RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367651.3

CITED2-201, Transcript of Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CITED2, Length 2,354 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED2-201ENST00000367651 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP20.91■□□□□ 0.94
CITED2-201ENST00000367651 JRKLQ9Y4A0 524 aa20.91■□□□□ 0.94
CITED2-201ENST00000367651 PPFIA4O75335 1185 aa20.9■□□□□ 0.94
CITED2-201ENST00000367651 SEMA3FQ13275 785 aa20.9■□□□□ 0.94
CITED2-201ENST00000367651 VWA3BQ502W6 1294 aa20.9■□□□□ 0.94
CITED2-201ENST00000367651 CENPPQ6IPU0 288 aa20.9■□□□□ 0.94
CITED2-201ENST00000367651 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP20.9■□□□□ 0.94
CITED2-201ENST00000367651 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa20.9■□□□□ 0.94
CITED2-201ENST00000367651 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa20.9■□□□□ 0.94
CITED2-201ENST00000367651 FAM184BQ9ULE4 1060 aa20.9■□□□□ 0.94
CITED2-201ENST00000367651 GOLGA6BA6NDN3 693 aa20.9■□□□□ 0.94
CITED2-201ENST00000367651 MYMKA6NI61 221 aa20.9■□□□□ 0.94
CITED2-201ENST00000367651 RASA1P20936 1047 aa20.9■□□□□ 0.94
CITED2-201ENST00000367651 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP20.9■□□□□ 0.94
CITED2-201ENST00000367651 CCDC155Q8N6L0 562 aa20.9■□□□□ 0.94
CITED2-201ENST00000367651 GLIS3Q8NEA6 775 aa20.9■□□□□ 0.94
CITED2-201ENST00000367651 SPATA4Q8NEY3 305 aa20.9■□□□□ 0.94
CITED2-201ENST00000367651 TRIM58Q8NG06 486 aa20.9■□□□□ 0.94
CITED2-201ENST00000367651 OSBPL9Q96SU4 736 aa20.9■□□□□ 0.94
CITED2-201ENST00000367651 TSGA10Q9BZW7 698 aa20.9■□□□□ 0.94
CITED2-201ENST00000367651 NDST4Q9H3R1 872 aa20.9■□□□□ 0.94
CITED2-201ENST00000367651 TMEM260Q9NX78 707 aa20.9■□□□□ 0.94
CITED2-201ENST00000367651 LTBP4Q8N2S1 1624 aa20.9■□□□□ 0.94
CITED2-201ENST00000367651 SMCO2A6NFE2 343 aa20.89■□□□□ 0.94
CITED2-201ENST00000367651 LRRC53A6NM62 1247 aa20.89■□□□□ 0.94
CITED2-201ENST00000367651 GRB10Q13322 594 aa20.89■□□□□ 0.94
CITED2-201ENST00000367651 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.94
CITED2-201ENST00000367651 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa20.89■□□□□ 0.94
CITED2-201ENST00000367651 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.94
CITED2-201ENST00000367651 NAV1Q8NEY1 1877 aa20.89■□□□□ 0.94
CITED2-201ENST00000367651 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.93
CITED2-201ENST00000367651 TACC1O75410 805 aa20.89■□□□□ 0.93
CITED2-201ENST00000367651 SLC10A5Q5PT55 438 aa20.89■□□□□ 0.93
CITED2-201ENST00000367651 CNNM4Q6P4Q7 775 aa20.89■□□□□ 0.93
CITED2-201ENST00000367651 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.93
CITED2-201ENST00000367651 USP17L2Q6R6M4 530 aa20.89■□□□□ 0.93
CITED2-201ENST00000367651 KRT25Q7Z3Z0 450 aa20.89■□□□□ 0.93
CITED2-201ENST00000367651 NEK8Q86SG6 692 aa20.89■□□□□ 0.93
CITED2-201ENST00000367651 TBCKQ8TEA7 893 aa20.89■□□□□ 0.93
CITED2-201ENST00000367651 PNMA5Q96PV4 448 aa20.89■□□□□ 0.93
CITED2-201ENST00000367651 SNED1Q8TER0 1413 aa20.88■□□□□ 0.93
CITED2-201ENST00000367651 DYMQ7RTS9 669 aa20.88■□□□□ 0.93
CITED2-201ENST00000367651 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
CITED2-201ENST00000367651 MMRN2Q9H8L6 949 aa20.88■□□□□ 0.93
CITED2-201ENST00000367651 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
CITED2-201ENST00000367651 SBF2Q86WG5 1849 aa20.88■□□□□ 0.93
CITED2-201ENST00000367651 LCA5LO95447 670 aa20.88■□□□□ 0.93
CITED2-201ENST00000367651 TXKP42681 527 aa20.88■□□□□ 0.93
CITED2-201ENST00000367651 CORO7P57737 925 aa20.88■□□□□ 0.93
CITED2-201ENST00000367651 HAUS3Q68CZ6 603 aa20.88■□□□□ 0.93
CITED2-201ENST00000367651 RRAGAQ7L523 313 aa20.88■□□□□ 0.93
CITED2-201ENST00000367651 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa20.88■□□□□ 0.93
CITED2-201ENST00000367651 BAP1Q92560 729 aa20.88■□□□□ 0.93
CITED2-201ENST00000367651 GOLGA6CA6NDK9 693 aa20.87■□□□□ 0.93
CITED2-201ENST00000367651 GOLGA6DP0CG33 693 aa20.87■□□□□ 0.93
CITED2-201ENST00000367651 COBLL1Q53SF7 1204 aa20.87■□□□□ 0.93
CITED2-201ENST00000367651 TMC4Q7Z404 712 aa20.87■□□□□ 0.93
CITED2-201ENST00000367651 PACS2Q86VP3 889 aa20.87■□□□□ 0.93
CITED2-201ENST00000367651 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
CITED2-201ENST00000367651 FAM76AQ8TAV0 307 aa20.87■□□□□ 0.93
CITED2-201ENST00000367651 MTMR8Q96EF0 704 aa20.87■□□□□ 0.93
CITED2-201ENST00000367651 VAT1LQ9HCJ6 419 aa20.87■□□□□ 0.93
CITED2-201ENST00000367651 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa20.87■□□□□ 0.93
CITED2-201ENST00000367651 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
CITED2-201ENST00000367651 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
CITED2-201ENST00000367651 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa20.87■□□□□ 0.93
CITED2-201ENST00000367651 USO1O60763 962 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
CITED2-201ENST00000367651 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
CITED2-201ENST00000367651 IQCEQ6IPM2 695 aa20.87■□□□□ 0.93
CITED2-201ENST00000367651 SPZ1Q9BXG8 430 aa20.87■□□□□ 0.93
CITED2-201ENST00000367651 RABEP2Q9H5N1 569 aa20.87■□□□□ 0.93
CITED2-201ENST00000367651 EDIL3O43854 480 aa20.86■□□□□ 0.93
CITED2-201ENST00000367651 AKR1B10O60218 316 aa20.86■□□□□ 0.93
CITED2-201ENST00000367651 MAGEA9P43362 315 aa20.86■□□□□ 0.93
CITED2-201ENST00000367651 LRRC55Q6ZSA7 311 aa20.86■□□□□ 0.93
CITED2-201ENST00000367651 AMOTL1Q8IY63 956 aa20.86■□□□□ 0.93
CITED2-201ENST00000367651 PIGSQ96S52 555 aa20.86■□□□□ 0.93
CITED2-201ENST00000367651 NUDT12Q9BQG2 462 aa20.86■□□□□ 0.93
CITED2-201ENST00000367651 DEF6Q9H4E7 631 aa20.86■□□□□ 0.93
CITED2-201ENST00000367651 SLC37A4O43826 429 aa20.86■□□□□ 0.93
CITED2-201ENST00000367651 LDHBP07195 334 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
CITED2-201ENST00000367651 SLC1A4P43007 532 aa20.86■□□□□ 0.93
CITED2-201ENST00000367651 LRRC41Q15345 812 aa20.86■□□□□ 0.93
CITED2-201ENST00000367651 MAN2A1Q16706 1144 aa20.86■□□□□ 0.93
CITED2-201ENST00000367651 KCNK18Q7Z418 384 aa20.86■□□□□ 0.93
CITED2-201ENST00000367651 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
CITED2-201ENST00000367651 TLR10Q9BXR5 811 aa20.86■□□□□ 0.93
CITED2-201ENST00000367651 ANKRD2Q9GZV1 360 aa20.86■□□□□ 0.93
CITED2-201ENST00000367651 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
CITED2-201ENST00000367651 BUB1O43683 1085 aa20.85■□□□□ 0.93
CITED2-201ENST00000367651 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
CITED2-201ENST00000367651 MS4A14Q96JA4 679 aa20.85■□□□□ 0.93
CITED2-201ENST00000367651 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
CITED2-201ENST00000367651 HYOU1Q9Y4L1 999 aa20.85■□□□□ 0.93
CITED2-201ENST00000367651 POTEMA6NI47 508 aa20.85■□□□□ 0.93
CITED2-201ENST00000367651 PRLRP16471 622 aa20.85■□□□□ 0.93
CITED2-201ENST00000367651 NOP2P46087 812 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
CITED2-201ENST00000367651 IRAK1P51617 712 aa20.85■□□□□ 0.93
CITED2-201ENST00000367651 AMPD3Q01432 767 aa20.85■□□□□ 0.93
CITED2-201ENST00000367651 ITIH3Q06033 890 aa20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.6 ms