RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444916.5

SH3BP4-205, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene SH3BP4, Length 570 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-205ENST00000444916 IQSEC1Q6DN90 963 aa16.4■□□□□ 0.22
SH3BP4-205ENST00000444916 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP16.4■□□□□ 0.22
SH3BP4-205ENST00000444916 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
SH3BP4-205ENST00000444916 LZTS2Q9BRK4 669 aa16.4■□□□□ 0.22
SH3BP4-205ENST00000444916 SEMA6BQ9H3T3 888 aa16.4■□□□□ 0.22
SH3BP4-205ENST00000444916 PDGFCQ9NRA1 345 aa16.4■□□□□ 0.22
SH3BP4-205ENST00000444916 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
SH3BP4-205ENST00000444916 SLC12A7Q9Y666 1083 aa16.4■□□□□ 0.22
SH3BP4-205ENST00000444916 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP16.39■□□□□ 0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 A0A1W2PQY0 241 aa16.39■□□□□ 0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP16.39■□□□□ 0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 SMPD1P17405 629 aa16.39■□□□□ 0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 ACLYP53396 1101 aa16.39■□□□□ 0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP16.39■□□□□ 0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 KCNA10Q16322 511 aa16.39■□□□□ 0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 C1orf53Q5VUE5 145 aa16.39■□□□□ 0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 TLK2Q86UE8 772 aa16.39■□□□□ 0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP16.39■□□□□ 0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP16.39■□□□□ 0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP16.39■□□□□ 0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 MYLIPQ8WY64 445 aa16.39■□□□□ 0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP16.39■□□□□ 0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 COL20A1Q9P218 1284 aa16.39■□□□□ 0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 Q9Y3F1 56 aa16.39■□□□□ 0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 CTAGE5O15320 804 aa16.38■□□□□ 0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 CFBP00751 764 aa16.38■□□□□ 0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 RXRAP19793 462 aa16.38■□□□□ 0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 HSD17B4P51659 736 aa16.38■□□□□ 0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP16.38■□□□□ 0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 GNASQ5JWF2 1037 aa16.38■□□□□ 0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 MICU3Q86XE3 530 aa16.38■□□□□ 0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 SAMD3Q8N6K7 520 aa16.38■□□□□ 0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 BADQ92934 168 aa16.38■□□□□ 0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 TCEANC2Q96MN5 208 aa16.38■□□□□ 0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 TAAR1Q96RJ0 339 aa16.38■□□□□ 0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 RMDN3Q96TC7 470 aa16.38■□□□□ 0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP16.38■□□□□ 0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa16.38■□□□□ 0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa16.37■□□□□ 0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 PLEKHA8P1O95397 391 aa16.37■□□□□ 0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 TRIM60Q495X7 471 aa16.37■□□□□ 0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 DUSP28Q4G0W2 176 aa16.37■□□□□ 0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 APOA5Q6Q788 366 aa16.37■□□□□ 0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa16.37■□□□□ 0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa16.37■□□□□ 0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 FANCBQ8NB91 859 aa16.37■□□□□ 0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 PIBF1Q8WXW3 757 aa16.37■□□□□ 0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 IWS1Q96ST2 819 aa16.37■□□□□ 0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 WDR11Q9BZH6 1224 aa16.37■□□□□ 0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 AP5M1Q9H0R1 490 aa16.37■□□□□ 0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 SNX14Q9Y5W7 946 aa16.37■□□□□ 0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 ASGR1P07306 291 aa16.36■□□□□ 0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 PTGS1P23219 599 aa16.36■□□□□ 0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 TMEM63BQ5T3F8 832 aa16.36■□□□□ 0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa16.36■□□□□ 0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 SCFD2Q8WU76 684 aa16.36■□□□□ 0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 GLT1D1Q96MS3 346 aa16.36■□□□□ 0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 STARD7Q9NQZ5 370 aa16.36■□□□□ 0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 PXMP2Q9NR77 195 aa16.36■□□□□ 0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 TRIM43BA6NCK2 446 aa16.35■□□□□ 0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 BEX3Q00994 111 aa16.35■□□□□ 0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 PPP2R5BQ15173 497 aa16.35■□□□□ 0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 ARHGEF16Q5VV41 709 aa16.35■□□□□ 0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 TMTC3Q6ZXV5 915 aa16.35■□□□□ 0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 ELP1O95163 1332 aa16.35■□□□□ 0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP16.34■□□□□ 0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 ZBTB43O43298 467 aa16.34■□□□□ 0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 ZEB2O60315 1214 aa16.34■□□□□ 0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 POLR2MP0CAP2 368 aa16.34■□□□□ 0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 RCAN1P53805 252 aa16.34■□□□□ 0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 TLE2Q04725 743 aa16.34■□□□□ 0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 STXBP2Q15833 593 aa16.34■□□□□ 0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa16.34■□□□□ 0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 PRDM6Q9NQX0 595 aa16.34■□□□□ 0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 PDLIM7Q9NR12 457 aa16.34■□□□□ 0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 BRPF3Q9ULD4 1205 aa16.34■□□□□ 0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa16.33■□□□□ 0.2
SH3BP4-205ENST00000444916 CABYRO75952 493 aa16.33■□□□□ 0.2
SH3BP4-205ENST00000444916 NR3C2P08235 984 aa16.33■□□□□ 0.2
SH3BP4-205ENST00000444916 CPA1P15085 419 aa16.33■□□□□ 0.2
SH3BP4-205ENST00000444916 ITGB8P26012 769 aa16.33■□□□□ 0.2
SH3BP4-205ENST00000444916 EPHB4P54760 987 aa16.33■□□□□ 0.2
SH3BP4-205ENST00000444916 FGD1P98174 961 aa16.33■□□□□ 0.2
SH3BP4-205ENST00000444916 TTLL4Q14679 1199 aa16.33■□□□□ 0.2
SH3BP4-205ENST00000444916 RTN1Q16799 776 aa16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.3 ms