RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466245.1

TTLL3-223, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 3

Gene TTLL3, Length 616 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-223	ENST00000466245	SART3	Q15020	963 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
TTLL3-223	ENST00000466245	FSCN1	Q16658	493 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
TTLL3-223	ENST00000466245	STOX1	Q6ZVD7	989 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TTLL3-223	ENST00000466245	TLK2	Q86UE8	772 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TTLL3-223	ENST00000466245	SKAP1	Q86WV1	359 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TTLL3-223	ENST00000466245	TMTC2	Q8N394	836 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TTLL3-223	ENST00000466245	KCNB2	Q92953	911 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TTLL3-223	ENST00000466245	KIFC2	Q96AC6	838 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TTLL3-223	ENST00000466245	TMEM87B	Q96K49	555 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TTLL3-223	ENST00000466245	LRFN3	Q9BTN0	628 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TTLL3-223	ENST00000466245	KAT14	Q9H8E8	782 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TTLL3-223	ENST00000466245	ANO2	Q9NQ90	1003 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TTLL3-223	ENST00000466245	ISY1	Q9ULR0	285 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
TTLL3-223	ENST00000466245	LOC102724159	A0A0B4J2E5	919 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TTLL3-223	ENST00000466245	ERICH2	A1L162	156 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TTLL3-223	ENST00000466245	REC8	O95072	547 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TTLL3-223	ENST00000466245	ICAM1	P05362	532 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TTLL3-223	ENST00000466245	LCT	P09848	1927 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TTLL3-223	ENST00000466245	RABGGTB	P53611	331 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TTLL3-223	ENST00000466245	PWP2	Q15269	919 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
TTLL3-223	ENST00000466245	IFIT1B	Q5T764	474 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
TTLL3-223	ENST00000466245	SYDE2	Q5VT97	1194 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TTLL3-223	ENST00000466245	CREB3L3	Q68CJ9	461 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TTLL3-223	ENST00000466245	CXCL17	Q6UXB2	119 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TTLL3-223	ENST00000466245	MUC6	Q6W4X9	2439 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TTLL3-223	ENST00000466245	KCTD1	Q719H9	257 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TTLL3-223	ENST00000466245	CYB5R4	Q7L1T6	521 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TTLL3-223	ENST00000466245	CCDC144CP	Q8IYA2	1237 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TTLL3-223	ENST00000466245	HLA-C	Q95604	372 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TTLL3-223	ENST00000466245	SLC9A7	Q96T83	725 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TTLL3-223	ENST00000466245	NOC4L	Q9BVI4	516 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
TTLL3-223	ENST00000466245	ACAD9	Q9H845	621 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TTLL3-223	ENST00000466245	EIF5B	O60841	1220 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
TTLL3-223	ENST00000466245	POU3F3	P20264	500 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53
TTLL3-223	ENST00000466245	MCM5	P33992	734 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TTLL3-223	ENST00000466245	LIFR	P42702	1097 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TTLL3-223	ENST00000466245	NKX3-2	P78367	333 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TTLL3-223	ENST00000466245	BEX3	Q00994	111 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TTLL3-223	ENST00000466245	KRT32	Q14532	448 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TTLL3-223	ENST00000466245	CCDC96	Q2M329	555 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TTLL3-223	ENST00000466245	BRDT	Q58F21	947 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53
TTLL3-223	ENST00000466245	IGDCC4	Q8TDY8	1250 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TTLL3-223	ENST00000466245	ZKSCAN3	Q9BRR0	538 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TTLL3-223	ENST00000466245	RAVER2	Q9HCJ3	691 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
TTLL3-223	ENST00000466245	TAF6L	Q9Y6J9	622 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TTLL3-223	ENST00000466245	XIRP2	A4UGR9	3374 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TTLL3-223	ENST00000466245	IFIT3	O14879	490 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.53
TTLL3-223	ENST00000466245	DYNC1LI2	O43237	492 aa	Predicted RBP	11.71	□□□□□ -0.53
TTLL3-223	ENST00000466245	CA3	P07451	260 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TTLL3-223	ENST00000466245	SMARCA1	P28370	1054 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TTLL3-223	ENST00000466245	RFC2	P35250	354 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TTLL3-223	ENST00000466245	ANTXR2	P58335	489 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TTLL3-223	ENST00000466245	TROAP	Q12815	778 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TTLL3-223	ENST00000466245	IK	Q13123	557 aa	Predicted RBP	11.71	□□□□□ -0.53
TTLL3-223	ENST00000466245	SGMS1	Q86VZ5	419 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TTLL3-223	ENST00000466245	SLC43A3	Q8NBI5	491 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TTLL3-223	ENST00000466245	PHOSPHO2	Q8TCD6	241 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TTLL3-223	ENST00000466245	FGD4	Q96M96	766 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TTLL3-223	ENST00000466245	EPHX3	Q9H6B9	360 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TTLL3-223	ENST00000466245	GPHN	Q9NQX3	736 aa	Predicted RBP	11.71	□□□□□ -0.53
TTLL3-223	ENST00000466245	HOMER2	Q9NSB8	354 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TTLL3-223	ENST00000466245	POLR3E	Q9NVU0	708 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TTLL3-223	ENST00000466245		Q9Y3F1	56 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TTLL3-223	ENST00000466245	GTF3C3	Q9Y5Q9	886 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TTLL3-223	ENST00000466245	MTCH2	Q9Y6C9	303 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TTLL3-223	ENST00000466245	UMODL1	Q5DID0	1318 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TTLL3-223	ENST00000466245	PALM3	A6NDB9	673 aa	Predicted RBP	11.7	□□□□□ -0.54
TTLL3-223	ENST00000466245	ADCY6	O43306	1168 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TTLL3-223	ENST00000466245	B4GALT4	O60513	344 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TTLL3-223	ENST00000466245	GPR37L1	O60883	481 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TTLL3-223	ENST00000466245	DDAH1	O94760	285 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TTLL3-223	ENST00000466245	HMGB1	P09429	215 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
TTLL3-223	ENST00000466245	PARP1	P09874	1014 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
TTLL3-223	ENST00000466245	MYOG	P15173	224 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TTLL3-223	ENST00000466245	HSPA4	P34932	840 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TTLL3-223	ENST00000466245	RCAN1	P53805	252 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TTLL3-223	ENST00000466245	TRAF1	Q13077	416 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TTLL3-223	ENST00000466245	WTAP	Q15007	396 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TTLL3-223	ENST00000466245	IQSEC1	Q6DN90	963 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TTLL3-223	ENST00000466245	TTBK2	Q6IQ55	1244 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TTLL3-223	ENST00000466245	RASGRP2	Q7LDG7	609 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TTLL3-223	ENST00000466245	FBXL16	Q8N461	479 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TTLL3-223	ENST00000466245	FAM133A	Q8N9E0	248 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TTLL3-223	ENST00000466245	RETREG2	Q8NC44	543 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TTLL3-223	ENST00000466245	RGS22	Q8NE09	1264 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TTLL3-223	ENST00000466245	ARNTL2	Q8WYA1	636 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TTLL3-223	ENST00000466245	MTMR8	Q96EF0	704 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TTLL3-223	ENST00000466245	TRPV6	Q9H1D0	765 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TTLL3-223	ENST00000466245	WNT8A	Q9H1J5	351 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TTLL3-223	ENST00000466245	BRWD1	Q9NSI6	2320 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TTLL3-223	ENST00000466245	KCNJ6	P48051	423 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TTLL3-223	ENST00000466245	CPT1A	P50416	773 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TTLL3-223	ENST00000466245	IRX5	P78411	483 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
TTLL3-223	ENST00000466245	GHRHR	Q02643	423 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TTLL3-223	ENST00000466245	BFSP2	Q13515	415 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TTLL3-223	ENST00000466245	GRM4	Q14833	912 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TTLL3-223	ENST00000466245	CSPP1	Q1MSJ5	1256 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TTLL3-223	ENST00000466245	DEFB128	Q7Z7B8	93 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TTLL3-223	ENST00000466245	CCDC155	Q8N6L0	562 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TTLL3-223	ENST00000466245	MORC4	Q8TE76	937 aa		11.69	□□□□□ -0.54

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