RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487577.5

TYMP-208, Transcript of thymidine phosphorylase, human

TSL 1 (best)

Gene TYMP, Length 1,751 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TYMP-208	ENST00000487577	GOLGA6L19	H0YKK7	550 aa		27.86	■■■□□ 2.05
TYMP-208	ENST00000487577	IQCB1	Q15051	598 aa		27.86	■■■□□ 2.05
TYMP-208	ENST00000487577	NT5DC1	Q5TFE4	455 aa		27.86	■■■□□ 2.05
TYMP-208	ENST00000487577	PDXDC2P	Q6P474	469 aa		27.86	■■■□□ 2.05
TYMP-208	ENST00000487577	TTC12	Q9H892	705 aa	Predicted RBP	27.86	■■■□□ 2.05
TYMP-208	ENST00000487577	EHMT1	Q9H9B1	1298 aa		27.86	■■■□□ 2.05
TYMP-208	ENST00000487577	RAVER2	Q9HCJ3	691 aa	Known RBP	27.86	■■■□□ 2.05
TYMP-208	ENST00000487577	LRWD1	Q9UFC0	647 aa		27.86	■■■□□ 2.05
TYMP-208	ENST00000487577	PNMA2	Q9UL42	364 aa		27.86	■■■□□ 2.05
TYMP-208	ENST00000487577	RBM46	Q8TBY0	533 aa	Known RBP	27.85	■■■□□ 2.05
TYMP-208	ENST00000487577	MBOAT7	Q96N66	472 aa		27.85	■■■□□ 2.05
TYMP-208	ENST00000487577	SARS	P49591	514 aa	Known RBP	27.84	■■■□□ 2.05
TYMP-208	ENST00000487577	PDIA5	Q14554	519 aa		27.84	■■■□□ 2.05
TYMP-208	ENST00000487577	HAS1	Q92839	578 aa		27.84	■■■□□ 2.05
TYMP-208	ENST00000487577	MAN1B1	Q9UKM7	699 aa		27.84	■■■□□ 2.05
TYMP-208	ENST00000487577	ALAS1	P13196	640 aa		27.83	■■■□□ 2.05
TYMP-208	ENST00000487577	ZNF76	P36508	570 aa		27.83	■■■□□ 2.05
TYMP-208	ENST00000487577	TTLL12	Q14166	644 aa	Predicted RBP	27.83	■■■□□ 2.05
TYMP-208	ENST00000487577	PNMA8A	Q86V59	439 aa	Predicted RBP	27.83	■■■□□ 2.05
TYMP-208	ENST00000487577	BPIFA3	Q9BQP9	254 aa		27.83	■■■□□ 2.05
TYMP-208	ENST00000487577	OTOF	Q9HC10	1997 aa		27.83	■■■□□ 2.05
TYMP-208	ENST00000487577	VWA5A	O00534	786 aa		27.83	■■■□□ 2.05
TYMP-208	ENST00000487577		Q4G0T1	1027 aa		27.83	■■■□□ 2.05
TYMP-208	ENST00000487577	PRR16	Q569H4	304 aa		27.83	■■■□□ 2.05
TYMP-208	ENST00000487577	MCF2L2	Q86YR7	1114 aa		27.83	■■■□□ 2.05
TYMP-208	ENST00000487577	TRIML1	Q8N9V2	468 aa		27.83	■■■□□ 2.05
TYMP-208	ENST00000487577	ATG4C	Q96DT6	458 aa		27.83	■■■□□ 2.05
TYMP-208	ENST00000487577	CALML4	Q96GE6	196 aa		27.83	■■■□□ 2.05
TYMP-208	ENST00000487577	PDLIM2	Q96JY6	352 aa		27.83	■■■□□ 2.05
TYMP-208	ENST00000487577	PLIN2	Q99541	437 aa		27.83	■■■□□ 2.05
TYMP-208	ENST00000487577	PARP14	Q460N5	1801 aa		27.83	■■■□□ 2.05
TYMP-208	ENST00000487577	CYP3A4	P08684	503 aa		27.82	■■■□□ 2.04
TYMP-208	ENST00000487577	DHX40	Q8IX18	779 aa	Known RBP	27.82	■■■□□ 2.04
TYMP-208	ENST00000487577	SPATA20	Q8TB22	786 aa		27.82	■■■□□ 2.04
TYMP-208	ENST00000487577	STAM	Q92783	540 aa		27.82	■■■□□ 2.04
TYMP-208	ENST00000487577	KCNMB3	Q9NPA1	279 aa		27.82	■■■□□ 2.04
TYMP-208	ENST00000487577	PCDHA12	Q9UN75	941 aa		27.82	■■■□□ 2.04
TYMP-208	ENST00000487577	PAPPA2	Q9BXP8	1791 aa		27.82	■■■□□ 2.04
TYMP-208	ENST00000487577	CIITA	P33076	1130 aa		27.81	■■■□□ 2.04
TYMP-208	ENST00000487577	DPYD	Q12882	1025 aa		27.81	■■■□□ 2.04
TYMP-208	ENST00000487577	COG2	Q14746	738 aa		27.81	■■■□□ 2.04
TYMP-208	ENST00000487577	SH3D19	Q5HYK7	790 aa		27.81	■■■□□ 2.04
TYMP-208	ENST00000487577	SLFN12	Q8IYM2	578 aa		27.81	■■■□□ 2.04
TYMP-208	ENST00000487577	AOPEP	Q8N6M6	819 aa		27.81	■■■□□ 2.04
TYMP-208	ENST00000487577	POTEM	A6NI47	508 aa		27.81	■■■□□ 2.04
TYMP-208	ENST00000487577	GTPBP6	O43824	516 aa	Predicted RBP	27.81	■■■□□ 2.04
TYMP-208	ENST00000487577	ADCY5	O95622	1261 aa		27.81	■■■□□ 2.04
TYMP-208	ENST00000487577	DSG3	P32926	999 aa		27.81	■■■□□ 2.04
TYMP-208	ENST00000487577	CATSPERG	Q6ZRH7	1159 aa		27.81	■■■□□ 2.04
TYMP-208	ENST00000487577	ANKRD13A	Q8IZ07	590 aa		27.81	■■■□□ 2.04
TYMP-208	ENST00000487577	CLEC4D	Q8WXI8	215 aa		27.81	■■■□□ 2.04
TYMP-208	ENST00000487577	CUEDC2	Q9H467	287 aa		27.81	■■■□□ 2.04
TYMP-208	ENST00000487577	HOMER2	Q9NSB8	354 aa		27.81	■■■□□ 2.04
TYMP-208	ENST00000487577	POTEC	B2RU33	542 aa		27.8	■■■□□ 2.04
TYMP-208	ENST00000487577	PLCG1	P19174	1290 aa		27.8	■■■□□ 2.04
TYMP-208	ENST00000487577	CASP1	P29466	404 aa		27.8	■■■□□ 2.04
TYMP-208	ENST00000487577	HSD17B4	P51659	736 aa		27.8	■■■□□ 2.04
TYMP-208	ENST00000487577	MORC3	Q14149	939 aa		27.8	■■■□□ 2.04
TYMP-208	ENST00000487577	NAALADL2	Q58DX5	795 aa		27.8	■■■□□ 2.04
TYMP-208	ENST00000487577	KRT79	Q5XKE5	535 aa		27.8	■■■□□ 2.04
TYMP-208	ENST00000487577	GJA10	Q969M2	543 aa		27.8	■■■□□ 2.04
TYMP-208	ENST00000487577	MMTAG2	Q9BU76	263 aa	Known RBP	27.8	■■■□□ 2.04
TYMP-208	ENST00000487577	ELP3	Q9H9T3	547 aa		27.8	■■■□□ 2.04
TYMP-208	ENST00000487577	WDR90	Q96KV7	1748 aa		27.79	■■■□□ 2.04
TYMP-208	ENST00000487577	FAM86B1	E9PN63	330 aa		27.79	■■■□□ 2.04
TYMP-208	ENST00000487577	NFIB	O00712	420 aa		27.79	■■■□□ 2.04
TYMP-208	ENST00000487577	TBX3	O15119	743 aa		27.79	■■■□□ 2.04
TYMP-208	ENST00000487577	FAM86B2	P0C5J1	330 aa		27.79	■■■□□ 2.04
TYMP-208	ENST00000487577	TRIM44	Q96DX7	344 aa	Predicted RBP	27.79	■■■□□ 2.04
TYMP-208	ENST00000487577	CDK5RAP3	Q96JB5	506 aa		27.79	■■■□□ 2.04
TYMP-208	ENST00000487577	GSDMA	Q96QA5	445 aa		27.79	■■■□□ 2.04
TYMP-208	ENST00000487577	CLEC11A	Q9Y240	323 aa		27.79	■■■□□ 2.04
TYMP-208	ENST00000487577	WNK4	Q96J92	1243 aa		27.78	■■■□□ 2.04
TYMP-208	ENST00000487577	MTR	Q99707	1265 aa		27.78	■■■□□ 2.04
TYMP-208	ENST00000487577	BLZF1	Q9H2G9	400 aa		27.78	■■■□□ 2.04
TYMP-208	ENST00000487577	MAGEF1	Q9HAY2	307 aa		27.78	■■■□□ 2.04
TYMP-208	ENST00000487577	DACH1	Q9UI36	760 aa		27.78	■■■□□ 2.04
TYMP-208	ENST00000487577	SNX29	Q8TEQ0	813 aa		27.78	■■■□□ 2.04
TYMP-208	ENST00000487577	CNKSR2	Q8WXI2	1034 aa		27.78	■■■□□ 2.04
TYMP-208	ENST00000487577	TRERF1	Q96PN7	1200 aa		27.78	■■■□□ 2.04
TYMP-208	ENST00000487577	UIMC1	Q96RL1	719 aa		27.78	■■■□□ 2.04
TYMP-208	ENST00000487577	RLF	Q13129	1914 aa		27.77	■■■□□ 2.04
TYMP-208	ENST00000487577	SMTNL1	A8MU46	457 aa		27.77	■■■□□ 2.04
TYMP-208	ENST00000487577	BMP6	P22004	513 aa		27.77	■■■□□ 2.04
TYMP-208	ENST00000487577	PPAT	Q06203	517 aa		27.77	■■■□□ 2.04
TYMP-208	ENST00000487577	CUL4B	Q13620	913 aa		27.77	■■■□□ 2.04
TYMP-208	ENST00000487577	MUM1L1	Q5H9M0	696 aa		27.77	■■■□□ 2.04
TYMP-208	ENST00000487577	MOB2	Q70IA6	237 aa		27.77	■■■□□ 2.04
TYMP-208	ENST00000487577	MLKL	Q8NB16	471 aa		27.77	■■■□□ 2.04
TYMP-208	ENST00000487577	ETNPPL	Q8TBG4	499 aa		27.77	■■■□□ 2.04
TYMP-208	ENST00000487577	LENG9	Q96B70	501 aa		27.77	■■■□□ 2.04
TYMP-208	ENST00000487577	HOXC10	Q9NYD6	342 aa		27.77	■■■□□ 2.04
TYMP-208	ENST00000487577	AP5Z1	O43299	807 aa		27.76	■■■□□ 2.03
TYMP-208	ENST00000487577	OAZ1	P54368	228 aa		27.76	■■■□□ 2.03
TYMP-208	ENST00000487577	ARMC9	Q7Z3E5	817 aa		27.76	■■■□□ 2.03
TYMP-208	ENST00000487577	ERO1B	Q86YB8	467 aa		27.76	■■■□□ 2.03
TYMP-208	ENST00000487577	SAMD3	Q8N6K7	520 aa		27.76	■■■□□ 2.03
TYMP-208	ENST00000487577	CLMN	Q96JQ2	1002 aa		27.76	■■■□□ 2.03
TYMP-208	ENST00000487577	FAM20A	Q96MK3	541 aa		27.76	■■■□□ 2.03
TYMP-208	ENST00000487577	MAP3K20	Q9NYL2	800 aa	Known RBP	27.76	■■■□□ 2.03

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