RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489487.1

TMEM30CP-202, Transcript of transmembrane protein 30C, pseudogene, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TMEM30CP, Length 380 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM30CP-202ENST00000489487 SGPP1Q9BX95 441 aa7.2□□□□□ -1.26
TMEM30CP-202ENST00000489487 NUDT5Q9UKK9 219 aa7.2□□□□□ -1.26
TMEM30CP-202ENST00000489487 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
TMEM30CP-202ENST00000489487 PRODHO43272 600 aa7.19□□□□□ -1.26
TMEM30CP-202ENST00000489487 CAPNS1P04632 268 aa7.19□□□□□ -1.26
TMEM30CP-202ENST00000489487 MED14OSP0DP75 135 aa7.19□□□□□ -1.26
TMEM30CP-202ENST00000489487 GLI4P10075 376 aa7.19□□□□□ -1.26
TMEM30CP-202ENST00000489487 GTF2A2P52657 109 aa7.19□□□□□ -1.26
TMEM30CP-202ENST00000489487 SERINC3Q13530 473 aa7.19□□□□□ -1.26
TMEM30CP-202ENST00000489487 MBLAC2Q68D91 279 aa7.19□□□□□ -1.26
TMEM30CP-202ENST00000489487 NSMFQ6X4W1 530 aa7.19□□□□□ -1.26
TMEM30CP-202ENST00000489487 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
TMEM30CP-202ENST00000489487 ARHGEF4Q9NR80 690 aa7.19□□□□□ -1.26
TMEM30CP-202ENST00000489487 MARCH2Q9P0N8 246 aa7.19□□□□□ -1.26
TMEM30CP-202ENST00000489487 PFDN2Q9UHV9 154 aa7.19□□□□□ -1.26
TMEM30CP-202ENST00000489487 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
TMEM30CP-202ENST00000489487 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
TMEM30CP-202ENST00000489487 DBX1A6NMT0 343 aa7.18□□□□□ -1.26
TMEM30CP-202ENST00000489487 FGFR1P11362 822 aa7.18□□□□□ -1.26
TMEM30CP-202ENST00000489487 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
TMEM30CP-202ENST00000489487 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
TMEM30CP-202ENST00000489487 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa7.18□□□□□ -1.26
TMEM30CP-202ENST00000489487 USP53Q70EK8 1073 aa7.18□□□□□ -1.26
TMEM30CP-202ENST00000489487 SPATC1Q76KD6 591 aa7.18□□□□□ -1.26
TMEM30CP-202ENST00000489487 CCDC103Q8IW40 242 aa7.18□□□□□ -1.26
TMEM30CP-202ENST00000489487 NETO2Q8NC67 525 aa7.18□□□□□ -1.26
TMEM30CP-202ENST00000489487 PEX11GQ96HA9 241 aa7.18□□□□□ -1.26
TMEM30CP-202ENST00000489487 CHAMP1Q96JM3 812 aa7.18□□□□□ -1.26
TMEM30CP-202ENST00000489487 TOX2Q96NM4 488 aa7.18□□□□□ -1.26
TMEM30CP-202ENST00000489487 DEPDC7Q96QD5 511 aa7.18□□□□□ -1.26
TMEM30CP-202ENST00000489487 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
TMEM30CP-202ENST00000489487 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
TMEM30CP-202ENST00000489487 CNTD2Q9H8S5 307 aa7.18□□□□□ -1.26
TMEM30CP-202ENST00000489487 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
TMEM30CP-202ENST00000489487 C22orf46C9J442 243 aa7.17□□□□□ -1.26
TMEM30CP-202ENST00000489487 DLX3O60479 287 aa7.17□□□□□ -1.26
TMEM30CP-202ENST00000489487 JAG1P78504 1218 aa7.17□□□□□ -1.26
TMEM30CP-202ENST00000489487 PRR5P85299 388 aa7.17□□□□□ -1.26
TMEM30CP-202ENST00000489487 TESK1Q15569 626 aa7.17□□□□□ -1.26
TMEM30CP-202ENST00000489487 WWC2Q6AWC2 1192 aa7.17□□□□□ -1.26
TMEM30CP-202ENST00000489487 RCBTB1Q8NDN9 531 aa7.17□□□□□ -1.26
TMEM30CP-202ENST00000489487 PLEKHO2Q8TD55 490 aa7.17□□□□□ -1.26
TMEM30CP-202ENST00000489487 DPF3Q92784 378 aa7.17□□□□□ -1.26
TMEM30CP-202ENST00000489487 MKL1Q969V6 931 aa7.17□□□□□ -1.26
TMEM30CP-202ENST00000489487 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
TMEM30CP-202ENST00000489487 CDC6Q99741 560 aa7.17□□□□□ -1.26
TMEM30CP-202ENST00000489487 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa7.17□□□□□ -1.26
TMEM30CP-202ENST00000489487 NPIPB6E9PJ23 425 aa7.16□□□□□ -1.26
TMEM30CP-202ENST00000489487 KRT1P04264 644 aa7.16□□□□□ -1.26
TMEM30CP-202ENST00000489487 NTRK1P04629 796 aa7.16□□□□□ -1.26
TMEM30CP-202ENST00000489487 BCL6P41182 706 aa7.16□□□□□ -1.26
TMEM30CP-202ENST00000489487 LSAMPQ13449 338 aa7.16□□□□□ -1.26
TMEM30CP-202ENST00000489487 KCNA10Q16322 511 aa7.16□□□□□ -1.26
TMEM30CP-202ENST00000489487 DENND5AQ6IQ26 1287 aa7.16□□□□□ -1.26
TMEM30CP-202ENST00000489487 CEP68Q76N32 757 aa7.16□□□□□ -1.26
TMEM30CP-202ENST00000489487 DPH6Q7L8W6 267 aa7.16□□□□□ -1.26
TMEM30CP-202ENST00000489487 LDHDQ86WU2 507 aa7.16□□□□□ -1.26
TMEM30CP-202ENST00000489487 TEX2Q8IWB9 1127 aa7.16□□□□□ -1.26
TMEM30CP-202ENST00000489487 MZB1Q8WU39 189 aa7.16□□□□□ -1.26
TMEM30CP-202ENST00000489487 UBXN4Q92575 508 aa7.16□□□□□ -1.26
TMEM30CP-202ENST00000489487 C1orf159Q96HA4 380 aa7.16□□□□□ -1.26
TMEM30CP-202ENST00000489487 TMEM169Q96HH4 297 aa7.16□□□□□ -1.26
TMEM30CP-202ENST00000489487 GCM1Q9NP62 436 aa7.16□□□□□ -1.26
TMEM30CP-202ENST00000489487 CD320Q9NPF0 282 aa7.16□□□□□ -1.26
TMEM30CP-202ENST00000489487 SNTG2Q9NY99 539 aa7.16□□□□□ -1.26
TMEM30CP-202ENST00000489487 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
TMEM30CP-202ENST00000489487 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
TMEM30CP-202ENST00000489487 ARNTLO00327 626 aa7.15□□□□□ -1.26
TMEM30CP-202ENST00000489487 N4BP3O15049 544 aa7.15□□□□□ -1.26
TMEM30CP-202ENST00000489487 ZBTB7AO95365 584 aa7.15□□□□□ -1.26
TMEM30CP-202ENST00000489487 CDR1P51861 262 aa7.15□□□□□ -1.26
TMEM30CP-202ENST00000489487 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
TMEM30CP-202ENST00000489487 RASA3Q14644 834 aa7.15□□□□□ -1.26
TMEM30CP-202ENST00000489487 SLC9A5Q14940 896 aa7.15□□□□□ -1.26
TMEM30CP-202ENST00000489487 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
TMEM30CP-202ENST00000489487 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
TMEM30CP-202ENST00000489487 SCUBE1Q8IWY4 988 aa7.15□□□□□ -1.26
TMEM30CP-202ENST00000489487 DCAF4Q8WV16 495 aa7.15□□□□□ -1.26
TMEM30CP-202ENST00000489487 OSBP2Q969R2 916 aa7.15□□□□□ -1.26
TMEM30CP-202ENST00000489487 SIGLEC10Q96LC7 697 aa7.15□□□□□ -1.26
TMEM30CP-202ENST00000489487 AP5M1Q9H0R1 490 aa7.15□□□□□ -1.26
TMEM30CP-202ENST00000489487 RXFP1Q9HBX9 757 aa7.15□□□□□ -1.26
TMEM30CP-202ENST00000489487 GPR27Q9NS67 375 aa7.15□□□□□ -1.26
TMEM30CP-202ENST00000489487 FBLN5Q9UBX5 448 aa7.15□□□□□ -1.26
TMEM30CP-202ENST00000489487 IRAK3Q9Y616 596 aa7.15□□□□□ -1.26
TMEM30CP-202ENST00000489487 KDM2BQ8NHM5 1336 aa7.15□□□□□ -1.26
TMEM30CP-202ENST00000489487 FAM221BA6H8Z2 402 aa7.14□□□□□ -1.27
TMEM30CP-202ENST00000489487 RFXAPO00287 272 aa7.14□□□□□ -1.27
TMEM30CP-202ENST00000489487 LCP1P13796 627 aa7.14□□□□□ -1.27
TMEM30CP-202ENST00000489487 PFKLP17858 780 aa7.14□□□□□ -1.27
TMEM30CP-202ENST00000489487 FPR2P25090 351 aa7.14□□□□□ -1.27
TMEM30CP-202ENST00000489487 EPHB3P54753 998 aa7.14□□□□□ -1.27
TMEM30CP-202ENST00000489487 MROH9Q5TGP6 573 aa7.14□□□□□ -1.27
TMEM30CP-202ENST00000489487 CIAPIN1Q6FI81 312 aa7.14□□□□□ -1.27
TMEM30CP-202ENST00000489487 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
TMEM30CP-202ENST00000489487 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
TMEM30CP-202ENST00000489487 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
TMEM30CP-202ENST00000489487 ALG3Q92685 438 aa7.14□□□□□ -1.27
TMEM30CP-202ENST00000489487 PHF20Q9BVI0 1012 aa7.14□□□□□ -1.27
TMEM30CP-202ENST00000489487 OSBPL2Q9H1P3 480 aa7.14□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.9 ms