RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376303.6

SYP-202, Transcript of synaptophysin, humanhuman

TSL 2

Gene SYP, Length 858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYP-202ENST00000376303 RASIP1Q5U651 963 aa20.54■□□□□ 0.88
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SYP-202ENST00000376303 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
SYP-202ENST00000376303 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
SYP-202ENST00000376303 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
SYP-202ENST00000376303 VAT1LQ9HCJ6 419 aa20.54■□□□□ 0.88
SYP-202ENST00000376303 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
SYP-202ENST00000376303 CUL9Q8IWT3 2517 aa20.54■□□□□ 0.88
SYP-202ENST00000376303 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
SYP-202ENST00000376303 A6NJR5 290 aa20.53■□□□□ 0.88
SYP-202ENST00000376303 KPNA6O60684 536 aa20.53■□□□□ 0.88
SYP-202ENST00000376303 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa20.53■□□□□ 0.88
SYP-202ENST00000376303 CHMLP26374 656 aa20.53■□□□□ 0.88
SYP-202ENST00000376303 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
SYP-202ENST00000376303 TBC1D5Q92609 795 aa20.53■□□□□ 0.88
SYP-202ENST00000376303 IWS1Q96ST2 819 aa20.53■□□□□ 0.88
SYP-202ENST00000376303 CYB5R4Q7L1T6 521 aa20.52■□□□□ 0.88
SYP-202ENST00000376303 STAG2Q8N3U4 1231 aa20.52■□□□□ 0.88
SYP-202ENST00000376303 MYLIPQ8WY64 445 aa20.52■□□□□ 0.88
SYP-202ENST00000376303 HERVK_113Q902F9 699 aa20.52■□□□□ 0.88
SYP-202ENST00000376303 TAAR1Q96RJ0 339 aa20.52■□□□□ 0.88
SYP-202ENST00000376303 AMNQ9BXJ7 453 aa20.52■□□□□ 0.88
SYP-202ENST00000376303 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
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SYP-202ENST00000376303 CYP21A2P08686 494 aa20.51■□□□□ 0.87
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SYP-202ENST00000376303 TIFAQ96CG3 184 aa20.51■□□□□ 0.87
SYP-202ENST00000376303 RMDN3Q96TC7 470 aa20.51■□□□□ 0.87
SYP-202ENST00000376303 COL20A1Q9P218 1284 aa20.51■□□□□ 0.87
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SYP-202ENST00000376303 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa20.51■□□□□ 0.87
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SYP-202ENST00000376303 ARIH2O95376 493 aa20.5■□□□□ 0.87
SYP-202ENST00000376303 FOSL2P15408 326 aa20.5■□□□□ 0.87
SYP-202ENST00000376303 PTH1RQ03431 593 aa20.5■□□□□ 0.87
SYP-202ENST00000376303 NFRKBQ6P4R8 1299 aa20.5■□□□□ 0.87
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SYP-202ENST00000376303 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
SYP-202ENST00000376303 ERICH2A1L162 156 aa20.49■□□□□ 0.87
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SYP-202ENST00000376303 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
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SYP-202ENST00000376303 NCOA7Q8NI08 942 aa20.48■□□□□ 0.87
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SYP-202ENST00000376303 TRAF1Q13077 416 aa20.47■□□□□ 0.87
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SYP-202ENST00000376303 LY6KQ17RY6 165 aa20.47■□□□□ 0.87
SYP-202ENST00000376303 OTOP2Q7RTS6 562 aa20.47■□□□□ 0.87
SYP-202ENST00000376303 SCLYQ96I15 445 aa20.47■□□□□ 0.87
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SYP-202ENST00000376303 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
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SYP-202ENST00000376303 WTAPQ15007 396 aa20.46■□□□□ 0.87
SYP-202ENST00000376303 RAB30Q15771 203 aa20.46■□□□□ 0.87
SYP-202ENST00000376303 AFG1LQ8WV93 481 aa20.46■□□□□ 0.87
SYP-202ENST00000376303 MAP4K1Q92918 833 aa20.46■□□□□ 0.87
SYP-202ENST00000376303 RIOX1Q9H6W3 641 aa20.46■□□□□ 0.87
SYP-202ENST00000376303 MSRAQ9UJ68 235 aa20.46■□□□□ 0.87
SYP-202ENST00000376303 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
SYP-202ENST00000376303 MMP3P08254 477 aa20.45■□□□□ 0.86
SYP-202ENST00000376303 CASTP20810 708 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
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