RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478932.1

USP25-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, human

TSL 1 (best)

Gene USP25, Length 2,605 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP25-208	ENST00000478932	TEPSIN	Q96N21	525 aa		4.65	□□□□□ -1.67
USP25-208	ENST00000478932	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		4.65	□□□□□ -1.67
USP25-208	ENST00000478932	CCSER1	Q9C0I3	900 aa		4.65	□□□□□ -1.67
USP25-208	ENST00000478932	ARHGEF10L	Q9HCE6	1279 aa		4.65	□□□□□ -1.67
USP25-208	ENST00000478932	INTS13	Q9NVM9	706 aa		4.65	□□□□□ -1.67
USP25-208	ENST00000478932	KBTBD4	Q9NVX7	518 aa		4.65	□□□□□ -1.67
USP25-208	ENST00000478932	ZBTB4	Q9P1Z0	1013 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
USP25-208	ENST00000478932	PGAP2	Q9UHJ9	254 aa		4.65	□□□□□ -1.67
USP25-208	ENST00000478932	DDX25	Q9UHL0	483 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
USP25-208	ENST00000478932	SIPA1L1	O43166	1804 aa		4.65	□□□□□ -1.67
USP25-208	ENST00000478932	PHF20L1	A8MW92	1017 aa		4.64	□□□□□ -1.67
USP25-208	ENST00000478932	GTPBP6	O43824	516 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
USP25-208	ENST00000478932	ASNS	P08243	561 aa		4.64	□□□□□ -1.67
USP25-208	ENST00000478932	ZNF18	P17022	549 aa		4.64	□□□□□ -1.67
USP25-208	ENST00000478932	ERCC5	P28715	1186 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
USP25-208	ENST00000478932	PRCP	P42785	496 aa		4.64	□□□□□ -1.67
USP25-208	ENST00000478932	UBXN2A	P68543	259 aa		4.64	□□□□□ -1.67
USP25-208	ENST00000478932	NBPF12	Q5TAG4	269 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
USP25-208	ENST00000478932	PPP4R3A	Q6IN85	833 aa		4.64	□□□□□ -1.67
USP25-208	ENST00000478932	DLK2	Q6UY11	383 aa		4.64	□□□□□ -1.67
USP25-208	ENST00000478932	DYM	Q7RTS9	669 aa		4.64	□□□□□ -1.67
USP25-208	ENST00000478932	KCNK18	Q7Z418	384 aa		4.64	□□□□□ -1.67
USP25-208	ENST00000478932	MTMR14	Q8NCE2	650 aa		4.64	□□□□□ -1.67
USP25-208	ENST00000478932	ZBED3	Q96IU2	234 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
USP25-208	ENST00000478932	AK8	Q96MA6	479 aa		4.64	□□□□□ -1.67
USP25-208	ENST00000478932	ZNF341	Q9BYN7	854 aa		4.64	□□□□□ -1.67
USP25-208	ENST00000478932	HACL1	Q9UJ83	578 aa		4.64	□□□□□ -1.67
USP25-208	ENST00000478932	R3HCC1	Q9Y3T6	440 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
USP25-208	ENST00000478932	CD2AP	Q9Y5K6	639 aa		4.64	□□□□□ -1.67
USP25-208	ENST00000478932	TRIM49B	A6NDI0	452 aa		4.64	□□□□□ -1.67
USP25-208	ENST00000478932	SPDYE3	A6NKU9	549 aa		4.64	□□□□□ -1.67
USP25-208	ENST00000478932	FAM86B1	E9PN63	330 aa		4.64	□□□□□ -1.67
USP25-208	ENST00000478932	POTEB2	H3BUK9	544 aa		4.64	□□□□□ -1.67
USP25-208	ENST00000478932	TBC1D12	O60347	775 aa		4.64	□□□□□ -1.67
USP25-208	ENST00000478932	FAM86B2	P0C5J1	330 aa		4.64	□□□□□ -1.67
USP25-208	ENST00000478932	CDC25B	P30305	580 aa		4.64	□□□□□ -1.67
USP25-208	ENST00000478932	INPP5B	P32019	993 aa		4.64	□□□□□ -1.67
USP25-208	ENST00000478932	TIE1	P35590	1138 aa		4.64	□□□□□ -1.67
USP25-208	ENST00000478932	VASP	P50552	380 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
USP25-208	ENST00000478932	PMS1	P54277	932 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
USP25-208	ENST00000478932	ARHGAP4	P98171	946 aa		4.64	□□□□□ -1.67
USP25-208	ENST00000478932	STK4	Q13043	487 aa		4.64	□□□□□ -1.67
USP25-208	ENST00000478932	ECM1	Q16610	540 aa		4.64	□□□□□ -1.67
USP25-208	ENST00000478932	KMT5B	Q4FZB7	885 aa		4.64	□□□□□ -1.67
USP25-208	ENST00000478932	ARMCX5	Q6P1M9	558 aa		4.64	□□□□□ -1.67
USP25-208	ENST00000478932	ARHGAP27	Q6ZUM4	889 aa		4.64	□□□□□ -1.67
USP25-208	ENST00000478932	CPXCR1	Q8N123	301 aa		4.64	□□□□□ -1.67
USP25-208	ENST00000478932	ZKSCAN4	Q969J2	545 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
USP25-208	ENST00000478932	FEZ1	Q99689	392 aa		4.64	□□□□□ -1.67
USP25-208	ENST00000478932	TRIM9	Q9C026	710 aa		4.64	□□□□□ -1.67
USP25-208	ENST00000478932	TSPYL2	Q9H2G4	693 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
USP25-208	ENST00000478932	TRMT1	Q9NXH9	659 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
USP25-208	ENST00000478932	USP27X	A6NNY8	438 aa		4.63	□□□□□ -1.67
USP25-208	ENST00000478932	FZD9	O00144	591 aa		4.63	□□□□□ -1.67
USP25-208	ENST00000478932	TEX33	O43247	280 aa		4.63	□□□□□ -1.67
USP25-208	ENST00000478932	SSB	P05455	408 aa	Known RBP eCLIP	4.63	□□□□□ -1.67
USP25-208	ENST00000478932	TPM3	P06753	285 aa		4.63	□□□□□ -1.67
USP25-208	ENST00000478932	FCER1A	P12319	257 aa		4.63	□□□□□ -1.67
USP25-208	ENST00000478932	IDE	P14735	1019 aa		4.63	□□□□□ -1.67
USP25-208	ENST00000478932	STAT3	P40763	770 aa		4.63	□□□□□ -1.67
USP25-208	ENST00000478932	EPS15	P42566	896 aa		4.63	□□□□□ -1.67
USP25-208	ENST00000478932	ZNF280A	P59817	542 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
USP25-208	ENST00000478932	RAD51AP2	Q09MP3	1159 aa		4.63	□□□□□ -1.67
USP25-208	ENST00000478932	SPP2	Q13103	211 aa		4.63	□□□□□ -1.67
USP25-208	ENST00000478932	GRB10	Q13322	594 aa		4.63	□□□□□ -1.67
USP25-208	ENST00000478932	PRKG1	Q13976	671 aa		4.63	□□□□□ -1.67
USP25-208	ENST00000478932	PDIA5	Q14554	519 aa		4.63	□□□□□ -1.67
USP25-208	ENST00000478932	MCM6	Q14566	821 aa		4.63	□□□□□ -1.67
USP25-208	ENST00000478932	TPD52L1	Q16890	204 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
USP25-208	ENST00000478932	ZNF658	Q5TYW1	1059 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
USP25-208	ENST00000478932	SPATA1	Q5VX52	437 aa		4.63	□□□□□ -1.67
USP25-208	ENST00000478932	PPP1R18	Q6NYC8	613 aa		4.63	□□□□□ -1.67
USP25-208	ENST00000478932	BTNL9	Q6UXG8	535 aa		4.63	□□□□□ -1.67
USP25-208	ENST00000478932	SNX29	Q8TEQ0	813 aa		4.63	□□□□□ -1.67
USP25-208	ENST00000478932	CPLX3	Q8WVH0	158 aa		4.63	□□□□□ -1.67
USP25-208	ENST00000478932	UPF1	Q92900	1129 aa	Known RBP eCLIP	4.63	□□□□□ -1.67
USP25-208	ENST00000478932	CALML4	Q96GE6	196 aa		4.63	□□□□□ -1.67
USP25-208	ENST00000478932	C16orf45	Q96MC5	204 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
USP25-208	ENST00000478932	AGBL1	Q96MI9	1066 aa		4.63	□□□□□ -1.67
USP25-208	ENST00000478932	PYM1	Q9BRP8	204 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
USP25-208	ENST00000478932	ANO3	Q9BYT9	981 aa		4.63	□□□□□ -1.67
USP25-208	ENST00000478932	VCPKMT	Q9H867	229 aa		4.63	□□□□□ -1.67
USP25-208	ENST00000478932	POLD4	Q9HCU8	107 aa		4.63	□□□□□ -1.67
USP25-208	ENST00000478932	GOPC	Q9HD26	462 aa		4.63	□□□□□ -1.67
USP25-208	ENST00000478932	HOMER2	Q9NSB8	354 aa		4.63	□□□□□ -1.67
USP25-208	ENST00000478932	BLOC1S4	Q9NUP1	217 aa		4.63	□□□□□ -1.67
USP25-208	ENST00000478932	DACH1	Q9UI36	760 aa		4.63	□□□□□ -1.67
USP25-208	ENST00000478932	METRN	Q9UJH8	293 aa		4.63	□□□□□ -1.67
USP25-208	ENST00000478932	CTNND2	Q9UQB3	1225 aa		4.63	□□□□□ -1.67
USP25-208	ENST00000478932	MYH7B	A7E2Y1	1941 aa		4.63	□□□□□ -1.67
USP25-208	ENST00000478932	ZNF541	Q9H0D2	1346 aa		4.63	□□□□□ -1.67
USP25-208	ENST00000478932	MYMK	A6NI61	221 aa		4.63	□□□□□ -1.67
USP25-208	ENST00000478932	KLRC4	O43908	158 aa		4.63	□□□□□ -1.67
USP25-208	ENST00000478932	ERCC3	P19447	782 aa		4.63	□□□□□ -1.67
USP25-208	ENST00000478932	SFPQ	P23246	707 aa	Known RBP eCLIP	4.63	□□□□□ -1.67
USP25-208	ENST00000478932	CCT6A	P40227	531 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
USP25-208	ENST00000478932	USP11	P51784	963 aa		4.63	□□□□□ -1.67
USP25-208	ENST00000478932	ADK	P55263	362 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
USP25-208	ENST00000478932	ASIC1	P78348	528 aa		4.63	□□□□□ -1.67
USP25-208	ENST00000478932	CCZ1B	P86790	482 aa		4.63	□□□□□ -1.67

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