RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466015.1

EHD1-208, Transcript of EH domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene EHD1, Length 1,290 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD1-208ENST00000466015 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa21.95■■□□□ 1.1
EHD1-208ENST00000466015 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
EHD1-208ENST00000466015 CCDC82Q8N4S0 544 aa21.95■■□□□ 1.1
EHD1-208ENST00000466015 SAMD3Q8N6K7 520 aa21.95■■□□□ 1.1
EHD1-208ENST00000466015 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
EHD1-208ENST00000466015 SNX14Q9Y5W7 946 aa21.95■■□□□ 1.1
EHD1-208ENST00000466015 ZBTB43O43298 467 aa21.94■■□□□ 1.1
EHD1-208ENST00000466015 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
EHD1-208ENST00000466015 PSMA5P28066 241 aa21.94■■□□□ 1.1
EHD1-208ENST00000466015 TLE2Q04725 743 aa21.94■■□□□ 1.1
EHD1-208ENST00000466015 TTLL4Q14679 1199 aa21.94■■□□□ 1.1
EHD1-208ENST00000466015 SNX17Q15036 470 aa21.94■■□□□ 1.1
EHD1-208ENST00000466015 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
EHD1-208ENST00000466015 C1orf53Q5VUE5 145 aa21.94■■□□□ 1.1
EHD1-208ENST00000466015 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
EHD1-208ENST00000466015 APOA5Q6Q788 366 aa21.94■■□□□ 1.1
EHD1-208ENST00000466015 SEPT14Q6ZU15 432 aa21.94■■□□□ 1.1
EHD1-208ENST00000466015 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
EHD1-208ENST00000466015 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
EHD1-208ENST00000466015 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa21.93■■□□□ 1.1
EHD1-208ENST00000466015 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
EHD1-208ENST00000466015 OPLAHO14841 1288 aa21.93■■□□□ 1.1
EHD1-208ENST00000466015 ELP1O95163 1332 aa21.93■■□□□ 1.1
EHD1-208ENST00000466015 TXNP10599 105 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
EHD1-208ENST00000466015 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
EHD1-208ENST00000466015 FCHSD1Q86WN1 690 aa21.93■■□□□ 1.1
EHD1-208ENST00000466015 OR6J1Q8NGC5 347 aa21.93■■□□□ 1.1
EHD1-208ENST00000466015 KCNB2Q92953 911 aa21.93■■□□□ 1.1
EHD1-208ENST00000466015 CUL5Q93034 780 aa21.93■■□□□ 1.1
EHD1-208ENST00000466015 PXMP2Q9NR77 195 aa21.93■■□□□ 1.1
EHD1-208ENST00000466015 DCDC2CA8MYV0 355 aa21.92■■□□□ 1.1
EHD1-208ENST00000466015 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP21.92■■□□□ 1.1
EHD1-208ENST00000466015 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
EHD1-208ENST00000466015 CABYRO75952 493 aa21.92■■□□□ 1.1
EHD1-208ENST00000466015 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
EHD1-208ENST00000466015 CPA1P15085 419 aa21.92■■□□□ 1.1
EHD1-208ENST00000466015 PTGS1P23219 599 aa21.92■■□□□ 1.1
EHD1-208ENST00000466015 CPT1AP50416 773 aa21.92■■□□□ 1.1
EHD1-208ENST00000466015 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
EHD1-208ENST00000466015 RTN1Q16799 776 aa21.92■■□□□ 1.1
EHD1-208ENST00000466015 TMEM63BQ5T3F8 832 aa21.92■■□□□ 1.1
EHD1-208ENST00000466015 CXCL17Q6UXB2 119 aa21.92■■□□□ 1.1
EHD1-208ENST00000466015 TMTC3Q6ZXV5 915 aa21.92■■□□□ 1.1
EHD1-208ENST00000466015 MROH7Q68CQ1 1323 aa21.91■■□□□ 1.1
EHD1-208ENST00000466015 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
EHD1-208ENST00000466015 GOLGA8AA7E2F4 631 aa21.91■■□□□ 1.1
EHD1-208ENST00000466015 GOLGA8BA8MQT2 603 aa21.91■■□□□ 1.1
EHD1-208ENST00000466015 CTAGE5O15320 804 aa21.91■■□□□ 1.1
EHD1-208ENST00000466015 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
EHD1-208ENST00000466015 NR3C2P08235 984 aa21.91■■□□□ 1.1
EHD1-208ENST00000466015 NKX3-2P78367 333 aa21.91■■□□□ 1.1
EHD1-208ENST00000466015 GHRHRQ02643 423 aa21.91■■□□□ 1.1
EHD1-208ENST00000466015 Q6ZUG5 572 aa21.91■■□□□ 1.1
EHD1-208ENST00000466015 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa21.91■■□□□ 1.1
EHD1-208ENST00000466015 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
EHD1-208ENST00000466015 BRPF3Q9ULD4 1205 aa21.91■■□□□ 1.1
EHD1-208ENST00000466015 CLTBP09497 229 aa21.9■■□□□ 1.1
EHD1-208ENST00000466015 CASTP20810 708 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
EHD1-208ENST00000466015 GDF15Q99988 308 aa21.9■■□□□ 1.1
EHD1-208ENST00000466015 CEP290O15078 2479 aa21.89■■□□□ 1.1
EHD1-208ENST00000466015 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa21.89■■□□□ 1.09
EHD1-208ENST00000466015 RPS6KB1P23443 525 aa21.89■■□□□ 1.09
EHD1-208ENST00000466015 CCND2P30279 289 aa21.89■■□□□ 1.09
EHD1-208ENST00000466015 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa21.89■■□□□ 1.09
EHD1-208ENST00000466015 BRF1Q92994 677 aa21.89■■□□□ 1.09
EHD1-208ENST00000466015 PDCD2LQ9BRP1 358 aa21.89■■□□□ 1.09
EHD1-208ENST00000466015 PDLIM7Q9NR12 457 aa21.89■■□□□ 1.09
EHD1-208ENST00000466015 TMEM39AQ9NV64 488 aa21.89■■□□□ 1.09
EHD1-208ENST00000466015 POLR3EQ9NVU0 708 aa21.89■■□□□ 1.09
EHD1-208ENST00000466015 MRVI1Q9Y6F6 885 aa21.89■■□□□ 1.09
EHD1-208ENST00000466015 SMCHD1A6NHR9 2005 aa21.89■■□□□ 1.09
EHD1-208ENST00000466015 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa21.88■■□□□ 1.09
EHD1-208ENST00000466015 A0A1W2PPC1 479 aa21.88■■□□□ 1.09
EHD1-208ENST00000466015 MYL3P08590 195 aa21.88■■□□□ 1.09
EHD1-208ENST00000466015 BMP8BP34820 402 aa21.88■■□□□ 1.09
EHD1-208ENST00000466015 APOBRQ0VD83 1088 aa21.88■■□□□ 1.09
EHD1-208ENST00000466015 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa21.88■■□□□ 1.09
EHD1-208ENST00000466015 TOX2Q96NM4 488 aa21.88■■□□□ 1.09
EHD1-208ENST00000466015 MCM3APO60318 1980 aa21.88■■□□□ 1.09
EHD1-208ENST00000466015 ALPK3Q96L96 1907 aa21.87■■□□□ 1.09
EHD1-208ENST00000466015 ARVCFO00192 962 aa21.87■■□□□ 1.09
EHD1-208ENST00000466015 TLR3O15455 904 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
EHD1-208ENST00000466015 GH1P01241 217 aa21.87■■□□□ 1.09
EHD1-208ENST00000466015 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP21.87■■□□□ 1.09
EHD1-208ENST00000466015 RCAN1P53805 252 aa21.87■■□□□ 1.09
EHD1-208ENST00000466015 PGM5Q15124 567 aa21.87■■□□□ 1.09
EHD1-208ENST00000466015 LY6KQ17RY6 165 aa21.87■■□□□ 1.09
EHD1-208ENST00000466015 COPS5Q92905 334 aa21.87■■□□□ 1.09
EHD1-208ENST00000466015 USP26Q9BXU7 913 aa21.87■■□□□ 1.09
EHD1-208ENST00000466015 PRO3102Q9H379 93 aa21.87■■□□□ 1.09
EHD1-208ENST00000466015 PSTPIP2Q9H939 334 aa21.87■■□□□ 1.09
EHD1-208ENST00000466015 PCDH10Q9P2E7 1040 aa21.87■■□□□ 1.09
EHD1-208ENST00000466015 KPNA6O60684 536 aa21.86■■□□□ 1.09
EHD1-208ENST00000466015 RAG1P15918 1043 aa21.86■■□□□ 1.09
EHD1-208ENST00000466015 VSIG10LQ86VR7 867 aa21.86■■□□□ 1.09
EHD1-208ENST00000466015 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa21.86■■□□□ 1.09
EHD1-208ENST00000466015 LCTP09848 1927 aa21.86■■□□□ 1.09
EHD1-208ENST00000466015 LRRC37A2A6NM11 1700 aa21.86■■□□□ 1.09
EHD1-208ENST00000466015 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
EHD1-208ENST00000466015 ARIH2O95376 493 aa21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.8 ms