RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476231.1

SYF2-204, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SYF2, Length 1,962 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-204ENST00000476231 DPYDQ12882 1025 aa21.45■■□□□ 1.02
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SYF2-204ENST00000476231 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa21.45■■□□□ 1.02
SYF2-204ENST00000476231 SLC37A4O43826 429 aa21.44■■□□□ 1.02
SYF2-204ENST00000476231 CDC25AP30304 524 aa21.44■■□□□ 1.02
SYF2-204ENST00000476231 STAT6P42226 847 aa21.44■■□□□ 1.02
SYF2-204ENST00000476231 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP21.44■■□□□ 1.02
SYF2-204ENST00000476231 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP21.44■■□□□ 1.02
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SYF2-204ENST00000476231 IGSF22Q8N9C0 903 aa21.44■■□□□ 1.02
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SYF2-204ENST00000476231 ZNF112Q9UJU3 913 aa21.44■■□□□ 1.02
SYF2-204ENST00000476231 MYH7BA7E2Y1 1941 aa21.44■■□□□ 1.02
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SYF2-204ENST00000476231 TECP42680 631 aa21.43■■□□□ 1.02
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SYF2-204ENST00000476231 PIK3CDO00329 1044 aa21.42■■□□□ 1.02
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SYF2-204ENST00000476231 TXKP42681 527 aa21.42■■□□□ 1.02
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SYF2-204ENST00000476231 PDIA5Q14554 519 aa21.42■■□□□ 1.02
SYF2-204ENST00000476231 TSC1Q92574 1164 aa21.42■■□□□ 1.02
SYF2-204ENST00000476231 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa21.41■■□□□ 1.02
SYF2-204ENST00000476231 CYP3A7P24462 503 aa21.41■■□□□ 1.02
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SYF2-204ENST00000476231 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa21.37■■□□□ 1.01
SYF2-204ENST00000476231 MARCH6O60337 910 aa21.37■■□□□ 1.01
SYF2-204ENST00000476231 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP21.37■■□□□ 1.01
SYF2-204ENST00000476231 PLCG1P19174 1290 aa21.37■■□□□ 1.01
SYF2-204ENST00000476231 HAS1Q92839 578 aa21.37■■□□□ 1.01
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