■□□ 2.29
HOXB3-212ENST00000498678 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa29.39■■■□□ 2.29
HOXB3-212ENST00000498678 GRIN3BO60391 1043 aa29.39■■■□□ 2.29
HOXB3-212ENST00000498678 CASP1P29466 404 aa29.39■■■□□ 2.29
HOXB3-212ENST00000498678 MAP3K9P80192 1104 aa29.39■■■□□ 2.29
HOXB3-212ENST00000498678 MORC3Q14149 939 aa29.39■■■□□ 2.29
HOXB3-212ENST00000498678 PDIA5Q14554 519 aa29.39■■■□□ 2.29
HOXB3-212ENST00000498678 AOPEPQ8N6M6 819 aa29.39■■■□□ 2.29
HOXB3-212ENST00000498678 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP29.39■■■□□ 2.29
HOXB3-212ENST00000498678 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP29.39■■■□□ 2.29
HOXB3-212ENST00000498678 FCHSD1Q86WN1 690 aa29.38■■■□□ 2.29
HOXB3-212ENST00000498678 TRIML1Q8N9V2 468 aa29.38■■■□□ 2.29
HOXB3-212ENST00000498678 RASSF8Q8NHQ8 419 aa29.38■■■□□ 2.29
HOXB3-212ENST00000498678 LRWD1Q9UFC0 647 aa29.38■■■□□ 2.29
HOXB3-212ENST00000498678 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa29.38■■■□□ 2.29
HOXB3-212ENST00000498678 VGLL4Q14135 290 aa29.37■■■□□ 2.29
HOXB3-212ENST00000498678 PLIN2Q99541 437 aa29.37■■■□□ 2.29
HOXB3-212ENST00000498678 KCNMB3Q9NPA1 279 aa29.37■■■□□ 2.29
HOXB3-212ENST00000498678 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP29.36■■■□□ 2.29
HOXB3-212ENST00000498678 CYP3A4P08684 503 aa29.36■■■□□ 2.29
HOXB3-212ENST00000498678 CIITAP33076 1130 aa29.36■■■□□ 2.29
HOXB3-212ENST00000498678 RAB34Q9BZG1 259 aa29.36■■■□□ 2.29
HOXB3-212ENST00000498678 Q4G0T1 1027 aa29.36■■■□□ 2.29
HOXB3-212ENST00000498678 CPXCR1Q8N123 301 aa29.36■■■□□ 2.29
HOXB3-212ENST00000498678 LRRC15Q8TF66 581 aa29.36■■■□□ 2.29
HOXB3-212ENST00000498678 GJA10Q969M2 543 aa29.36■■■□□ 2.29
HOXB3-212ENST00000498678 GSDMAQ96QA5 445 aa29.36■■■□□ 2.29
HOXB3-212ENST00000498678 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP29.36■■■□□ 2.29
HOXB3-212ENST00000498678 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP29.35■■■□□ 2.29
HOXB3-212ENST00000498678 PLCG1P19174 1290 aa29.35■■■□□ 2.29
HOXB3-212ENST00000498678 CLEC4DQ8WXI8 215 aa29.35■■■□□ 2.29
HOXB3-212ENST00000498678 POTEMA6NI47 508 aa29.35■■■□□ 2.29
HOXB3-212ENST00000498678 FAM86B1E9PN63 330 aa29.35■■■□□ 2.29
HOXB3-212ENST00000498678 MARCH6O60337 910 aa29.35■■■□□ 2.29
HOXB3-212ENST00000498678 FAM86B2P0C5J1 330 aa29.35■■■□□ 2.29
HOXB3-212ENST00000498678 LENG9Q96B70 501 aa29.35■■■□□ 2.29
HOXB3-212ENST00000498678 PCDHA12Q9UN75 941 aa29.35■■■□□ 2.29
HOXB3-212ENST00000498678 VWA5AO00534 786 aa29.34■■■□□ 2.29
HOXB3-212ENST00000498678 FDX1P10109 184 aa29.34■■■□□ 2.29
HOXB3-212ENST00000498678 PRR16Q569H4 304 aa29.34■■■□□ 2.29
HOXB3-212ENST00000498678 BLZF1Q9H2G9 400 aa29.34■■■□□ 2.29
HOXB3-212ENST00000498678 ZBED4O75132 1171 aa29.33■■■□□ 2.29
HOXB3-212ENST00000498678 CUL4BQ13620 913 aa29.33■■■□□ 2.29
HOXB3-212ENST00000498678 MLKLQ8NB16 471 aa29.33■■■□□ 2.29
HOXB3-212ENST00000498678 ATG4CQ96DT6 458 aa29.33■■■□□ 2.29
HOXB3-212ENST00000498678 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP29.33■■■□□ 2.29
HOXB3-212ENST00000498678 CUEDC2Q9H467 287 aa29.33■■■□□ 2.29
HOXB3-212ENST00000498678 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP29.33■■■□□ 2.29
HOXB3-212ENST00000498678 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa29.33■■■□□ 2.29
HOXB3-212ENST00000498678 HSD17B4P51659 736 aa29.33■■■□□ 2.29
HOXB3-212ENST00000498678 ETNPPLQ8TBG4 499 aa29.33■■■□□ 2.29
HOXB3-212ENST00000498678 CDCA5Q96FF9 252 aa29.33■■■□□ 2.29
HOXB3-212ENST00000498678 KBTBD4Q9NVX7 518 aa29.33■■■□□ 2.29
HOXB3-212ENST00000498678 TMOD4Q9NZQ9 345 aa29.33■■■□□ 2.29
HOXB3-212ENST00000498678 NCAPHQ15003 741 aa29.32■■■□□ 2.28
HOXB3-212ENST00000498678 CALML4Q96GE6 196 aa29.32■■■□□ 2.28
HOXB3-212ENST00000498678 WNK4Q96J92 1243 aa29.32■■■□□ 2.28
HOXB3-212ENST00000498678 PARP14Q460N5 1801 aa29.32■■■□□ 2.28
HOXB3-212ENST00000498678 POTECB2RU33 542 aa29.32■■■□□ 2.28
HOXB3-212ENST00000498678 NFIBO00712 420 aa29.32■■■□□ 2.28
HOXB3-212ENST00000498678 ALAS1P13196 640 aa29.32■■■□□ 2.28
HOXB3-212ENST00000498678 SH3D19Q5HYK7 790 aa29.32■■■□□ 2.28
HOXB3-212ENST00000498678 UIMC1Q96RL1 719 aa29.32■■■□□ 2.28
HOXB3-212ENST00000498678 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP29.32■■■□□ 2.28
HOXB3-212ENST00000498678 CSADQ9Y600 493 aa29.32■■■□□ 2.28
HOXB3-212ENST00000498678 SMTNL1A8MU46 457 aa29.31■■■□□ 2.28
HOXB3-212ENST00000498678 IKBKBO14920 756 aa29.31■■■□□ 2.28
HOXB3-212ENST00000498678 TBX3O15119 743 aa29.31■■■□□ 2.28
HOXB3-212ENST00000498678 IREB2P48200 963 aaKnown RBP29.31■■■□□ 2.28
HOXB3-212ENST00000498678 GRB10Q13322 594 aa29.31■■■□□ 2.28
HOXB3-212ENST00000498678 SLFN12Q8IYM2 578 aa29.31■■■□□ 2.28
HOXB3-212ENST00000498678 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP29.31■■■□□ 2.28
HOXB3-212ENST00000498678 DSG3P32926 999 aa29.3■■■□□ 2.28
HOXB3-212ENST00000498678 GHRHRQ02643 423 aa29.3■■■□□ 2.28
HOXB3-212ENST00000498678 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa29.3■■■□□ 2.28
HOXB3-212ENST00000498678 PNMA5Q96PV4 448 aa29.3■■■□□ 2.28
HOXB3-212ENST00000498678 NUDT12Q9BQG2 462 aa29.3■■■□□ 2.28
HOXB3-212ENST00000498678 MAGEF1Q9HAY2 307 aa29.3■■■□□ 2.28
HOXB3-212ENST00000498678 PNMA2Q9UL42 364 aa29.3■■■□□ 2.28
HOXB3-212ENST00000498678 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa29.3■■■□□ 2.28
HOXB3-212ENST00000498678 IQCA1LA6NCM1 817 aa29.3■■■□□ 2.28
HOXB3-212ENST00000498678 RLFQ13129 1914 aa29.3■■■□□ 2.28
HOXB3-212ENST00000498678 KRT79Q5XKE5 535 aa29.3■■■□□ 2.28
HOXB3-212ENST00000498678 SARM1Q6SZW1 724 aa29.3■■■□□ 2.28
HOXB3-212ENST00000498678 MCF2L2Q86YR7 1114 aa29.3■■■□□ 2.28
HOXB3-212ENST00000498678 CYP2W1Q8TAV3 490 aa29.3■■■□□ 2.28
HOXB3-212ENST00000498678 EHMT1Q9H9B1 1298 aa29.3■■■□□ 2.28
HOXB3-212ENST00000498678 ZNF76P36508 570 aa29.29■■■□□ 2.28
HOXB3-212ENST00000498678 COG2Q14746 738 aa29.29■■■□□ 2.28
HOXB3-212ENST00000498678 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP29.29■■■□□ 2.28
HOXB3-212ENST00000498678 MUM1L1Q5H9M0 696 aa29.29■■■□□ 2.28
HOXB3-212ENST00000498678 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa29.29■■■□□ 2.28
HOXB3-212ENST00000498678 OTOFQ9HC10 1997 aa29.29■■■□□ 2.28
HOXB3-212ENST00000498678 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa29.29■■■□□ 2.28
HOXB3-212ENST00000498678 NF2P35240 595 aa29.29■■■□□ 2.28
HOXB3-212ENST00000498678 REPS2Q8NFH8 660 aa29.29■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14 ms