RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442481.5

PRAME-210, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 581 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-210ENST00000442481 PSMC6P62333 389 aa13.68□□□□□ -0.22
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PRAME-210ENST00000442481 PDGFCQ9NRA1 345 aa13.68□□□□□ -0.22
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PRAME-210ENST00000442481 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP13.65□□□□□ -0.22
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PRAME-210ENST00000442481 LMCD1Q9NZU5 365 aa13.64□□□□□ -0.23
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PRAME-210ENST00000442481 TANC1Q9C0D5 1861 aa13.63□□□□□ -0.23
PRAME-210ENST00000442481 A6NJR5 290 aa13.63□□□□□ -0.23
PRAME-210ENST00000442481 TLL1O43897 1013 aa13.63□□□□□ -0.23
PRAME-210ENST00000442481 EFCAB14O75071 495 aa13.63□□□□□ -0.23
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PRAME-210ENST00000442481 PCP11498 1178 aaKnown RBP13.63□□□□□ -0.23
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PRAME-210ENST00000442481 NT5C2P49902 561 aa13.63□□□□□ -0.23
PRAME-210ENST00000442481 SNAP25P60880 206 aa13.63□□□□□ -0.23
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PRAME-210ENST00000442481 ARNTL2Q8WYA1 636 aa13.63□□□□□ -0.23
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PRAME-210ENST00000442481 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP13.63□□□□□ -0.23
PRAME-210ENST00000442481 IL17RBQ9NRM6 502 aa13.63□□□□□ -0.23
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PRAME-210ENST00000442481 NFIBO00712 420 aa13.62□□□□□ -0.23
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PRAME-210ENST00000442481 CTNNA3Q9UI47 895 aa13.62□□□□□ -0.23
PRAME-210ENST00000442481 SCN5AQ14524 2016 aa13.61□□□□□ -0.23
PRAME-210ENST00000442481 EDNRBP24530 442 aa13.61□□□□□ -0.23
PRAME-210ENST00000442481 RPS6P62753 249 aaKnown RBP13.61□□□□□ -0.23
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PRAME-210ENST00000442481 TMEM31Q5JXX7 168 aa13.61□□□□□ -0.23
PRAME-210ENST00000442481 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP13.61□□□□□ -0.23
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