RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368078.7

CASQ1-201, Transcript of calsequestrin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CASQ1, Length 1,897 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1-201ENST00000368078 CCSER1Q9C0I3 900 aa17.35■□□□□ 0.37
CASQ1-201ENST00000368078 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP17.35■□□□□ 0.37
CASQ1-201ENST00000368078 MAN1B1Q9UKM7 699 aa17.35■□□□□ 0.37
CASQ1-201ENST00000368078 CLEC11AQ9Y240 323 aa17.35■□□□□ 0.37
CASQ1-201ENST00000368078 ABCB11O95342 1321 aa17.35■□□□□ 0.37
CASQ1-201ENST00000368078 POTEMA6NI47 508 aa17.35■□□□□ 0.37
CASQ1-201ENST00000368078 FAM86B1E9PN63 330 aa17.35■□□□□ 0.37
CASQ1-201ENST00000368078 VWA5AO00534 786 aa17.35■□□□□ 0.37
CASQ1-201ENST00000368078 FAM86B2P0C5J1 330 aa17.35■□□□□ 0.37
CASQ1-201ENST00000368078 SREBF1P36956 1147 aa17.35■□□□□ 0.37
CASQ1-201ENST00000368078 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP17.35■□□□□ 0.37
CASQ1-201ENST00000368078 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP17.35■□□□□ 0.37
CASQ1-201ENST00000368078 MBOAT7Q96N66 472 aa17.35■□□□□ 0.37
CASQ1-201ENST00000368078 NUDT12Q9BQG2 462 aa17.35■□□□□ 0.37
CASQ1-201ENST00000368078 BLZF1Q9H2G9 400 aa17.35■□□□□ 0.37
CASQ1-201ENST00000368078 DISC1Q9NRI5 854 aa17.35■□□□□ 0.37
CASQ1-201ENST00000368078 LRWD1Q9UFC0 647 aa17.35■□□□□ 0.37
CASQ1-201ENST00000368078 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP17.35■□□□□ 0.37
CASQ1-201ENST00000368078 MARCH6O60337 910 aa17.34■□□□□ 0.37
CASQ1-201ENST00000368078 PTPRFP10586 1907 aa17.34■□□□□ 0.37
CASQ1-201ENST00000368078 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP17.34■□□□□ 0.37
CASQ1-201ENST00000368078 TXLNAP40222 546 aa17.34■□□□□ 0.37
CASQ1-201ENST00000368078 IREB2P48200 963 aaKnown RBP17.34■□□□□ 0.37
CASQ1-201ENST00000368078 PRR16Q569H4 304 aa17.34■□□□□ 0.37
CASQ1-201ENST00000368078 RRAGBQ5VZM2 374 aa17.34■□□□□ 0.37
CASQ1-201ENST00000368078 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa17.34■□□□□ 0.37
CASQ1-201ENST00000368078 RASSF8Q8NHQ8 419 aa17.34■□□□□ 0.37
CASQ1-201ENST00000368078 WDR90Q96KV7 1748 aa17.34■□□□□ 0.37
CASQ1-201ENST00000368078 PPP1R9BQ96SB3 815 aa17.34■□□□□ 0.37
CASQ1-201ENST00000368078 TMOD4Q9NZQ9 345 aa17.34■□□□□ 0.37
CASQ1-201ENST00000368078 RIPK3Q9Y572 518 aa17.34■□□□□ 0.37
CASQ1-201ENST00000368078 CSADQ9Y600 493 aa17.34■□□□□ 0.37
CASQ1-201ENST00000368078 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP17.33■□□□□ 0.37
CASQ1-201ENST00000368078 ZBED4O75132 1171 aa17.33■□□□□ 0.37
CASQ1-201ENST00000368078 DSG3P32926 999 aa17.33■□□□□ 0.37
CASQ1-201ENST00000368078 STAT6P42226 847 aa17.33■□□□□ 0.37
CASQ1-201ENST00000368078 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP17.33■□□□□ 0.37
CASQ1-201ENST00000368078 CUL4BQ13620 913 aa17.33■□□□□ 0.37
CASQ1-201ENST00000368078 TREML2Q5T2D2 321 aa17.33■□□□□ 0.37
CASQ1-201ENST00000368078 NT5DC1Q5TFE4 455 aa17.33■□□□□ 0.37
CASQ1-201ENST00000368078 SMARCE1Q969G3 411 aa17.33■□□□□ 0.37
CASQ1-201ENST00000368078 LENG9Q96B70 501 aa17.33■□□□□ 0.37
CASQ1-201ENST00000368078 AK8Q96MA6 479 aa17.33■□□□□ 0.37
CASQ1-201ENST00000368078 COL20A1Q9P218 1284 aa17.33■□□□□ 0.37
CASQ1-201ENST00000368078 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP17.33■□□□□ 0.37
CASQ1-201ENST00000368078 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa17.33■□□□□ 0.36
CASQ1-201ENST00000368078 CCDC173Q0VFZ6 552 aa17.33■□□□□ 0.36
CASQ1-201ENST00000368078 DPYDQ12882 1025 aa17.33■□□□□ 0.36
CASQ1-201ENST00000368078 COG2Q14746 738 aa17.33■□□□□ 0.36
CASQ1-201ENST00000368078 MCTP2Q6DN12 878 aa17.33■□□□□ 0.36
CASQ1-201ENST00000368078 AOPEPQ8N6M6 819 aa17.33■□□□□ 0.36
CASQ1-201ENST00000368078 SPATA20Q8TB22 786 aa17.33■□□□□ 0.36
CASQ1-201ENST00000368078 KCNMB3Q9NPA1 279 aa17.33■□□□□ 0.36
CASQ1-201ENST00000368078 PCDHA12Q9UN75 941 aa17.33■□□□□ 0.36
CASQ1-201ENST00000368078 IQCA1LA6NCM1 817 aa17.32■□□□□ 0.36
CASQ1-201ENST00000368078 IRF6O14896 467 aa17.32■□□□□ 0.36
CASQ1-201ENST00000368078 PEX10O60683 326 aa17.32■□□□□ 0.36
CASQ1-201ENST00000368078 ADCY5O95622 1261 aa17.32■□□□□ 0.36
CASQ1-201ENST00000368078 CAVIN2O95810 425 aa17.32■□□□□ 0.36
CASQ1-201ENST00000368078 CYP3A4P08684 503 aa17.32■□□□□ 0.36
CASQ1-201ENST00000368078 PLCG1P19174 1290 aa17.32■□□□□ 0.36
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF76P36508 570 aa17.32■□□□□ 0.36
CASQ1-201ENST00000368078 PDIA5Q14554 519 aa17.32■□□□□ 0.36
CASQ1-201ENST00000368078 SH3D19Q5HYK7 790 aa17.32■□□□□ 0.36
CASQ1-201ENST00000368078 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP17.32■□□□□ 0.36
CASQ1-201ENST00000368078 SLC30A10Q6XR72 485 aa17.32■□□□□ 0.36
CASQ1-201ENST00000368078 REPS2Q8NFH8 660 aa17.32■□□□□ 0.36
CASQ1-201ENST00000368078 PDLIM2Q96JY6 352 aa17.32■□□□□ 0.36
CASQ1-201ENST00000368078 CCDC39Q9UFE4 941 aa17.32■□□□□ 0.36
CASQ1-201ENST00000368078 TRAF5O00463 557 aa17.31■□□□□ 0.36
CASQ1-201ENST00000368078 NF2P35240 595 aa17.31■□□□□ 0.36
CASQ1-201ENST00000368078 HSD17B4P51659 736 aa17.31■□□□□ 0.36
CASQ1-201ENST00000368078 MORC3Q14149 939 aa17.31■□□□□ 0.36
CASQ1-201ENST00000368078 ECM1Q16610 540 aa17.31■□□□□ 0.36
CASQ1-201ENST00000368078 TMEM266Q2M3C6 531 aa17.31■□□□□ 0.36
CASQ1-201ENST00000368078 Q4G0T1 1027 aa17.31■□□□□ 0.36
CASQ1-201ENST00000368078 OTUD5Q96G74 571 aa17.31■□□□□ 0.36
CASQ1-201ENST00000368078 TRERF1Q96PN7 1200 aa17.31■□□□□ 0.36
CASQ1-201ENST00000368078 PNMA5Q96PV4 448 aa17.31■□□□□ 0.36
CASQ1-201ENST00000368078 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP17.31■□□□□ 0.36
CASQ1-201ENST00000368078 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa17.31■□□□□ 0.36
CASQ1-201ENST00000368078 CIITAP33076 1130 aa17.31■□□□□ 0.36
CASQ1-201ENST00000368078 STAT3P40763 770 aa17.31■□□□□ 0.36
CASQ1-201ENST00000368078 GRB10Q13322 594 aa17.31■□□□□ 0.36
CASQ1-201ENST00000368078 TMEM132BQ14DG7 1078 aa17.31■□□□□ 0.36
CASQ1-201ENST00000368078 MOXD1Q6UVY6 613 aa17.31■□□□□ 0.36
CASQ1-201ENST00000368078 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP17.31■□□□□ 0.36
CASQ1-201ENST00000368078 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa17.31■□□□□ 0.36
CASQ1-201ENST00000368078 ETNPPLQ8TBG4 499 aa17.31■□□□□ 0.36
CASQ1-201ENST00000368078 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP17.31■□□□□ 0.36
CASQ1-201ENST00000368078 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP17.31■□□□□ 0.36
CASQ1-201ENST00000368078 RRAGCQ9HB90 399 aa17.31■□□□□ 0.36
CASQ1-201ENST00000368078 BECN2A8MW95 431 aa17.3■□□□□ 0.36
CASQ1-201ENST00000368078 MSH4O15457 936 aa17.3■□□□□ 0.36
CASQ1-201ENST00000368078 POTEEQ6S8J3 1075 aa17.3■□□□□ 0.36
CASQ1-201ENST00000368078 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP17.3■□□□□ 0.36
CASQ1-201ENST00000368078 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa17.29■□□□□ 0.36
CASQ1-201ENST00000368078 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP17.29■□□□□ 0.36
CASQ1-201ENST00000368078 SMC2O95347 1197 aa17.29■□□□□ 0.36
CASQ1-201ENST00000368078 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.7 ms