RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000430824.2

CAPN8-204, Transcript of calpain 8, humanhuman

TSL 5

Gene CAPN8, Length 695 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN8-204ENST00000430824 IWS1Q96ST2 819 aa14.65□□□□□ -0.06
CAPN8-204ENST00000430824 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
CAPN8-204ENST00000430824 SPC25Q9HBM1 224 aa14.65□□□□□ -0.06
CAPN8-204ENST00000430824 PXMP2Q9NR77 195 aa14.65□□□□□ -0.06
CAPN8-204ENST00000430824 V9GY48 417 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
CAPN8-204ENST00000430824 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
CAPN8-204ENST00000430824 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa14.65□□□□□ -0.06
CAPN8-204ENST00000430824 NID2Q14112 1375 aa14.64□□□□□ -0.07
CAPN8-204ENST00000430824 ADAMTS4O75173 837 aa14.64□□□□□ -0.07
CAPN8-204ENST00000430824 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
CAPN8-204ENST00000430824 STXBP2Q15833 593 aa14.64□□□□□ -0.07
CAPN8-204ENST00000430824 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP14.64□□□□□ -0.07
CAPN8-204ENST00000430824 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
CAPN8-204ENST00000430824 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CAPN8-204ENST00000430824 EVI5O60447 810 aa14.63□□□□□ -0.07
CAPN8-204ENST00000430824 NR3C2P08235 984 aa14.63□□□□□ -0.07
CAPN8-204ENST00000430824 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
CAPN8-204ENST00000430824 SMPD1P17405 629 aa14.63□□□□□ -0.07
CAPN8-204ENST00000430824 GJA9P57773 515 aa14.63□□□□□ -0.07
CAPN8-204ENST00000430824 CCT2P78371 535 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CAPN8-204ENST00000430824 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa14.63□□□□□ -0.07
CAPN8-204ENST00000430824 FERMT2Q96AC1 680 aa14.63□□□□□ -0.07
CAPN8-204ENST00000430824 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
CAPN8-204ENST00000430824 WDR11Q9BZH6 1224 aa14.63□□□□□ -0.07
CAPN8-204ENST00000430824 AP5M1Q9H0R1 490 aa14.63□□□□□ -0.07
CAPN8-204ENST00000430824 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CAPN8-204ENST00000430824 PSTPIP2Q9H939 334 aa14.63□□□□□ -0.07
CAPN8-204ENST00000430824 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CAPN8-204ENST00000430824 ALPK3Q96L96 1907 aa14.62□□□□□ -0.07
CAPN8-204ENST00000430824 MYADML2A6NDP7 307 aa14.62□□□□□ -0.07
CAPN8-204ENST00000430824 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
CAPN8-204ENST00000430824 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
CAPN8-204ENST00000430824 DUSP28Q4G0W2 176 aa14.62□□□□□ -0.07
CAPN8-204ENST00000430824 GNASQ5JWF2 1037 aa14.62□□□□□ -0.07
CAPN8-204ENST00000430824 WWC2Q6AWC2 1192 aa14.62□□□□□ -0.07
CAPN8-204ENST00000430824 USP17L6PQ6QN14 398 aa14.62□□□□□ -0.07
CAPN8-204ENST00000430824 TLK2Q86UE8 772 aa14.62□□□□□ -0.07
CAPN8-204ENST00000430824 KLHDC9Q8NEP7 349 aa14.62□□□□□ -0.07
CAPN8-204ENST00000430824 SCFD2Q8WU76 684 aa14.62□□□□□ -0.07
CAPN8-204ENST00000430824 IL17RAQ96F46 866 aa14.62□□□□□ -0.07
CAPN8-204ENST00000430824 PDCD2LQ9BRP1 358 aa14.62□□□□□ -0.07
CAPN8-204ENST00000430824 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
CAPN8-204ENST00000430824 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
CAPN8-204ENST00000430824 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
CAPN8-204ENST00000430824 PHF24Q9UPV7 400 aa14.62□□□□□ -0.07
CAPN8-204ENST00000430824 Q9Y3F1 56 aa14.62□□□□□ -0.07
CAPN8-204ENST00000430824 NR2E3Q9Y5X4 410 aa14.62□□□□□ -0.07
CAPN8-204ENST00000430824 hCG_1984214I3L0E3 225 aa14.61□□□□□ -0.07
CAPN8-204ENST00000430824 PIK3CDO00329 1044 aa14.61□□□□□ -0.07
CAPN8-204ENST00000430824 MEIS2O14770 477 aa14.61□□□□□ -0.07
CAPN8-204ENST00000430824 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
CAPN8-204ENST00000430824 CST5P28325 142 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
CAPN8-204ENST00000430824 CCND2P30279 289 aa14.61□□□□□ -0.07
CAPN8-204ENST00000430824 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
CAPN8-204ENST00000430824 NAPAP54920 295 aa14.61□□□□□ -0.07
CAPN8-204ENST00000430824 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
CAPN8-204ENST00000430824 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
CAPN8-204ENST00000430824 STK3Q13188 491 aa14.61□□□□□ -0.07
CAPN8-204ENST00000430824 TTLL4Q14679 1199 aa14.61□□□□□ -0.07
CAPN8-204ENST00000430824 PGM5Q15124 567 aa14.61□□□□□ -0.07
CAPN8-204ENST00000430824 KCNA10Q16322 511 aa14.61□□□□□ -0.07
CAPN8-204ENST00000430824 LRRC26Q2I0M4 334 aa14.61□□□□□ -0.07
CAPN8-204ENST00000430824 TMEM63BQ5T3F8 832 aa14.61□□□□□ -0.07
CAPN8-204ENST00000430824 SEPT14Q6ZU15 432 aa14.61□□□□□ -0.07
CAPN8-204ENST00000430824 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
CAPN8-204ENST00000430824 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
CAPN8-204ENST00000430824 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
CAPN8-204ENST00000430824 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa14.6□□□□□ -0.07
CAPN8-204ENST00000430824 MOXD2PA6NHM9 499 aa14.6□□□□□ -0.07
CAPN8-204ENST00000430824 STXBP3O00186 592 aa14.6□□□□□ -0.07
CAPN8-204ENST00000430824 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP14.6□□□□□ -0.07
CAPN8-204ENST00000430824 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
CAPN8-204ENST00000430824 TXNP10599 105 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
CAPN8-204ENST00000430824 SCG2P13521 617 aa14.6□□□□□ -0.07
CAPN8-204ENST00000430824 IFNAR1P17181 557 aa14.6□□□□□ -0.07
CAPN8-204ENST00000430824 PTGS1P23219 599 aa14.6□□□□□ -0.07
CAPN8-204ENST00000430824 ACLYP53396 1101 aa14.6□□□□□ -0.07
CAPN8-204ENST00000430824 NKX3-2P78367 333 aa14.6□□□□□ -0.07
CAPN8-204ENST00000430824 BEX3Q00994 111 aa14.6□□□□□ -0.07
CAPN8-204ENST00000430824 ANKRD1Q15327 319 aa14.6□□□□□ -0.07
CAPN8-204ENST00000430824 NTRK3Q16288 839 aa14.6□□□□□ -0.07
CAPN8-204ENST00000430824 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
CAPN8-204ENST00000430824 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
CAPN8-204ENST00000430824 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
CAPN8-204ENST00000430824 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
CAPN8-204ENST00000430824 PPP1R18Q6NYC8 613 aa14.6□□□□□ -0.07
CAPN8-204ENST00000430824 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa14.6□□□□□ -0.07
CAPN8-204ENST00000430824 VSIG10LQ86VR7 867 aa14.6□□□□□ -0.07
CAPN8-204ENST00000430824 C7orf61Q8IZ16 206 aa14.6□□□□□ -0.07
CAPN8-204ENST00000430824 IL31RAQ8NI17 732 aa14.6□□□□□ -0.07
CAPN8-204ENST00000430824 PHKBQ93100 1093 aa14.6□□□□□ -0.07
CAPN8-204ENST00000430824 BARHL2Q9NY43 387 aa14.6□□□□□ -0.07
CAPN8-204ENST00000430824 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa14.6□□□□□ -0.07
CAPN8-204ENST00000430824 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
CAPN8-204ENST00000430824 A0A1W2PQY0 241 aa14.59□□□□□ -0.07
CAPN8-204ENST00000430824 H0YGN5 161 aa14.59□□□□□ -0.07
CAPN8-204ENST00000430824 CPLX1O14810 134 aa14.59□□□□□ -0.07
CAPN8-204ENST00000430824 CTAGE5O15320 804 aa14.59□□□□□ -0.07
CAPN8-204ENST00000430824 ZEB2O60315 1214 aa14.59□□□□□ -0.07
CAPN8-204ENST00000430824 PPFIA3O75145 1194 aa14.59□□□□□ -0.07
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