RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465425.1

SYNE4-204, Transcript of spectrin repeat containing nuclear envelope family member 4, humanhuman

TSL 2

Gene SYNE4, Length 2,339 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4-204ENST00000465425 ZNF662Q6ZS27 426 aa20.42■□□□□ 0.86
SYNE4-204ENST00000465425 DYMQ7RTS9 669 aa20.42■□□□□ 0.86
SYNE4-204ENST00000465425 SEMA6BQ9H3T3 888 aa20.42■□□□□ 0.86
SYNE4-204ENST00000465425 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
SYNE4-204ENST00000465425 GPCPD1Q9NPB8 672 aa20.42■□□□□ 0.86
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SYNE4-204ENST00000465425 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa20.42■□□□□ 0.86
SYNE4-204ENST00000465425 TFR2Q9UP52 801 aa20.42■□□□□ 0.86
SYNE4-204ENST00000465425 A0A1W2PQJ5 194 aa20.41■□□□□ 0.86
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SYNE4-204ENST00000465425 MYMKA6NI61 221 aa20.41■□□□□ 0.86
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SYNE4-204ENST00000465425 SNX29Q8TEQ0 813 aa20.41■□□□□ 0.86
SYNE4-204ENST00000465425 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
SYNE4-204ENST00000465425 RASSF10A6NK89 507 aa20.41■□□□□ 0.86
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SYNE4-204ENST00000465425 AKR1B1P15121 316 aa20.41■□□□□ 0.86
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SYNE4-204ENST00000465425 F8W031 263 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
SYNE4-204ENST00000465425 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
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SYNE4-204ENST00000465425 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa20.4■□□□□ 0.86
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SYNE4-204ENST00000465425 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa20.39■□□□□ 0.85
SYNE4-204ENST00000465425 CDK17Q00537 523 aa20.39■□□□□ 0.85
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SYNE4-204ENST00000465425 PPP1R18Q6NYC8 613 aa20.39■□□□□ 0.85
SYNE4-204ENST00000465425 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
SYNE4-204ENST00000465425 RAD54LQ92698 747 aa20.39■□□□□ 0.85
SYNE4-204ENST00000465425 NDST4Q9H3R1 872 aa20.39■□□□□ 0.85
SYNE4-204ENST00000465425 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
SYNE4-204ENST00000465425 SERPINB13Q9UIV8 391 aa20.39■□□□□ 0.85
SYNE4-204ENST00000465425 RIMBP2O15034 1052 aa20.38■□□□□ 0.85
SYNE4-204ENST00000465425 MARCH6O60337 910 aa20.38■□□□□ 0.85
SYNE4-204ENST00000465425 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
SYNE4-204ENST00000465425 CLEC10AQ8IUN9 316 aa20.38■□□□□ 0.85
SYNE4-204ENST00000465425 TSGA10Q9BZW7 698 aa20.38■□□□□ 0.85
SYNE4-204ENST00000465425 LACRTQ9GZZ8 138 aa20.38■□□□□ 0.85
SYNE4-204ENST00000465425 RIC8AQ9NPQ8 531 aa20.38■□□□□ 0.85
SYNE4-204ENST00000465425 L1RE1Q9UN81 338 aa20.38■□□□□ 0.85
SYNE4-204ENST00000465425 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
SYNE4-204ENST00000465425 LRRC63Q05C16 580 aa20.38■□□□□ 0.85
SYNE4-204ENST00000465425 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
SYNE4-204ENST00000465425 ADGRF4Q8IZF3 695 aa20.38■□□□□ 0.85
SYNE4-204ENST00000465425 DDX12PQ92771 950 aa20.38■□□□□ 0.85
SYNE4-204ENST00000465425 CRAMP1Q96RY5 1269 aa20.38■□□□□ 0.85
SYNE4-204ENST00000465425 SWAP70Q9UH65 585 aa20.38■□□□□ 0.85
SYNE4-204ENST00000465425 MACROD2A1Z1Q3 448 aa20.37■□□□□ 0.85
SYNE4-204ENST00000465425 CYP27A1Q02318 531 aa20.37■□□□□ 0.85
SYNE4-204ENST00000465425 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
SYNE4-204ENST00000465425 ZNF543Q08ER8 600 aa20.37■□□□□ 0.85
SYNE4-204ENST00000465425 MAN2A1Q16706 1144 aa20.37■□□□□ 0.85
SYNE4-204ENST00000465425 UBE2SQ16763 222 aa20.37■□□□□ 0.85
SYNE4-204ENST00000465425 PPP4R3AQ6IN85 833 aa20.37■□□□□ 0.85
SYNE4-204ENST00000465425 CUL5Q93034 780 aa20.37■□□□□ 0.85
SYNE4-204ENST00000465425 JMJD4Q9H9V9 463 aa20.37■□□□□ 0.85
SYNE4-204ENST00000465425 PDE11AQ9HCR9 933 aa20.37■□□□□ 0.85
SYNE4-204ENST00000465425 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
SYNE4-204ENST00000465425 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
SYNE4-204ENST00000465425 PLAGL2Q9UPG8 496 aa20.37■□□□□ 0.85
SYNE4-204ENST00000465425 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP20.37■□□□□ 0.856e-6■■□□□ 11.7
SYNE4-204ENST00000465425 VAV2P52735 878 aa20.37■□□□□ 0.85
SYNE4-204ENST00000465425 ATP2B2Q01814 1243 aa20.37■□□□□ 0.85
SYNE4-204ENST00000465425 CCDC96Q2M329 555 aa20.37■□□□□ 0.85
SYNE4-204ENST00000465425 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
SYNE4-204ENST00000465425 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa20.37■□□□□ 0.85
SYNE4-204ENST00000465425 CAPZA3Q96KX2 299 aa20.37■□□□□ 0.85
SYNE4-204ENST00000465425 TSG101Q99816 390 aa20.37■□□□□ 0.85
SYNE4-204ENST00000465425 COA1Q9GZY4 146 aa20.37■□□□□ 0.85
SYNE4-204ENST00000465425 DEF6Q9H4E7 631 aa20.37■□□□□ 0.85
SYNE4-204ENST00000465425 MMRN2Q9H8L6 949 aa20.37■□□□□ 0.85
SYNE4-204ENST00000465425 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa20.37■□□□□ 0.85
SYNE4-204ENST00000465425 ABCB11O95342 1321 aa20.36■□□□□ 0.85
SYNE4-204ENST00000465425 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa20.36■□□□□ 0.85
SYNE4-204ENST00000465425 ANO9A1A5B4 782 aa20.36■□□□□ 0.85
SYNE4-204ENST00000465425 RCCD1A6NED2 376 aa20.36■□□□□ 0.85
SYNE4-204ENST00000465425 USO1O60763 962 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
SYNE4-204ENST00000465425 SRGAP2O75044 1071 aa20.36■□□□□ 0.85
SYNE4-204ENST00000465425 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
SYNE4-204ENST00000465425 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
SYNE4-204ENST00000465425 PSMD2Q13200 908 aa20.36■□□□□ 0.85
SYNE4-204ENST00000465425 WDR93Q6P2C0 686 aa20.36■□□□□ 0.85
SYNE4-204ENST00000465425 C2CD5Q86YS7 1000 aa20.36■□□□□ 0.85
SYNE4-204ENST00000465425 SUGCTQ9HAC7 445 aa20.36■□□□□ 0.85
SYNE4-204ENST00000465425 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
SYNE4-204ENST00000465425 UBAP1LF5GYI3 381 aa20.36■□□□□ 0.85
SYNE4-204ENST00000465425 H3BQF6 201 aa20.36■□□□□ 0.85
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