RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482785.1

SHQ1-208, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 3

Gene SHQ1, Length 502 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-208ENST00000482785 CCDC113Q9H0I3 377 aa4.95□□□□□ -1.62
SHQ1-208ENST00000482785 EHD4Q9H223 541 aa4.95□□□□□ -1.62
SHQ1-208ENST00000482785 DBNDD1Q9H9R9 158 aa4.95□□□□□ -1.62
SHQ1-208ENST00000482785 SLC28A3Q9HAS3 691 aa4.95□□□□□ -1.62
SHQ1-208ENST00000482785 CNTN3Q9P232 1028 aa4.95□□□□□ -1.62
SHQ1-208ENST00000482785 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa4.95□□□□□ -1.62
SHQ1-208ENST00000482785 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa4.95□□□□□ -1.62
SHQ1-208ENST00000482785 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
SHQ1-208ENST00000482785 A0A1W2PP55 124 aa4.94□□□□□ -1.62
SHQ1-208ENST00000482785 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa4.94□□□□□ -1.62
SHQ1-208ENST00000482785 BTBD19C9JJ37 291 aa4.94□□□□□ -1.62
SHQ1-208ENST00000482785 CDC45O75419 566 aa4.94□□□□□ -1.62
SHQ1-208ENST00000482785 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
SHQ1-208ENST00000482785 C1QTNF9P0C862 333 aa4.94□□□□□ -1.62
SHQ1-208ENST00000482785 FCGRTP55899 365 aa4.94□□□□□ -1.62
SHQ1-208ENST00000482785 CTC1Q2NKJ3 1217 aa4.94□□□□□ -1.62
SHQ1-208ENST00000482785 CRY2Q49AN0 593 aa4.94□□□□□ -1.62
SHQ1-208ENST00000482785 ARSHQ5FYA8 562 aa4.94□□□□□ -1.62
SHQ1-208ENST00000482785 TAF7LQ5H9L4 462 aa4.94□□□□□ -1.62
SHQ1-208ENST00000482785 WDR44Q5JSH3 913 aa4.94□□□□□ -1.62
SHQ1-208ENST00000482785 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
SHQ1-208ENST00000482785 IFNL2Q8IZJ0 200 aa4.94□□□□□ -1.62
SHQ1-208ENST00000482785 PHC3Q8NDX5 983 aa4.94□□□□□ -1.62
SHQ1-208ENST00000482785 SUPT20HQ8NEM7 779 aa4.94□□□□□ -1.62
SHQ1-208ENST00000482785 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
SHQ1-208ENST00000482785 APPBP2Q92624 585 aa4.94□□□□□ -1.62
SHQ1-208ENST00000482785 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
SHQ1-208ENST00000482785 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
SHQ1-208ENST00000482785 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
SHQ1-208ENST00000482785 PDLIM7Q9NR12 457 aa4.94□□□□□ -1.62
SHQ1-208ENST00000482785 KLHL42Q9P2K6 505 aa4.94□□□□□ -1.62
SHQ1-208ENST00000482785 MSRAQ9UJ68 235 aa4.94□□□□□ -1.62
SHQ1-208ENST00000482785 MSRB2Q9Y3D2 182 aa4.94□□□□□ -1.62
SHQ1-208ENST00000482785 FRMPD3Q5JV73 1810 aa4.94□□□□□ -1.62
SHQ1-208ENST00000482785 FAM221BA6H8Z2 402 aa4.93□□□□□ -1.62
SHQ1-208ENST00000482785 EPOPA6NHQ4 379 aa4.93□□□□□ -1.62
SHQ1-208ENST00000482785 FAM177BA6PVY3 158 aa4.93□□□□□ -1.62
SHQ1-208ENST00000482785 LAMA5O15230 3695 aa4.93□□□□□ -1.62
SHQ1-208ENST00000482785 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
SHQ1-208ENST00000482785 ATP4AP20648 1035 aa4.93□□□□□ -1.62
SHQ1-208ENST00000482785 KCNA5P22460 613 aa4.93□□□□□ -1.62
SHQ1-208ENST00000482785 CABP4P57796 275 aa4.93□□□□□ -1.62
SHQ1-208ENST00000482785 APOBRQ0VD83 1088 aa4.93□□□□□ -1.62
SHQ1-208ENST00000482785 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
SHQ1-208ENST00000482785 PPM1JQ5JR12 505 aa4.93□□□□□ -1.62
SHQ1-208ENST00000482785 LINC00528Q8N1L1 170 aa4.93□□□□□ -1.62
SHQ1-208ENST00000482785 ANAPC16Q96DE5 110 aa4.93□□□□□ -1.62
SHQ1-208ENST00000482785 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
SHQ1-208ENST00000482785 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
SHQ1-208ENST00000482785 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
SHQ1-208ENST00000482785 CEP44Q9C0F1 390 aa4.93□□□□□ -1.62
SHQ1-208ENST00000482785 MYOZ2Q9NPC6 264 aa4.93□□□□□ -1.62
SHQ1-208ENST00000482785 FANCLQ9NW38 375 aa4.93□□□□□ -1.62
SHQ1-208ENST00000482785 PPME1Q9Y570 386 aa4.93□□□□□ -1.62
SHQ1-208ENST00000482785 SH3TC1Q8TE82 1336 aa4.93□□□□□ -1.62
SHQ1-208ENST00000482785 PCNX1Q96RV3 2341 aa4.92□□□□□ -1.62
SHQ1-208ENST00000482785 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
SHQ1-208ENST00000482785 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa4.92□□□□□ -1.62
SHQ1-208ENST00000482785 A0A087WZG4 1122 aa4.92□□□□□ -1.62
SHQ1-208ENST00000482785 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
SHQ1-208ENST00000482785 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa4.92□□□□□ -1.62
SHQ1-208ENST00000482785 LCHNA4D1U4 455 aa4.92□□□□□ -1.62
SHQ1-208ENST00000482785 F6X3S4 739 aa4.92□□□□□ -1.62
SHQ1-208ENST00000482785 AVPP01185 164 aa4.92□□□□□ -1.62
SHQ1-208ENST00000482785 NTRK1P04629 796 aa4.92□□□□□ -1.62
SHQ1-208ENST00000482785 PLA2G2AP14555 144 aa4.92□□□□□ -1.62
SHQ1-208ENST00000482785 GARTP22102 1010 aa4.92□□□□□ -1.62
SHQ1-208ENST00000482785 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
SHQ1-208ENST00000482785 LIG3P49916 1009 aa4.92□□□□□ -1.62
SHQ1-208ENST00000482785 GTF2A2P52657 109 aa4.92□□□□□ -1.62
SHQ1-208ENST00000482785 LMNB2Q03252 620 aa4.92□□□□□ -1.62
SHQ1-208ENST00000482785 TYRO3Q06418 890 aa4.92□□□□□ -1.62
SHQ1-208ENST00000482785 RAB30Q15771 203 aa4.92□□□□□ -1.62
SHQ1-208ENST00000482785 PKDCCQ504Y2 493 aa4.92□□□□□ -1.62
SHQ1-208ENST00000482785 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
SHQ1-208ENST00000482785 SNAP47Q5SQN1 464 aa4.92□□□□□ -1.62
SHQ1-208ENST00000482785 C6orf118Q5T5N4 469 aa4.92□□□□□ -1.62
SHQ1-208ENST00000482785 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
SHQ1-208ENST00000482785 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
SHQ1-208ENST00000482785 DTHD1Q6ZMT9 781 aa4.92□□□□□ -1.62
SHQ1-208ENST00000482785 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa4.92□□□□□ -1.62
SHQ1-208ENST00000482785 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
SHQ1-208ENST00000482785 HOMER1Q86YM7 354 aa4.92□□□□□ -1.62
SHQ1-208ENST00000482785 SLITRK4Q8IW52 837 aa4.92□□□□□ -1.62
SHQ1-208ENST00000482785 NKD1Q969G9 470 aa4.92□□□□□ -1.62
SHQ1-208ENST00000482785 SHDQ96IW2 340 aa4.92□□□□□ -1.62
SHQ1-208ENST00000482785 ABCB6Q9NP58 842 aa4.92□□□□□ -1.62
SHQ1-208ENST00000482785 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
SHQ1-208ENST00000482785 UBP1Q9NZI7 540 aa4.92□□□□□ -1.62
SHQ1-208ENST00000482785 AKAP2Q9Y2D5 859 aa4.92□□□□□ -1.62
SHQ1-208ENST00000482785 ZFHX3Q15911 3703 aa4.92□□□□□ -1.62
SHQ1-208ENST00000482785 LRRC37AA6NMS7 1700 aa4.92□□□□□ -1.62
SHQ1-208ENST00000482785 A0A1W2PP64 1363 aa4.91□□□□□ -1.62
SHQ1-208ENST00000482785 A0A1B0GTL3 188 aa4.91□□□□□ -1.62
SHQ1-208ENST00000482785 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
SHQ1-208ENST00000482785 PARNO95453 639 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
SHQ1-208ENST00000482785 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
SHQ1-208ENST00000482785 LMNAP02545 664 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
SHQ1-208ENST00000482785 PF4P02776 101 aa4.91□□□□□ -1.62
SHQ1-208ENST00000482785 VIL1P09327 827 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.1 ms