RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465902.1

USP19-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 19, human

TSL 3

Gene USP19, Length 617 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP19-210	ENST00000465902	MORC4	Q8TE76	937 aa		20.46	■□□□□ 0.87
USP19-210	ENST00000465902	KATNBL1	Q9H079	304 aa		20.46	■□□□□ 0.87
USP19-210	ENST00000465902	C11orf49	Q9H6J7	331 aa		20.46	■□□□□ 0.87
USP19-210	ENST00000465902	PDGFC	Q9NRA1	345 aa		20.46	■□□□□ 0.87
USP19-210	ENST00000465902	PPFIA3	O75145	1194 aa		20.45	■□□□□ 0.86
USP19-210	ENST00000465902	NEK4	P51957	841 aa		20.45	■□□□□ 0.86
USP19-210	ENST00000465902	EVC	P57679	992 aa		20.45	■□□□□ 0.86
USP19-210	ENST00000465902	FUT2	Q10981	343 aa		20.45	■□□□□ 0.86
USP19-210	ENST00000465902	RNF180	Q86T96	592 aa		20.45	■□□□□ 0.86
USP19-210	ENST00000465902	ZNF274	Q96GC6	653 aa	Predicted RBP	20.45	■□□□□ 0.86
USP19-210	ENST00000465902	PSTPIP2	Q9H939	334 aa		20.45	■□□□□ 0.86
USP19-210	ENST00000465902	PXMP2	Q9NR77	195 aa		20.45	■□□□□ 0.86
USP19-210	ENST00000465902	KIAA1217	Q5T5P2	1943 aa		20.45	■□□□□ 0.86
USP19-210	ENST00000465902	C11orf97	A0A1B0GVM6	126 aa	Predicted RBP	20.44	■□□□□ 0.86
USP19-210	ENST00000465902	DNM1L	O00429	736 aa		20.44	■□□□□ 0.86
USP19-210	ENST00000465902	CPLX1	O14810	134 aa		20.44	■□□□□ 0.86
USP19-210	ENST00000465902	DUSP11	O75319	330 aa	Known RBP	20.44	■□□□□ 0.86
USP19-210	ENST00000465902	MYCL	P12524	364 aa	Predicted RBP	20.44	■□□□□ 0.86
USP19-210	ENST00000465902	NAPA	P54920	295 aa		20.44	■□□□□ 0.86
USP19-210	ENST00000465902	ANKRD1	Q15327	319 aa		20.44	■□□□□ 0.86
USP19-210	ENST00000465902	LRRC41	Q15345	812 aa		20.44	■□□□□ 0.86
USP19-210	ENST00000465902	IQSEC1	Q6DN90	963 aa		20.44	■□□□□ 0.86
USP19-210	ENST00000465902	TAPT1	Q6NXT6	567 aa		20.44	■□□□□ 0.86
USP19-210	ENST00000465902	PHKB	Q93100	1093 aa		20.44	■□□□□ 0.86
USP19-210	ENST00000465902	IWS1	Q96ST2	819 aa		20.44	■□□□□ 0.86
USP19-210	ENST00000465902	SENP6	Q9GZR1	1112 aa	Predicted RBP	20.44	■□□□□ 0.86
USP19-210	ENST00000465902	UPF2	Q9HAU5	1272 aa	Known RBP	20.44	■□□□□ 0.86
USP19-210	ENST00000465902	SPC25	Q9HBM1	224 aa		20.44	■□□□□ 0.86
USP19-210	ENST00000465902	COLQ	Q9Y215	455 aa	Predicted RBP	20.44	■□□□□ 0.86
USP19-210	ENST00000465902	NR2E3	Q9Y5X4	410 aa		20.44	■□□□□ 0.86
USP19-210	ENST00000465902	ADCY6	O43306	1168 aa		20.43	■□□□□ 0.86
USP19-210	ENST00000465902	C6orf222	P0C671	652 aa	Predicted RBP	20.43	■□□□□ 0.86
USP19-210	ENST00000465902	EDNRB	P24530	442 aa		20.43	■□□□□ 0.86
USP19-210	ENST00000465902	AK2	P54819	239 aa		20.43	■□□□□ 0.86
USP19-210	ENST00000465902	GHRHR	Q02643	423 aa		20.43	■□□□□ 0.86
USP19-210	ENST00000465902	STXBP2	Q15833	593 aa		20.43	■□□□□ 0.86
USP19-210	ENST00000465902	WWC2	Q6AWC2	1192 aa		20.43	■□□□□ 0.86
USP19-210	ENST00000465902	USP17L6P	Q6QN14	398 aa		20.43	■□□□□ 0.86
USP19-210	ENST00000465902	SLC26A6	Q9BXS9	759 aa		20.43	■□□□□ 0.86
USP19-210	ENST00000465902	C22orf23	Q9BZE7	217 aa		20.43	■□□□□ 0.86
USP19-210	ENST00000465902	SYNRG	Q9UMZ2	1314 aa		20.43	■□□□□ 0.86
USP19-210	ENST00000465902	NID2	Q14112	1375 aa		20.43	■□□□□ 0.86
USP19-210	ENST00000465902	NR3C2	P08235	984 aa		20.42	■□□□□ 0.86
USP19-210	ENST00000465902	CPLX2	Q6PUV4	134 aa	Known RBP	20.42	■□□□□ 0.86
USP19-210	ENST00000465902	SEPT14	Q6ZU15	432 aa		20.42	■□□□□ 0.86
USP19-210	ENST00000465902	WDR11	Q9BZH6	1224 aa		20.42	■□□□□ 0.86
USP19-210	ENST00000465902	AP5M1	Q9H0R1	490 aa		20.42	■□□□□ 0.86
USP19-210	ENST00000465902	SLK	Q9H2G2	1235 aa	Predicted RBP	20.42	■□□□□ 0.86
USP19-210	ENST00000465902	MYH7B	A7E2Y1	1941 aa		20.41	■□□□□ 0.86
USP19-210	ENST00000465902	DYNC1LI2	O43237	492 aa	Predicted RBP	20.41	■□□□□ 0.86
USP19-210	ENST00000465902	EVI5	O60447	810 aa		20.41	■□□□□ 0.86
USP19-210	ENST00000465902	SMPD1	P17405	629 aa		20.41	■□□□□ 0.86
USP19-210	ENST00000465902	FERMT2	Q96AC1	680 aa		20.41	■□□□□ 0.86
USP19-210	ENST00000465902	IL17RA	Q96F46	866 aa		20.41	■□□□□ 0.86
USP19-210	ENST00000465902	PDCD2L	Q9BRP1	358 aa		20.41	■□□□□ 0.86
USP19-210	ENST00000465902	ALDH8A1	Q9H2A2	487 aa	Predicted RBP	20.41	■□□□□ 0.86
USP19-210	ENST00000465902	RBM27	Q9P2N5	1060 aa	Known RBP	20.41	■□□□□ 0.86
USP19-210	ENST00000465902	STXBP3	O00186	592 aa		20.4	■□□□□ 0.86
USP19-210	ENST00000465902	MEIS2	O14770	477 aa		20.4	■□□□□ 0.86
USP19-210	ENST00000465902	PRPF3	O43395	683 aa	Known RBP	20.4	■□□□□ 0.86
USP19-210	ENST00000465902	EIF3J	O75822	258 aa	Known RBP	20.4	■□□□□ 0.86
USP19-210	ENST00000465902	SCG2	P13521	617 aa		20.4	■□□□□ 0.86
USP19-210	ENST00000465902	IFNAR1	P17181	557 aa		20.4	■□□□□ 0.86
USP19-210	ENST00000465902	SSRP1	Q08945	709 aa	Known RBP	20.4	■□□□□ 0.86
USP19-210	ENST00000465902	PGM5	Q15124	567 aa		20.4	■□□□□ 0.86
USP19-210	ENST00000465902	UBE2S	Q16763	222 aa		20.4	■□□□□ 0.86
USP19-210	ENST00000465902	PFKFB3	Q16875	520 aa	Predicted RBP	20.4	■□□□□ 0.86
USP19-210	ENST00000465902	GNAS	Q5JWF2	1037 aa		20.4	■□□□□ 0.86
USP19-210	ENST00000465902	TMEM63B	Q5T3F8	832 aa		20.4	■□□□□ 0.86
USP19-210	ENST00000465902	TLK2	Q86UE8	772 aa		20.4	■□□□□ 0.86
USP19-210	ENST00000465902	TRIM22	Q8IYM9	498 aa		20.4	■□□□□ 0.86
USP19-210	ENST00000465902	SCFD2	Q8WU76	684 aa		20.4	■□□□□ 0.86
USP19-210	ENST00000465902	ALPK3	Q96L96	1907 aa		20.4	■□□□□ 0.86
USP19-210	ENST00000465902	BARHL2	Q9NY43	387 aa		20.4	■□□□□ 0.86
USP19-210	ENST00000465902	TPCN1	Q9ULQ1	816 aa		20.4	■□□□□ 0.86
USP19-210	ENST00000465902	SMCO2	A6NFE2	343 aa		20.39	■□□□□ 0.85
USP19-210	ENST00000465902	hCG_1984214	I3L0E3	225 aa		20.39	■□□□□ 0.85
USP19-210	ENST00000465902	PIK3CD	O00329	1044 aa		20.39	■□□□□ 0.85
USP19-210	ENST00000465902	ADAMTS4	O75173	837 aa		20.39	■□□□□ 0.85
USP19-210	ENST00000465902	TXN	P10599	105 aa	Known RBP	20.39	■□□□□ 0.85
USP19-210	ENST00000465902	PTGS1	P23219	599 aa		20.39	■□□□□ 0.85
USP19-210	ENST00000465902	CCND2	P30279	289 aa		20.39	■□□□□ 0.85
USP19-210	ENST00000465902	ADCY7	P51828	1080 aa		20.39	■□□□□ 0.85
USP19-210	ENST00000465902	ATN1	P54259	1190 aa	Predicted RBP	20.39	■□□□□ 0.85
USP19-210	ENST00000465902	GJA9	P57773	515 aa		20.39	■□□□□ 0.85
USP19-210	ENST00000465902	IRX5	P78411	483 aa	Predicted RBP	20.39	■□□□□ 0.85
USP19-210	ENST00000465902	TTLL4	Q14679	1199 aa		20.39	■□□□□ 0.85
USP19-210	ENST00000465902	NTRK3	Q16288	839 aa		20.39	■□□□□ 0.85
USP19-210	ENST00000465902	PPP1R18	Q6NYC8	613 aa		20.39	■□□□□ 0.85
USP19-210	ENST00000465902	ZNF713	Q8N859	430 aa	Predicted RBP	20.39	■□□□□ 0.85
USP19-210	ENST00000465902	ZFP91	Q96JP5	570 aa	Predicted RBP	20.39	■□□□□ 0.85
USP19-210	ENST00000465902	RNF26	Q9BY78	433 aa	Predicted RBP	20.39	■□□□□ 0.85
USP19-210	ENST00000465902	MYADML2	A6NDP7	307 aa		20.38	■□□□□ 0.85
USP19-210	ENST00000465902	SPDYE3	A6NKU9	549 aa		20.38	■□□□□ 0.85
USP19-210	ENST00000465902	COL6A1	P12109	1028 aa		20.38	■□□□□ 0.85
USP19-210	ENST00000465902	BEX3	Q00994	111 aa		20.38	■□□□□ 0.85
USP19-210	ENST00000465902	KCNA10	Q16322	511 aa		20.38	■□□□□ 0.85
USP19-210	ENST00000465902	DUSP28	Q4G0W2	176 aa		20.38	■□□□□ 0.85
USP19-210	ENST00000465902	TYW1B	Q6NUM6	668 aa		20.38	■□□□□ 0.85
USP19-210	ENST00000465902	CHRDL2	Q6WN34	429 aa		20.38	■□□□□ 0.85

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