RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426951.5

RBM39-211, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RBM39, Length 840 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-211ENST00000426951 PTPRN2Q92932 1015 aa6.25□□□□□ -1.41
RBM39-211ENST00000426951 SHISA4Q96DD7 197 aa6.25□□□□□ -1.41
RBM39-211ENST00000426951 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
RBM39-211ENST00000426951 GPR27Q9NS67 375 aa6.25□□□□□ -1.41
RBM39-211ENST00000426951 MARCH2Q9P0N8 246 aa6.25□□□□□ -1.41
RBM39-211ENST00000426951 NDOR1Q9UHB4 597 aa6.25□□□□□ -1.41
RBM39-211ENST00000426951 FBXL7Q9UJT9 491 aa6.25□□□□□ -1.41
RBM39-211ENST00000426951 ACSL6Q9UKU0 697 aa6.25□□□□□ -1.41
RBM39-211ENST00000426951 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
RBM39-211ENST00000426951 A0A1W2PQJ5 194 aa6.24□□□□□ -1.41
RBM39-211ENST00000426951 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa6.24□□□□□ -1.41
RBM39-211ENST00000426951 MYO1BO43795 1136 aa6.24□□□□□ -1.41
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RBM39-211ENST00000426951 SDHBP21912 280 aa6.24□□□□□ -1.41
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RBM39-211ENST00000426951 GABREP78334 506 aa6.24□□□□□ -1.41
RBM39-211ENST00000426951 SNX17Q15036 470 aa6.24□□□□□ -1.41
RBM39-211ENST00000426951 KCNMB1Q16558 191 aa6.24□□□□□ -1.41
RBM39-211ENST00000426951 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa6.24□□□□□ -1.41
RBM39-211ENST00000426951 C16orf86Q6ZW13 317 aa6.24□□□□□ -1.41
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RBM39-211ENST00000426951 ZSWIM9Q86XI8 627 aa6.24□□□□□ -1.41
RBM39-211ENST00000426951 TEX2Q8IWB9 1127 aa6.24□□□□□ -1.41
RBM39-211ENST00000426951 NLGN2Q8NFZ4 835 aa6.24□□□□□ -1.41
RBM39-211ENST00000426951 USP33Q8TEY7 942 aa6.24□□□□□ -1.41
RBM39-211ENST00000426951 SLC52A2Q9HAB3 445 aa6.24□□□□□ -1.41
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RBM39-211ENST00000426951 CORO7P57737 925 aa6.23□□□□□ -1.41
RBM39-211ENST00000426951 TCEA2Q15560 299 aa6.23□□□□□ -1.41
RBM39-211ENST00000426951 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
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RBM39-211ENST00000426951 IFNL3Q8IZI9 196 aa6.23□□□□□ -1.41
RBM39-211ENST00000426951 LZTR1Q8N653 840 aa6.23□□□□□ -1.41
RBM39-211ENST00000426951 SLC7A14Q8TBB6 771 aa6.23□□□□□ -1.41
RBM39-211ENST00000426951 CLUHP3Q96NS8 147 aa6.23□□□□□ -1.41
RBM39-211ENST00000426951 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
RBM39-211ENST00000426951 FBLN5Q9UBX5 448 aa6.23□□□□□ -1.41
RBM39-211ENST00000426951 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa6.23□□□□□ -1.41
RBM39-211ENST00000426951 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
RBM39-211ENST00000426951 CD2APQ9Y5K6 639 aa6.23□□□□□ -1.41
RBM39-211ENST00000426951 AQP7O14520 342 aa6.22□□□□□ -1.41
RBM39-211ENST00000426951 PLD2O14939 933 aa6.22□□□□□ -1.41
RBM39-211ENST00000426951 GLI1P08151 1106 aa6.22□□□□□ -1.41
RBM39-211ENST00000426951 PNLIPP16233 465 aa6.22□□□□□ -1.41
RBM39-211ENST00000426951 ITGB5P18084 799 aa6.22□□□□□ -1.41
RBM39-211ENST00000426951 ARL4AP40617 200 aa6.22□□□□□ -1.41
RBM39-211ENST00000426951 GTF2A2P52657 109 aa6.22□□□□□ -1.41
RBM39-211ENST00000426951 GPR85P60893 370 aa6.22□□□□□ -1.41
RBM39-211ENST00000426951 LSAMPQ13449 338 aa6.22□□□□□ -1.41
RBM39-211ENST00000426951 ADGRF1Q5T601 910 aa6.22□□□□□ -1.41
RBM39-211ENST00000426951 BICRALQ6AI39 1079 aa6.22□□□□□ -1.41
RBM39-211ENST00000426951 BRAPQ7Z569 592 aa6.22□□□□□ -1.41
RBM39-211ENST00000426951 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
RBM39-211ENST00000426951 NLRP10Q86W26 655 aa6.22□□□□□ -1.41
RBM39-211ENST00000426951 FAM168AQ92567 244 aa6.22□□□□□ -1.41
RBM39-211ENST00000426951 TMEM169Q96HH4 297 aa6.22□□□□□ -1.41
RBM39-211ENST00000426951 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa6.22□□□□□ -1.41
RBM39-211ENST00000426951 MTA3Q9BTC8 594 aa6.22□□□□□ -1.41
RBM39-211ENST00000426951 CRTAC1Q9NQ79 661 aa6.22□□□□□ -1.41
RBM39-211ENST00000426951 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
RBM39-211ENST00000426951 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa6.22□□□□□ -1.41
RBM39-211ENST00000426951 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa6.22□□□□□ -1.41
RBM39-211ENST00000426951 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
RBM39-211ENST00000426951 C22orf46C9J442 243 aa6.21□□□□□ -1.42
RBM39-211ENST00000426951 CRTAMO95727 393 aa6.21□□□□□ -1.42
RBM39-211ENST00000426951 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
RBM39-211ENST00000426951 GUCY1A3Q02108 690 aa6.21□□□□□ -1.42
RBM39-211ENST00000426951 TRIM61Q5EBN2 209 aa6.21□□□□□ -1.42
RBM39-211ENST00000426951 LBX2Q6XYB7 198 aa6.21□□□□□ -1.42
RBM39-211ENST00000426951 SYNPOQ8N3V7 929 aa6.21□□□□□ -1.42
RBM39-211ENST00000426951 PLEKHO2Q8TD55 490 aa6.21□□□□□ -1.42
RBM39-211ENST00000426951 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
RBM39-211ENST00000426951 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
RBM39-211ENST00000426951 FEZ1Q99689 392 aa6.21□□□□□ -1.42
RBM39-211ENST00000426951 CLDND1Q9NY35 253 aa6.21□□□□□ -1.42
RBM39-211ENST00000426951 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP6.21□□□□□ -1.42
RBM39-211ENST00000426951 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa6.2□□□□□ -1.42
RBM39-211ENST00000426951 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa6.2□□□□□ -1.42
RBM39-211ENST00000426951 EFCAB14O75071 495 aa6.2□□□□□ -1.42
RBM39-211ENST00000426951 RASGRP1O95267 797 aa6.2□□□□□ -1.42
RBM39-211ENST00000426951 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
RBM39-211ENST00000426951 HSD3B2P26439 372 aa6.2□□□□□ -1.42
RBM39-211ENST00000426951 PDE6BP35913 854 aa6.2□□□□□ -1.42
RBM39-211ENST00000426951 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP6.2□□□□□ -1.42
RBM39-211ENST00000426951 KIZQ2M2Z5 673 aa6.2□□□□□ -1.42
RBM39-211ENST00000426951 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
RBM39-211ENST00000426951 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa6.2□□□□□ -1.42
RBM39-211ENST00000426951 MPZL3Q6UWV2 235 aa6.2□□□□□ -1.42
RBM39-211ENST00000426951 FGD2Q7Z6J4 655 aa6.2□□□□□ -1.42
RBM39-211ENST00000426951 GSTCDQ8NEC7 633 aa6.2□□□□□ -1.42
RBM39-211ENST00000426951 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP6.2□□□□□ -1.42
RBM39-211ENST00000426951 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
RBM39-211ENST00000426951 SCLYQ96I15 445 aa6.2□□□□□ -1.42
RBM39-211ENST00000426951 JAM3Q9BX67 310 aa6.2□□□□□ -1.42
RBM39-211ENST00000426951 SLC6A17Q9H1V8 727 aa6.2□□□□□ -1.42
RBM39-211ENST00000426951 RXFP1Q9HBX9 757 aa6.2□□□□□ -1.42
RBM39-211ENST00000426951 NUDT19A8MXV4 375 aa6.19□□□□□ -1.42
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