RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409985.5

PMS1-205, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PMS1, Length 1,882 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-205ENST00000409985 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa26.59■■□□□ 1.85
PMS1-205ENST00000409985 RAB34Q9BZG1 259 aa26.59■■□□□ 1.85
PMS1-205ENST00000409985 LRRC27Q9C0I9 530 aa26.59■■□□□ 1.85
PMS1-205ENST00000409985 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa26.59■■□□□ 1.85
PMS1-205ENST00000409985 TRIM49BA6NDI0 452 aa26.59■■□□□ 1.85
PMS1-205ENST00000409985 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP26.59■■□□□ 1.85
PMS1-205ENST00000409985 PDE4DQ08499 809 aa26.59■■□□□ 1.85
PMS1-205ENST00000409985 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa26.59■■□□□ 1.85
PMS1-205ENST00000409985 LRRC15Q8TF66 581 aa26.59■■□□□ 1.85
PMS1-205ENST00000409985 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP26.59■■□□□ 1.85
PMS1-205ENST00000409985 HAUS4Q9H6D7 363 aa26.59■■□□□ 1.85
PMS1-205ENST00000409985 ABCB11O95342 1321 aa26.59■■□□□ 1.85
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PMS1-205ENST00000409985 CCDC151A5D8V7 595 aa26.58■■□□□ 1.85
PMS1-205ENST00000409985 ECE2O60344 883 aa26.58■■□□□ 1.85
PMS1-205ENST00000409985 NDUFA10O95299 355 aa26.58■■□□□ 1.85
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PMS1-205ENST00000409985 TERF2Q15554 542 aa26.58■■□□□ 1.85
PMS1-205ENST00000409985 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
PMS1-205ENST00000409985 LARGE2Q8N3Y3 721 aa26.58■■□□□ 1.85
PMS1-205ENST00000409985 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
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PMS1-205ENST00000409985 USP17L5A8MUK1 530 aa26.57■■□□□ 1.84
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PMS1-205ENST00000409985 CDK17Q00537 523 aa26.57■■□□□ 1.84
PMS1-205ENST00000409985 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
PMS1-205ENST00000409985 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
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PMS1-205ENST00000409985 A0A1W2PQJ5 194 aa26.57■■□□□ 1.84
PMS1-205ENST00000409985 ADCY7P51828 1080 aa26.57■■□□□ 1.84
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PMS1-205ENST00000409985 TEX35Q5T0J7 233 aa26.57■■□□□ 1.84
PMS1-205ENST00000409985 SV2BQ7L1I2 683 aa26.57■■□□□ 1.84
PMS1-205ENST00000409985 ACRBPQ8NEB7 543 aa26.57■■□□□ 1.84
PMS1-205ENST00000409985 TTYH3Q9C0H2 523 aa26.57■■□□□ 1.84
PMS1-205ENST00000409985 KRT83P78385 493 aa26.56■■□□□ 1.84
PMS1-205ENST00000409985 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa26.56■■□□□ 1.84
PMS1-205ENST00000409985 CCDC170Q8IYT3 715 aa26.56■■□□□ 1.84
PMS1-205ENST00000409985 ERGIC2Q96RQ1 377 aa26.56■■□□□ 1.84
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PMS1-205ENST00000409985 MTMR7Q9Y216 660 aa26.56■■□□□ 1.84
PMS1-205ENST00000409985 SLC26A4O43511 780 aa26.55■■□□□ 1.84
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PMS1-205ENST00000409985 PPP4R3AQ6IN85 833 aa26.55■■□□□ 1.84
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PMS1-205ENST00000409985 SLC35F6Q8N357 371 aa26.55■■□□□ 1.84
PMS1-205ENST00000409985 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
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PMS1-205ENST00000409985 PARD6BQ9BYG5 372 aa26.55■■□□□ 1.84
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PMS1-205ENST00000409985 UNC13DQ70J99 1090 aa26.55■■□□□ 1.84
PMS1-205ENST00000409985 EHBP1Q8NDI1 1231 aa26.55■■□□□ 1.84
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PMS1-205ENST00000409985 VPS33BQ9H267 617 aa26.55■■□□□ 1.84
PMS1-205ENST00000409985 RIC8AQ9NPQ8 531 aa26.55■■□□□ 1.84
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PMS1-205ENST00000409985 PODNQ7Z5L7 613 aa26.54■■□□□ 1.84
PMS1-205ENST00000409985 CPVLQ9H3G5 476 aa26.54■■□□□ 1.84
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PMS1-205ENST00000409985 ZNF543Q08ER8 600 aa26.53■■□□□ 1.84
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PMS1-205ENST00000409985 UBA5Q9GZZ9 404 aa26.52■■□□□ 1.84
PMS1-205ENST00000409985 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa26.52■■□□□ 1.84
PMS1-205ENST00000409985 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
PMS1-205ENST00000409985 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.84
PMS1-205ENST00000409985 A0A0U1RQJ8 604 aa26.51■■□□□ 1.83
PMS1-205ENST00000409985 TBC1D8O95759 1140 aa26.51■■□□□ 1.83
PMS1-205ENST00000409985 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
PMS1-205ENST00000409985 CLK2P49760 499 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
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