RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494420.1

HOXB-AS3-215, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 2

Gene HOXB-AS3, Length 431 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-215ENST00000494420 PRC1O43663 620 aa22.4■■□□□ 1.18
HOXB-AS3-215ENST00000494420 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
HOXB-AS3-215ENST00000494420 MYL3P08590 195 aa22.4■■□□□ 1.18
HOXB-AS3-215ENST00000494420 MCM5P33992 734 aa22.4■■□□□ 1.18
HOXB-AS3-215ENST00000494420 PSMC6P62333 389 aa22.4■■□□□ 1.18
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TRAF1Q13077 416 aa22.4■■□□□ 1.18
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TTLL4Q14679 1199 aa22.4■■□□□ 1.18
HOXB-AS3-215ENST00000494420 STXBP2Q15833 593 aa22.4■■□□□ 1.18
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CREB3L3Q68CJ9 461 aa22.4■■□□□ 1.18
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SEPT14Q6ZU15 432 aa22.4■■□□□ 1.18
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SLC43A3Q8NBI5 491 aa22.4■■□□□ 1.18
HOXB-AS3-215ENST00000494420 POLR3EQ9NVU0 708 aa22.4■■□□□ 1.18
HOXB-AS3-215ENST00000494420 LTBP2Q14767 1821 aa22.4■■□□□ 1.18
HOXB-AS3-215ENST00000494420 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
HOXB-AS3-215ENST00000494420 NECTIN1Q15223 517 aa22.39■■□□□ 1.17
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SLC35G1Q2M3R5 365 aa22.39■■□□□ 1.17
HOXB-AS3-215ENST00000494420 NFXL1Q6ZNB6 911 aa22.39■■□□□ 1.17
HOXB-AS3-215ENST00000494420 Q7L0L9 218 aa22.39■■□□□ 1.17
HOXB-AS3-215ENST00000494420 COPS5Q92905 334 aa22.39■■□□□ 1.17
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa22.39■■□□□ 1.17
HOXB-AS3-215ENST00000494420 LY9Q9HBG7 655 aa22.39■■□□□ 1.17
HOXB-AS3-215ENST00000494420 LAMA3Q16787 3333 aa22.38■■□□□ 1.17
HOXB-AS3-215ENST00000494420 GRIN2DO15399 1336 aa22.38■■□□□ 1.17
HOXB-AS3-215ENST00000494420 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa22.38■■□□□ 1.17
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CD4P01730 458 aa22.38■■□□□ 1.17
HOXB-AS3-215ENST00000494420 EPHB4P54760 987 aa22.38■■□□□ 1.17
HOXB-AS3-215ENST00000494420 MFSD5Q6N075 450 aa22.38■■□□□ 1.17
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TMTC2Q8N394 836 aa22.38■■□□□ 1.17
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
HOXB-AS3-215ENST00000494420 PIBF1Q8WXW3 757 aa22.38■■□□□ 1.17
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CCDC136Q96JN2 1154 aa22.38■■□□□ 1.17
HOXB-AS3-215ENST00000494420 MTA3Q9BTC8 594 aa22.38■■□□□ 1.17
HOXB-AS3-215ENST00000494420 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa22.38■■□□□ 1.17
HOXB-AS3-215ENST00000494420 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CCDC69A6NI79 296 aa22.37■■□□□ 1.17
HOXB-AS3-215ENST00000494420 OPLAHO14841 1288 aa22.37■■□□□ 1.17
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CYTH3O43739 400 aa22.37■■□□□ 1.17
HOXB-AS3-215ENST00000494420 NR3C2P08235 984 aa22.37■■□□□ 1.17
HOXB-AS3-215ENST00000494420 HSD17B4P51659 736 aa22.37■■□□□ 1.17
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ZNF654Q8IZM8 581 aa22.37■■□□□ 1.17
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TMEM87BQ96K49 555 aa22.37■■□□□ 1.17
HOXB-AS3-215ENST00000494420 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
HOXB-AS3-215ENST00000494420 MYL10Q9BUA6 226 aa22.37■■□□□ 1.17
HOXB-AS3-215ENST00000494420 PXMP2Q9NR77 195 aa22.37■■□□□ 1.17
HOXB-AS3-215ENST00000494420 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
HOXB-AS3-215ENST00000494420 DDAH1O94760 285 aa22.36■■□□□ 1.17
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ARIH2O95376 493 aa22.36■■□□□ 1.17
HOXB-AS3-215ENST00000494420 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
HOXB-AS3-215ENST00000494420 KIF5BP33176 963 aa22.36■■□□□ 1.17
HOXB-AS3-215ENST00000494420 PURAQ00577 322 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
HOXB-AS3-215ENST00000494420 LY6KQ17RY6 165 aa22.36■■□□□ 1.17
HOXB-AS3-215ENST00000494420 RNF20Q5VTR2 975 aa22.36■■□□□ 1.17
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TMEM199Q8N511 208 aa22.36■■□□□ 1.17
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SAMD3Q8N6K7 520 aa22.36■■□□□ 1.17
HOXB-AS3-215ENST00000494420 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
HOXB-AS3-215ENST00000494420 MAP3K14Q99558 947 aa22.36■■□□□ 1.17
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TRPV6Q9H1D0 765 aa22.36■■□□□ 1.17
HOXB-AS3-215ENST00000494420 A6NJR5 290 aa22.35■■□□□ 1.17
HOXB-AS3-215ENST00000494420 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
HOXB-AS3-215ENST00000494420 KPNA6O60684 536 aa22.35■■□□□ 1.17
HOXB-AS3-215ENST00000494420 POLR2MP0CAP2 368 aa22.35■■□□□ 1.17
HOXB-AS3-215ENST00000494420 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
HOXB-AS3-215ENST00000494420 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP22.35■■□□□ 1.17
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CCDC62Q6P9F0 684 aa22.35■■□□□ 1.17
HOXB-AS3-215ENST00000494420 MYH6P13533 1939 aa22.35■■□□□ 1.17
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CDC45O75419 566 aa22.34■■□□□ 1.17
HOXB-AS3-215ENST00000494420 GH1P01241 217 aa22.34■■□□□ 1.17
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CYP2C18P33260 490 aa22.34■■□□□ 1.17
HOXB-AS3-215ENST00000494420 GHRHRQ02643 423 aa22.34■■□□□ 1.17
HOXB-AS3-215ENST00000494420 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
HOXB-AS3-215ENST00000494420 HIPK3Q9H422 1215 aa22.34■■□□□ 1.17
HOXB-AS3-215ENST00000494420 B4GALT4O60513 344 aa22.33■■□□□ 1.17
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CSF2RAP15509 400 aa22.33■■□□□ 1.17
HOXB-AS3-215ENST00000494420 LIFRP42702 1097 aa22.33■■□□□ 1.17
HOXB-AS3-215ENST00000494420 GNAQP50148 359 aa22.33■■□□□ 1.17
HOXB-AS3-215ENST00000494420 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
HOXB-AS3-215ENST00000494420 FAM47CQ5HY64 1035 aa22.33■■□□□ 1.17
HOXB-AS3-215ENST00000494420 FCHSD1Q86WN1 690 aa22.33■■□□□ 1.17
HOXB-AS3-215ENST00000494420 LZTS2Q9BRK4 669 aa22.33■■□□□ 1.17
HOXB-AS3-215ENST00000494420 PDCD2LQ9BRP1 358 aa22.33■■□□□ 1.17
HOXB-AS3-215ENST00000494420 LRRC2Q9BYS8 371 aa22.33■■□□□ 1.17
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
HOXB-AS3-215ENST00000494420 MTMR10Q9NXD2 777 aa22.33■■□□□ 1.17
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CALM1P0DP23 149 aa22.32■■□□□ 1.16
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CALM2P0DP24 149 aa22.32■■□□□ 1.16
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CALM3P0DP25 149 aa22.32■■□□□ 1.16
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SMARCA1P28370 1054 aa22.32■■□□□ 1.16
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CHMP4BP1P59074 171 aa22.32■■□□□ 1.16
HOXB-AS3-215ENST00000494420 NBPF20Q3BBV1 942 aa22.32■■□□□ 1.16
HOXB-AS3-215ENST00000494420 AFG1LQ8WV93 481 aa22.32■■□□□ 1.16
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SPZ1Q9BXG8 430 aa22.32■■□□□ 1.16
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
HOXB-AS3-215ENST00000494420 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SLC12A7Q9Y666 1083 aa22.32■■□□□ 1.16
HOXB-AS3-215ENST00000494420 MRVI1Q9Y6F6 885 aa22.32■■□□□ 1.16
HOXB-AS3-215ENST00000494420 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa22.31■■□□□ 1.16
HOXB-AS3-215ENST00000494420 RXRAP19793 462 aa22.31■■□□□ 1.16
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ARHGAP1Q07960 439 aa22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.8 ms