RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478490.5

MITF-215, Transcript of melanogenesis associated transcription factor, humanhuman

TSL 5

Gene MITF, Length 1,642 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MITF-215ENST00000478490 TMEM87AQ8NBN3 555 aa7.25□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa7.25□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 DDX11Q96FC9 970 aa7.25□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 AGBL1Q96MI9 1066 aa7.25□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa7.25□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 TINF2Q9BSI4 451 aa7.25□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 TEX13BQ9BXU2 312 aa7.25□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 PRO3102Q9H379 93 aa7.25□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa7.25□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 GPCPD1Q9NPB8 672 aa7.25□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 SLC5A4Q9NY91 659 aa7.25□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 FEM1BQ9UK73 627 aa7.25□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa7.25□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa7.24□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 KBTBD13C9JR72 458 aa7.24□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 SEPT4O43236 478 aa7.24□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 STX6O43752 255 aa7.24□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP7.24□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 ALAS1P13196 640 aa7.24□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 CAPN2P17655 700 aa7.24□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 RPS6KB1P23443 525 aa7.24□□□□□ -1.25
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MITF-215ENST00000478490 RTP1P59025 263 aa7.24□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 CNTN2Q02246 1040 aa7.24□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 PKP1Q13835 747 aa7.24□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 LRRC41Q15345 812 aa7.24□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 ALX1Q15699 326 aa7.24□□□□□ -1.25
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MITF-215ENST00000478490 ANKRD35Q8N283 1001 aa7.24□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 ANAPC4Q9UJX5 808 aa7.24□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 GBF1Q92538 1859 aa7.24□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 DOCK5Q9H7D0 1870 aa7.24□□□□□ -1.25
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MITF-215ENST00000478490 ORC4O43929 436 aa7.23□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 PTGS1P23219 599 aa7.23□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 STAT2P52630 851 aa7.23□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 MUM1L1Q5H9M0 696 aa7.23□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 SMYD5Q6GMV2 418 aa7.23□□□□□ -1.25
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MITF-215ENST00000478490 NYAP1Q6ZVC0 841 aa7.23□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 ARRDC4Q8NCT1 418 aa7.23□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 STAG1Q8WVM7 1258 aa7.23□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 NEK1Q96PY6 1258 aa7.23□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
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MITF-215ENST00000478490 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa7.23□□□□□ -1.25
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MITF-215ENST00000478490 EYSQ5T1H1 3165 aa7.23□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa7.23□□□□□ -1.25
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MITF-215ENST00000478490 ADCY6O43306 1168 aa7.23□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 MSCO60682 206 aa7.23□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 F13A1P00488 732 aa7.23□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 RARBP10826 455 aa7.23□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 FECHP22830 423 aa7.23□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 COPB2P35606 906 aa7.23□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 ADCK5Q3MIX3 580 aa7.23□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 TRIM60Q495X7 471 aa7.23□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 AKNAD1Q5T1N1 836 aa7.23□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa7.23□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 MFSD6Q6ZSS7 791 aa7.23□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 CHURC1Q8WUH1 139 aa7.23□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 GMCL1Q96IK5 515 aa7.23□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 FGD4Q96M96 766 aa7.23□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 TRERF1Q96PN7 1200 aa7.23□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 PRR12Q9ULL5 1215 aa7.23□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 CNPY2Q9Y2B0 182 aa7.23□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 ZNF536O15090 1300 aa7.23□□□□□ -1.25
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MITF-215ENST00000478490 ATP2A1O14983 1001 aa7.22□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 GOLGA8HP0CJ92 632 aa7.22□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 SYT1P21579 422 aa7.22□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 GJB2P29033 226 aa7.22□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 CCDC173Q0VFZ6 552 aa7.22□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa7.22□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 NSMFQ6X4W1 530 aa7.22□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa7.22□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 FAM160B2Q86V87 743 aa7.22□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 CCDC83Q8IWF9 413 aa7.22□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa7.22□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 DCAF4Q8WV16 495 aa7.22□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
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