RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391243.1

RNU6-337P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 337, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-337P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-337P-201ENST00000391243 TNFRSF21O75509 655 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-337P-201ENST00000391243 CYP7B1O75881 506 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-337P-201ENST00000391243 DKK1O94907 266 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-337P-201ENST00000391243 ZBTB7AO95365 584 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-337P-201ENST00000391243 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP0.46□□□□□ -2.34
RNU6-337P-201ENST00000391243 ABHD16AO95870 558 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-337P-201ENST00000391243 LMNB1P20700 586 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-337P-201ENST00000391243 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP0.46□□□□□ -2.34
RNU6-337P-201ENST00000391243 ITPKAP23677 461 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-337P-201ENST00000391243 CAP2P40123 477 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-337P-201ENST00000391243 TAF6P49848 677 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-337P-201ENST00000391243 RAC3P60763 192 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-337P-201ENST00000391243 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP0.46□□□□□ -2.34
RNU6-337P-201ENST00000391243 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP0.46□□□□□ -2.34
RNU6-337P-201ENST00000391243 SLC9A5Q14940 896 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-337P-201ENST00000391243 PCOLCEQ15113 449 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-337P-201ENST00000391243 LCE1FQ5T754 118 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-337P-201ENST00000391243 GFI1BQ5VTD9 330 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-337P-201ENST00000391243 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-337P-201ENST00000391243 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP0.46□□□□□ -2.34
RNU6-337P-201ENST00000391243 KCNV1Q6PIU1 500 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-337P-201ENST00000391243 ZNF662Q6ZS27 426 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-337P-201ENST00000391243 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-337P-201ENST00000391243 MRGPREQ86SM8 312 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-337P-201ENST00000391243 SLCO6A1Q86UG4 719 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-337P-201ENST00000391243 PDZD3Q86UT5 571 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-337P-201ENST00000391243 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP0.46□□□□□ -2.34
RNU6-337P-201ENST00000391243 NAT16Q8N8M0 369 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-337P-201ENST00000391243 RGS22Q8NE09 1264 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-337P-201ENST00000391243 NR4A3Q92570 626 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-337P-201ENST00000391243 MBD6Q96DN6 1003 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-337P-201ENST00000391243 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP0.46□□□□□ -2.34
RNU6-337P-201ENST00000391243 TCTN2Q96GX1 697 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-337P-201ENST00000391243 PEX11GQ96HA9 241 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-337P-201ENST00000391243 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP0.46□□□□□ -2.34
RNU6-337P-201ENST00000391243 JMJD8Q96S16 334 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-337P-201ENST00000391243 LRFN3Q9BTN0 628 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-337P-201ENST00000391243 FAM117AQ9C073 453 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-337P-201ENST00000391243 WNT10AQ9GZT5 417 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-337P-201ENST00000391243 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-337P-201ENST00000391243 KIAA1586Q9HCI6 787 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-337P-201ENST00000391243 KMT5AQ9NQR1 393 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-337P-201ENST00000391243 PDLIM7Q9NR12 457 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-337P-201ENST00000391243 PPP4R2Q9NY27 417 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-337P-201ENST00000391243 GPRC5BQ9NZH0 403 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-337P-201ENST00000391243 NOTCH4Q99466 2003 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-337P-201ENST00000391243 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP0.45□□□□□ -2.34
RNU6-337P-201ENST00000391243 TNFRSF10BO14763 440 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-337P-201ENST00000391243 CDC14BO60729 498 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-337P-201ENST00000391243 CBFA2T3O75081 653 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-337P-201ENST00000391243 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP0.45□□□□□ -2.34
RNU6-337P-201ENST00000391243 CGAP01215 116 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-337P-201ENST00000391243 C8BP07358 591 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-337P-201ENST00000391243 ZNF28P17035 718 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-337P-201ENST00000391243 CR2P20023 1033 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-337P-201ENST00000391243 NME2P22392 152 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-337P-201ENST00000391243 GRK4P32298 578 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-337P-201ENST00000391243 CXCR5P32302 372 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-337P-201ENST00000391243 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP0.45□□□□□ -2.34
RNU6-337P-201ENST00000391243 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP0.45□□□□□ -2.34
RNU6-337P-201ENST00000391243 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP0.45□□□□□ -2.34
RNU6-337P-201ENST00000391243 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP0.45□□□□□ -2.34
RNU6-337P-201ENST00000391243 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP0.45□□□□□ -2.34
RNU6-337P-201ENST00000391243 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP0.45□□□□□ -2.34
RNU6-337P-201ENST00000391243 PRR31Q5SQ13 230 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-337P-201ENST00000391243 NBPF6Q5VWK0 638 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-337P-201ENST00000391243 DTHD1Q6ZMT9 781 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-337P-201ENST00000391243 ARHGEF25Q86VW2 580 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-337P-201ENST00000391243 LCORLQ8N3X6 602 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-337P-201ENST00000391243 FAM26EQ8N5C1 309 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-337P-201ENST00000391243 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP0.45□□□□□ -2.34
RNU6-337P-201ENST00000391243 LINC00116Q8NCU8 138 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-337P-201ENST00000391243 BEND2Q8NDZ0 799 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-337P-201ENST00000391243 ACRBPQ8NEB7 543 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-337P-201ENST00000391243 CAGE1Q8TC20 777 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-337P-201ENST00000391243 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP0.45□□□□□ -2.34
RNU6-337P-201ENST00000391243 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP0.45□□□□□ -2.34
RNU6-337P-201ENST00000391243 CAVIN3Q969G5 261 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-337P-201ENST00000391243 TSPAN17Q96FV3 270 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-337P-201ENST00000391243 PRIMPOLQ96LW4 560 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-337P-201ENST00000391243 NBPF4Q96M43 638 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-337P-201ENST00000391243 CLIC6Q96NY7 704 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-337P-201ENST00000391243 MKNK1Q9BUB5 465 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-337P-201ENST00000391243 GDPD2Q9HCC8 539 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-337P-201ENST00000391243 SAMM50Q9Y512 469 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-337P-201ENST00000391243 MMP24Q9Y5R2 645 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-337P-201ENST00000391243 COL4A3Q01955 1670 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-337P-201ENST00000391243 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-337P-201ENST00000391243 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-337P-201ENST00000391243 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-337P-201ENST00000391243 ZNF185O15231 689 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-337P-201ENST00000391243 FAM20BO75063 409 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-337P-201ENST00000391243 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-337P-201ENST00000391243 TRIM37O94972 964 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-337P-201ENST00000391243 IGLV2-14P01704 120 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-337P-201ENST00000391243 PDGFAP04085 211 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-337P-201ENST00000391243 NOVP48745 357 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-337P-201ENST00000391243 ITGA1P56199 1179 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-337P-201ENST00000391243 TAP1Q03518 808 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-337P-201ENST00000391243 EHHADHQ08426 723 aa0.44□□□□□ -2.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.2 ms