RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489895.5

NISCH-213, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 5,350 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-213ENST00000489895 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP18.68■□□□□ 0.58
NISCH-213ENST00000489895 RASGRP4Q8TDF6 673 aa18.68■□□□□ 0.58
NISCH-213ENST00000489895 CCDC127Q96BQ5 260 aa18.68■□□□□ 0.58
NISCH-213ENST00000489895 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa18.68■□□□□ 0.58
NISCH-213ENST00000489895 MED10Q9BTT4 135 aa18.68■□□□□ 0.58
NISCH-213ENST00000489895 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP18.68■□□□□ 0.58
NISCH-213ENST00000489895 STAM2O75886 525 aa18.68■□□□□ 0.58
NISCH-213ENST00000489895 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP18.68■□□□□ 0.58
NISCH-213ENST00000489895 P2RX5Q93086 422 aa18.68■□□□□ 0.58
NISCH-213ENST00000489895 TBC1D31Q96DN5 1066 aa18.68■□□□□ 0.58
NISCH-213ENST00000489895 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa18.68■□□□□ 0.58
NISCH-213ENST00000489895 HAUS1Q96CS2 278 aa18.68■□□□□ 0.58
NISCH-213ENST00000489895 MNAT1P51948 309 aa18.67■□□□□ 0.58
NISCH-213ENST00000489895 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP18.67■□□□□ 0.58
NISCH-213ENST00000489895 CCDC110Q8TBZ0 833 aa18.67■□□□□ 0.58
NISCH-213ENST00000489895 GOLGA6BA6NDN3 693 aa18.67■□□□□ 0.58
NISCH-213ENST00000489895 SARNPP82979 210 aaKnown RBP18.67■□□□□ 0.58
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NISCH-213ENST00000489895 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa18.67■□□□□ 0.58
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NISCH-213ENST00000489895 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa18.67■□□□□ 0.58
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NISCH-213ENST00000489895 GOLGA6DP0CG33 693 aa18.67■□□□□ 0.58
NISCH-213ENST00000489895 ABCB4P21439 1286 aa18.67■□□□□ 0.58
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NISCH-213ENST00000489895 AP3B2Q13367 1082 aa18.67■□□□□ 0.58
NISCH-213ENST00000489895 ELF2Q15723 593 aa18.67■□□□□ 0.58
NISCH-213ENST00000489895 COA7Q96BR5 231 aa18.67■□□□□ 0.58
NISCH-213ENST00000489895 NBPF3Q9H094 633 aa18.67■□□□□ 0.58
NISCH-213ENST00000489895 CD209Q9NNX6 404 aa18.67■□□□□ 0.58
NISCH-213ENST00000489895 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa18.67■□□□□ 0.58
NISCH-213ENST00000489895 NR2F2P24468 414 aa18.67■□□□□ 0.58
NISCH-213ENST00000489895 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP18.67■□□□□ 0.58
NISCH-213ENST00000489895 PPFIA1Q13136 1202 aa18.67■□□□□ 0.58
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NISCH-213ENST00000489895 LRRC8AQ8IWT6 810 aa18.67■□□□□ 0.58
NISCH-213ENST00000489895 ANAPC4Q9UJX5 808 aa18.67■□□□□ 0.58
NISCH-213ENST00000489895 MYL7Q01449 175 aa18.66■□□□□ 0.58
NISCH-213ENST00000489895 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP18.66■□□□□ 0.58
NISCH-213ENST00000489895 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP18.66■□□□□ 0.58
NISCH-213ENST00000489895 CRKP46108 304 aa18.66■□□□□ 0.58
NISCH-213ENST00000489895 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa18.66■□□□□ 0.58
NISCH-213ENST00000489895 RNF169Q8NCN4 708 aa18.66■□□□□ 0.58
NISCH-213ENST00000489895 MADDQ8WXG6 1647 aa18.66■□□□□ 0.58
NISCH-213ENST00000489895 CAPN9O14815 690 aa18.66■□□□□ 0.58
NISCH-213ENST00000489895 TLR3O15455 904 aaKnown RBP18.66■□□□□ 0.58
NISCH-213ENST00000489895 IGSF3O75054 1194 aa18.66■□□□□ 0.58
NISCH-213ENST00000489895 VIMP08670 466 aaKnown RBP18.66■□□□□ 0.58
NISCH-213ENST00000489895 BRD3Q15059 726 aa18.66■□□□□ 0.58
NISCH-213ENST00000489895 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa18.66■□□□□ 0.58
NISCH-213ENST00000489895 KMT5AQ9NQR1 393 aa18.66■□□□□ 0.58
NISCH-213ENST00000489895 ALCAMQ13740 583 aa18.66■□□□□ 0.58
NISCH-213ENST00000489895 PSMB7Q99436 277 aa18.66■□□□□ 0.58
NISCH-213ENST00000489895 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa18.66■□□□□ 0.58
NISCH-213ENST00000489895 SORBS3O60504 671 aa18.65■□□□□ 0.58
NISCH-213ENST00000489895 LMNB1P20700 586 aa18.65■□□□□ 0.58
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NISCH-213ENST00000489895 PIK3CAP42336 1068 aa18.65■□□□□ 0.58
NISCH-213ENST00000489895 KRT81Q14533 505 aa18.65■□□□□ 0.58
NISCH-213ENST00000489895 RSAD2Q8WXG1 361 aa18.65■□□□□ 0.58
NISCH-213ENST00000489895 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP18.65■□□□□ 0.58
NISCH-213ENST00000489895 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP18.65■□□□□ 0.58
NISCH-213ENST00000489895 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa18.65■□□□□ 0.58
NISCH-213ENST00000489895 CRCPO75575 148 aa18.65■□□□□ 0.58
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NISCH-213ENST00000489895 IGBP1P78318 339 aa18.65■□□□□ 0.58
NISCH-213ENST00000489895 NR5A1Q13285 461 aa18.65■□□□□ 0.58
NISCH-213ENST00000489895 SMC1BQ8NDV3 1235 aa18.65■□□□□ 0.58
NISCH-213ENST00000489895 RPS6KC1Q96S38 1066 aa18.65■□□□□ 0.58
NISCH-213ENST00000489895 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP18.65■□□□□ 0.58
NISCH-213ENST00000489895 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP18.65■□□□□ 0.58
NISCH-213ENST00000489895 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP18.65■□□□□ 0.58
NISCH-213ENST00000489895 TBC1D9BQ66K14 1250 aa18.65■□□□□ 0.58
NISCH-213ENST00000489895 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP18.65■□□□□ 0.58
NISCH-213ENST00000489895 TRIM11Q96F44 468 aa18.65■□□□□ 0.58
NISCH-213ENST00000489895 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP18.65■□□□□ 0.58
NISCH-213ENST00000489895 CEP170P1Q96L14 293 aa18.65■□□□□ 0.58
NISCH-213ENST00000489895 HPDP32754 393 aaPredicted RBP18.64■□□□□ 0.58
NISCH-213ENST00000489895 ALX1Q15699 326 aa18.64■□□□□ 0.58
NISCH-213ENST00000489895 MAN2A1Q16706 1144 aa18.64■□□□□ 0.58
NISCH-213ENST00000489895 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP18.64■□□□□ 0.58
NISCH-213ENST00000489895 JCADQ9P266 1359 aa18.64■□□□□ 0.58
NISCH-213ENST00000489895 GIPC1O14908 333 aa18.64■□□□□ 0.57
NISCH-213ENST00000489895 PSAPP07602 524 aa18.64■□□□□ 0.57
NISCH-213ENST00000489895 UBXN2AP68543 259 aa18.64■□□□□ 0.57
NISCH-213ENST00000489895 SEPT14Q6ZU15 432 aa18.64■□□□□ 0.57
NISCH-213ENST00000489895 TRIM50Q86XT4 487 aa18.64■□□□□ 0.57
NISCH-213ENST00000489895 QRICH2Q9H0J4 1663 aa18.64■□□□□ 0.57
NISCH-213ENST00000489895 AFPP02771 609 aaKnown RBP18.64■□□□□ 0.57
NISCH-213ENST00000489895 PSMC4P43686 418 aa18.64■□□□□ 0.57
NISCH-213ENST00000489895 FAM186BQ8IYM0 893 aa18.64■□□□□ 0.57
NISCH-213ENST00000489895 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP18.64■□□□□ 0.57
NISCH-213ENST00000489895 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa18.64■□□□□ 0.57
NISCH-213ENST00000489895 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa18.64■□□□□ 0.57
NISCH-213ENST00000489895 STK36Q9NRP7 1315 aa18.64■□□□□ 0.57
NISCH-213ENST00000489895 NRKQ7Z2Y5 1582 aa18.64■□□□□ 0.57
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