RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439418.1

C9orf135-AS1-201, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene C9orf135-AS1, Length 1,375 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FAM83AQ86UY5 434 aa6.88□□□□□ -1.31
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FAM129BQ96TA1 746 aa6.88□□□□□ -1.31
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TGIF2Q9GZN2 237 aa6.88□□□□□ -1.31
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PDLIM7Q9NR12 457 aa6.88□□□□□ -1.31
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 IFT57Q9NWB7 429 aa6.88□□□□□ -1.31
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 BABAM1Q9NWV8 329 aa6.88□□□□□ -1.31
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZHX2Q9Y6X8 837 aa6.88□□□□□ -1.31
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 BRWD1Q9NSI6 2320 aa6.88□□□□□ -1.31
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa6.88□□□□□ -1.31
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ATRNL1Q5VV63 1379 aa6.88□□□□□ -1.31
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 C5orf42Q9H799 3197 aa6.87□□□□□ -1.31
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MYH2Q9UKX2 1941 aa6.87□□□□□ -1.31
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TRIM75PA6NK02 468 aa6.87□□□□□ -1.31
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CHL1O00533 1208 aa6.87□□□□□ -1.31
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 COPB2P35606 906 aa6.87□□□□□ -1.31
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 GYG1P46976 350 aa6.87□□□□□ -1.31
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TCP10Q12799 353 aa6.87□□□□□ -1.31
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NFIAQ12857 509 aa6.87□□□□□ -1.31
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TRIM60Q495X7 471 aa6.87□□□□□ -1.31
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 AKNAD1Q5T1N1 836 aa6.87□□□□□ -1.31
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 DUSP27Q5VZP5 1158 aa6.87□□□□□ -1.31
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ATCAYQ86WG3 371 aa6.87□□□□□ -1.31
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NT5DC4Q86YG4 428 aa6.87□□□□□ -1.31
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FMNL3Q8IVF7 1028 aa6.87□□□□□ -1.31
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa6.87□□□□□ -1.31
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TIFAQ96CG3 184 aa6.87□□□□□ -1.31
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PHACTR1Q9C0D0 580 aa6.87□□□□□ -1.31
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 OSBPL2Q9H1P3 480 aa6.87□□□□□ -1.31
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CCSER2Q9H7U1 834 aa6.87□□□□□ -1.31
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa6.87□□□□□ -1.31
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa6.87□□□□□ -1.31
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa6.87□□□□□ -1.31
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TRIOO75962 3097 aa6.86□□□□□ -1.31
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CFAP69A5D8W1 941 aa6.86□□□□□ -1.31
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 GRXCR1A8MXD5 290 aa6.86□□□□□ -1.31
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SPINT1O43278 529 aa6.86□□□□□ -1.31
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP6.86□□□□□ -1.31
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 HOXB7P09629 217 aa6.86□□□□□ -1.31
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PTPRAP18433 802 aa6.86□□□□□ -1.31
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NHLH1Q02575 133 aa6.86□□□□□ -1.31
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 EHHADHQ08426 723 aa6.86□□□□□ -1.31
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 C6orf118Q5T5N4 469 aa6.86□□□□□ -1.31
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 C1orf53Q5VUE5 145 aa6.86□□□□□ -1.31
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TRIM46Q7Z4K8 759 aa6.86□□□□□ -1.31
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RHBDD1Q8TEB9 315 aa6.86□□□□□ -1.31
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 STAG1Q8WVM7 1258 aa6.86□□□□□ -1.31
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TEKT1Q969V4 418 aa6.86□□□□□ -1.31
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 IFT43Q96FT9 208 aa6.86□□□□□ -1.31
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZFP42Q96MM3 310 aa6.86□□□□□ -1.31
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 GRIP2Q9C0E4 1043 aa6.86□□□□□ -1.31
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CAPN10Q9HC96 672 aa6.86□□□□□ -1.31
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TMOD2Q9NZR1 351 aa6.86□□□□□ -1.31
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 KLK14Q9P0G3 267 aa6.86□□□□□ -1.31
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 POLIQ9UNA4 740 aa6.86□□□□□ -1.31
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa6.86□□□□□ -1.31
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PHF20L1A8MW92 1017 aa6.85□□□□□ -1.31
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 GPR182O15218 404 aa6.85□□□□□ -1.31
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PLIN1O60240 522 aa6.85□□□□□ -1.31
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 DNAJC6O75061 913 aa6.85□□□□□ -1.31
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 STK10O94804 968 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 GPC1P35052 558 aa6.85□□□□□ -1.31
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa6.85□□□□□ -1.31
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZFPM1Q8IX07 1006 aa6.85□□□□□ -1.31
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SCYL3Q8IZE3 742 aa6.85□□□□□ -1.31
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 GJD3Q8N144 294 aa6.85□□□□□ -1.31
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MICALL1Q8N3F8 863 aa6.85□□□□□ -1.31
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 HOOK2Q96ED9 719 aa6.85□□□□□ -1.31
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZDHHC15Q96MV8 337 aa6.85□□□□□ -1.31
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SIPA1L1O43166 1804 aa6.85□□□□□ -1.31
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 DCHS1Q96JQ0 3298 aa6.84□□□□□ -1.31
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NEURL1BA8MQ27 555 aa6.84□□□□□ -1.31
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 H7C1W4 665 aa6.84□□□□□ -1.31
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MAN1A2O60476 641 aa6.84□□□□□ -1.31
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TXLNAP40222 546 aa6.84□□□□□ -1.31
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TMPOP42166 694 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZAP70P43403 619 aa6.84□□□□□ -1.31
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CASP7P55210 303 aa6.84□□□□□ -1.31
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.2 ms