RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442510.6

PTPRC-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 5,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-209ENST00000442510 NR1D2Q14995 579 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 ZCWPW2Q504Y3 356 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 BMP2KLQ5H9B9 411 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 TAS2R42Q7RTR8 314 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 GDAP1Q8TB36 358 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 CNPY3Q9BT09 278 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 KRT23Q9C075 422 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 ANLNQ9NQW6 1124 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 GOLGA3Q08378 1498 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 TKTP29401 623 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 CDC25CP30307 473 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 SERPINB1P30740 379 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 HOXD12P35452 270 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 FNTAP49354 379 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 TNNI3KQ59H18 835 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 USP37Q86T82 979 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 S100A5P33763 92 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 TNNC1P63316 161 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 MTERF2Q49AM1 385 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 MAB21L3Q8N8X9 362 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 RETREG2Q8NC44 543 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 HELQQ8TDG4 1101 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 ZFYVE19Q96K21 471 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 VIPAS39Q9H9C1 493 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 TMOD2Q9NZR1 351 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 HSMCR30P0CW71 290 aa6.07□□□□□ -1.44
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PTPRC-209ENST00000442510 GGCXP38435 758 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 TRPC3Q13507 836 aa6.07□□□□□ -1.44
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PTPRC-209ENST00000442510 ESYT2A0FGR8 921 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 GNB5O14775 395 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 STRNO43815 780 aa6.07□□□□□ -1.44
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PTPRC-209ENST00000442510 PPP1R37O75864 691 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 TRIM16O95361 564 aa6.07□□□□□ -1.44
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PTPRC-209ENST00000442510 KCTD4Q8WVF5 259 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 HSPH1Q92598 858 aa6.07□□□□□ -1.44
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PTPRC-209ENST00000442510 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 KDM2BQ8NHM5 1336 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 SULT1B1O43704 296 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 CALB1P05937 261 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 RFC5P40937 340 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF132P52740 706 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 PSME1Q06323 249 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 SGO2Q562F6 1265 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 SCYL3Q8IZE3 742 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 FSIP1Q8NA03 581 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 SMYD1Q8NB12 490 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 GOLM1Q8NBJ4 401 aa6.07□□□□□ -1.44
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PTPRC-209ENST00000442510 SPIRE2Q8WWL2 714 aa6.07□□□□□ -1.44
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PTPRC-209ENST00000442510 TUBA1CQ9BQE3 449 aa6.07□□□□□ -1.44
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PTPRC-209ENST00000442510 SNX5Q9Y5X3 404 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 GOLGA8SH3BPF8 625 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 EPN2O95208 641 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 CHEK2O96017 543 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 IDEP14735 1019 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 EPHB4P54760 987 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 PTK2Q05397 1052 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 FUKQ8N0W3 1084 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 TERB1Q8NA31 727 aa6.06□□□□□ -1.44
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